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水稻小籽粒突变体smg5的表型鉴定和候选基因分析
1
作者
彭瀚平
郑馨媛
+8 位作者
刘鉴瑶
刘墨言
朱洪慧
李映姿
雷良喆
曹晨
张婷
李云峰
庄慧
《西南大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第7期33-46,共14页
水稻产量主要由单位面积有效穗数、每穗粒数和粒质量决定,其中粒质量主要受籽粒形态的影响。鉴定并克隆调控粒型的新基因,对完善粒型调控机制和提高水稻产量有重要意义。从籼稻保持系西大1B(XD1B)的甲基磺酸乙酯(ethylmethanesulfonate,...
水稻产量主要由单位面积有效穗数、每穗粒数和粒质量决定,其中粒质量主要受籽粒形态的影响。鉴定并克隆调控粒型的新基因,对完善粒型调控机制和提高水稻产量有重要意义。从籼稻保持系西大1B(XD1B)的甲基磺酸乙酯(ethylmethanesulfonate,EMS)诱变库中鉴定到1个小籽粒突变体(small grain 5,smg5),与野生型相比,smg5突变体籽粒极显著变小,植株矮化、穗型直立。组织细胞学分析显示:smg5突变体的小籽粒表型与颖壳细胞扩展和细胞增殖异常有关,导致细胞数目和面积减小。遗传分析表明:smg5突变体性状受1对隐性单基因控制。通过MutMap将SMG5定位在水稻第7条染色体上27.5~29.2 Mb中,结合重测序和PCR测序结果,发现突变体中LOC_Os07g47950的第5个外显子的第37位发生了C-T单碱基替换,导致氨基酸由苏氨酸(Thr)变为异亮氨酸(Ile)。该位点在F 2代突变表型和野生表型植株的突变率分別为100%和15%,因此可将SMG5的候选基因暂定为LOC_Os07g47950。
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关键词
水稻
小籽粒突变体
表型鉴定
基因定位
在线阅读
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职称材料
水稻小粒突变体smg2的表型鉴定和候选基因分析
被引量：
3
2
作者
朱洪慧
李映姿
+4 位作者
王成洋
高远卓
林泓
晏紫仪
李云峰
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期1-11,共11页
水稻产量是由单位面积有效穗数、每穗粒数以及千粒质量决定的,籽粒形态可以决定千粒质量进而影响水稻产量.报道了一个与水稻籽粒形态发育相关的突变体,来源于籼稻保持系西大1B的甲基磺酸乙酯(ethyl methane sulfonate,EMS)诱变群体.该...
水稻产量是由单位面积有效穗数、每穗粒数以及千粒质量决定的,籽粒形态可以决定千粒质量进而影响水稻产量.报道了一个与水稻籽粒形态发育相关的突变体,来源于籼稻保持系西大1B的甲基磺酸乙酯(ethyl methane sulfonate,EMS)诱变群体.该突变体表现为由细胞扩展和细胞增殖异常导致的籽粒变小,暂命名为水稻小粒突变体(small grain 2,smg2).遗传分析表明:smg 2突变体性状受1对隐性单基因控制,利用群体分离分析法(bulked segregation analysis,BSA)将SMG 2基因定位在第1染色体IN/DEL标记A-0.85和A-1.05之间,物理距离200 kb,在定位区间内含注释基因28个.PCR测序发现其中编号为LOC_Os01g02890的基因中第1个外显子的第153位碱基发生了单碱基缺失,造成编码框移码突变,从而导致蛋白翻译提前终止.因此,将LOC_Os 01 g 02890暂定为SMG 2的候选基因.
