目的了解乙型流感Victoria株系(influenza B victoria lineage,Bv)疫情的分子基础,分析该株系流感的流行趋势。方法基于广东流感监测网络(GDISN)采用时空分布方法筛选流感Bv毒株,检测HA/NA基因核苷酸序列;采用MEGA 7.026、Datamonkey 2....目的了解乙型流感Victoria株系(influenza B victoria lineage,Bv)疫情的分子基础,分析该株系流感的流行趋势。方法基于广东流感监测网络(GDISN)采用时空分布方法筛选流感Bv毒株,检测HA/NA基因核苷酸序列;采用MEGA 7.026、Datamonkey 2.0、NetNGlyc 1.0 Server、SPSS 23.0软件等,分析其核苷酸/氨基酸序列的同源性、进化树、氨基酸与表位变异、糖基化位点和进化选择性等。结果广东2021年毒株较2020年毒株同源性呈现明显差异(P<0.01),2021年下半年毒株(17株)HA基因与疫苗株B/Austria/1359417/2021同源性高达(99.28±0.25)%。HA基因A表位(HN/Q、AT和RG)、B表位(PL和NK)和D表位(SN/D和TA)以及RBS位点(PQ)发生变异;2020年毒株呈Bv.1a.3株系特征,2021年毒株主要呈Bv.1a.3a.2株系特征。HA与NA基因潜在糖基化位点均无有意义改变;NA基因没有出现药敏位点变异;HA和NA基因氨基酸负向选择位点分别是73、138、437和497位点和179、321和335位点。结论广东2021年毒株HA和NA基因较2020年毒株均发生较明显变异,尤以2021年下半年毒株的HA基因变异明显;Bv毒株HA基因表位出现新变异,提示引发下一流感季节广泛局部流行的预警。展开更多
目的了解2021-2022年广东省病毒性腹泻监测哨点医院5岁以下腹泻患儿A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的流行病学和基因型别特征,为RVA疫苗研发提供依据。方法收集2021-2022年5岁以下儿童腹泻患者的粪便标本共1858份,采用ELISA方法检...目的了解2021-2022年广东省病毒性腹泻监测哨点医院5岁以下腹泻患儿A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的流行病学和基因型别特征,为RVA疫苗研发提供依据。方法收集2021-2022年5岁以下儿童腹泻患者的粪便标本共1858份,采用ELISA方法检测轮状病毒抗原,对阳性样本进一步测序分型。结果1858份样本中检出RVA阳性样本156例,阳性率8.4%;其中男女患儿的阳性率分别为8.76%、7.87%,男女性别阳性检出率差异无统计学意义;RVA感染在各年龄组检出率差异有统计学意义;RVA感染率从12月逐渐增高,次年1-4月达到高峰;2021年广东地区RVA主要流行株以G9P[8]亚型为主,国内少见的G8P[8]亚型呈上升趋势,2022年G8P[8]亚型检出率首次超越G9P[8]亚型。结论2021-2022年广东省5岁以下婴幼儿腹泻病例中RVA基因型别多样,G8P[8]亚型已成为主要流行基因型之一,仍需持续开展RVA基因型别监测以评估RVA相关疾病的风险。展开更多
文摘目的了解乙型流感Victoria株系(influenza B victoria lineage,Bv)疫情的分子基础,分析该株系流感的流行趋势。方法基于广东流感监测网络(GDISN)采用时空分布方法筛选流感Bv毒株,检测HA/NA基因核苷酸序列;采用MEGA 7.026、Datamonkey 2.0、NetNGlyc 1.0 Server、SPSS 23.0软件等,分析其核苷酸/氨基酸序列的同源性、进化树、氨基酸与表位变异、糖基化位点和进化选择性等。结果广东2021年毒株较2020年毒株同源性呈现明显差异(P<0.01),2021年下半年毒株(17株)HA基因与疫苗株B/Austria/1359417/2021同源性高达(99.28±0.25)%。HA基因A表位(HN/Q、AT和RG)、B表位(PL和NK)和D表位(SN/D和TA)以及RBS位点(PQ)发生变异;2020年毒株呈Bv.1a.3株系特征,2021年毒株主要呈Bv.1a.3a.2株系特征。HA与NA基因潜在糖基化位点均无有意义改变;NA基因没有出现药敏位点变异;HA和NA基因氨基酸负向选择位点分别是73、138、437和497位点和179、321和335位点。结论广东2021年毒株HA和NA基因较2020年毒株均发生较明显变异,尤以2021年下半年毒株的HA基因变异明显;Bv毒株HA基因表位出现新变异,提示引发下一流感季节广泛局部流行的预警。
文摘目的了解2021-2022年广东省病毒性腹泻监测哨点医院5岁以下腹泻患儿A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的流行病学和基因型别特征,为RVA疫苗研发提供依据。方法收集2021-2022年5岁以下儿童腹泻患者的粪便标本共1858份,采用ELISA方法检测轮状病毒抗原,对阳性样本进一步测序分型。结果1858份样本中检出RVA阳性样本156例,阳性率8.4%;其中男女患儿的阳性率分别为8.76%、7.87%,男女性别阳性检出率差异无统计学意义;RVA感染在各年龄组检出率差异有统计学意义;RVA感染率从12月逐渐增高,次年1-4月达到高峰;2021年广东地区RVA主要流行株以G9P[8]亚型为主,国内少见的G8P[8]亚型呈上升趋势,2022年G8P[8]亚型检出率首次超越G9P[8]亚型。结论2021-2022年广东省5岁以下婴幼儿腹泻病例中RVA基因型别多样,G8P[8]亚型已成为主要流行基因型之一,仍需持续开展RVA基因型别监测以评估RVA相关疾病的风险。