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关键词
水稻
籽粒
颖壳发育
基因定位
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职称材料
题名
水稻小籽粒突变体smg5的表型鉴定和候选基因分析
1
作者
彭瀚平
郑馨媛
刘鉴瑶
刘墨言
朱洪慧
李映姿
雷良喆
曹晨
张婷
李云峰
庄慧
机构
西南大学水稻研究所/农业科学研究院/转基因植物与安全控制重庆市重点实验室
西南大学宜宾研究院
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第7期33-46,共14页
基金
重庆市现代农业产业技术体系项目(CQMAITS202301)
四川科技局项目(2024NSFSC0321)
+2 种基金
四川省科技计划项目(2024JDRC0064)
国家级大学生创新创业训练计划项目(202410635113)
重庆市大学生创新创业训练计划项目(S202410635012)。
文摘
水稻产量主要由单位面积有效穗数、每穗粒数和粒质量决定,其中粒质量主要受籽粒形态的影响。鉴定并克隆调控粒型的新基因,对完善粒型调控机制和提高水稻产量有重要意义。从籼稻保持系西大1B(XD1B)的甲基磺酸乙酯(ethylmethanesulfonate,EMS)诱变库中鉴定到1个小籽粒突变体(small grain 5,smg5),与野生型相比,smg5突变体籽粒极显著变小,植株矮化、穗型直立。组织细胞学分析显示:smg5突变体的小籽粒表型与颖壳细胞扩展和细胞增殖异常有关,导致细胞数目和面积减小。遗传分析表明:smg5突变体性状受1对隐性单基因控制。通过MutMap将SMG5定位在水稻第7条染色体上27.5~29.2 Mb中,结合重测序和PCR测序结果,发现突变体中LOC_Os07g47950的第5个外显子的第37位发生了C-T单碱基替换,导致氨基酸由苏氨酸(Thr)变为异亮氨酸(Ile)。该位点在F 2代突变表型和野生表型植株的突变率分別为100%和15%,因此可将SMG5的候选基因暂定为LOC_Os07g47950。
关键词
水稻
小籽粒突变体
表型鉴定
基因定位
Keywords
rice(Oryza sativa L.)
small grain mutant
phenotype identification
gene mapping
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
水稻小粒突变体smg2的表型鉴定和候选基因分析
被引量：
3
2
作者
朱洪慧
李映姿
王成洋
高远卓
林泓
晏紫仪
李云峰
机构
西南大学水稻研究所/农业科学研究院/转基因植物与安全控制重庆市重点实验室
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期1-11,共11页
基金
国家自然科学基金项目(32172044).
文摘
水稻产量是由单位面积有效穗数、每穗粒数以及千粒质量决定的,籽粒形态可以决定千粒质量进而影响水稻产量.报道了一个与水稻籽粒形态发育相关的突变体,来源于籼稻保持系西大1B的甲基磺酸乙酯(ethyl methane sulfonate,EMS)诱变群体.该突变体表现为由细胞扩展和细胞增殖异常导致的籽粒变小,暂命名为水稻小粒突变体(small grain 2,smg2).遗传分析表明:smg 2突变体性状受1对隐性单基因控制,利用群体分离分析法(bulked segregation analysis,BSA)将SMG 2基因定位在第1染色体IN/DEL标记A-0.85和A-1.05之间,物理距离200 kb,在定位区间内含注释基因28个.PCR测序发现其中编号为LOC_Os01g02890的基因中第1个外显子的第153位碱基发生了单碱基缺失,造成编码框移码突变,从而导致蛋白翻译提前终止.因此,将LOC_Os 01 g 02890暂定为SMG 2的候选基因.
关键词
水稻
籽粒
颖壳发育
基因定位
Keywords
rice(Oryza sativa L.)
grain
development of glumes
gene mapping
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻小籽粒突变体smg5的表型鉴定和候选基因分析
彭瀚平
郑馨媛
刘鉴瑶
刘墨言
朱洪慧
李映姿
雷良喆
曹晨
张婷
李云峰
庄慧
《西南大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
水稻小粒突变体smg2的表型鉴定和候选基因分析
朱洪慧
李映姿
王成洋
高远卓
林泓
晏紫仪
李云峰
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
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