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基于转录组测序筛选蒙古冰草抗旱相关基因
被引量:
2
1
作者
樊璐
唐俊
+6 位作者
马琳
张志鹏
蒋庆雪
李俄仁措
马巧玲
王学敏
赵威
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期3344-3357,共14页
为挖掘蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)抗旱相关基因并探究蒙古冰草响应干旱胁迫分子机制,本研究以蒙古冰草为材料进行转录组测序。首先将不同生长期及干旱胁迫处理后的盆栽蒙古冰草组织按照根、茎、叶、花(穗)4类分别进行混样并...
为挖掘蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)抗旱相关基因并探究蒙古冰草响应干旱胁迫分子机制,本研究以蒙古冰草为材料进行转录组测序。首先将不同生长期及干旱胁迫处理后的盆栽蒙古冰草组织按照根、茎、叶、花(穗)4类分别进行混样并利用三代全长转录组测序技术建立蒙古冰草转录本参考序列数据库,共获得26027条转录本,包含25578个基因,利用BlastX在KEGG,KOG,Nr,Swissprot等数据库中进行比对注释,共有25453个转录本得到注释。其次利用二代转录组测序技术对干旱胁迫处理前后水培蒙古冰草幼苗进行测序,发现干旱胁迫处理2 h,6 h后与处理前相比分别有2669个,3668个差异表达基因。此外,根据转录组及荧光定量PCR验证结果,发现基因ERF053,ERF055,NAC100,bZIP23,ERF5和NAM-B1在干旱处理后表达量较高且均上调可能是抗旱调控关键基因,为后续蒙古冰草抗旱相关候选基因克隆及功能验证奠定了基础。
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关键词
蒙古冰草
干旱
三代全长转录组
二代转录组测序
转录因子
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职称材料
叶绿体基因编辑技术:进展与展望
被引量:
3
2
作者
原明星
尹康权
+2 位作者
李俄仁措
尚海忠
杜芳
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2024年第6期126-134,共9页
叶绿体是植物进行光合作用,参与多个代谢途径和免疫反应的重要场所。叶绿体基因组非常小,只有100多个基因,但对植物生长发育具有重要意义。本文首先总结了叶绿体的起源、结构与功能及叶绿体基因组研究的最新进展。其次,梳理了同源重组...
叶绿体是植物进行光合作用,参与多个代谢途径和免疫反应的重要场所。叶绿体基因组非常小,只有100多个基因,但对植物生长发育具有重要意义。本文首先总结了叶绿体的起源、结构与功能及叶绿体基因组研究的最新进展。其次,梳理了同源重组、碱基编辑两种叶绿体基因编辑技术,重点介绍了碱基编辑技术中的胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器,认为相较于传统的同源重组技术,碱基编辑技术可以针对特定靶位点进行定向修饰,单次选择就能获得同质转化植株,且可以不用保留外源DNA片段,实现了非转基因的基因编辑。最后展望了叶绿体基因编辑技术的广阔发展前景,以期促进精准高效的叶绿体基因编辑工具开发,为研究叶绿体基因功能以及加速对叶绿体的合理利用开辟新思路。
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关键词
叶绿体
叶绿体基因组
基因编辑
同源重组
碱基编辑
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职称材料
题名
基于转录组测序筛选蒙古冰草抗旱相关基因
被引量:
2
1
作者
樊璐
唐俊
马琳
张志鹏
蒋庆雪
李俄仁措
马巧玲
王学敏
赵威
机构
河南科技大学农学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
青海省三江集团有限责任公司
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期3344-3357,共14页
基金
内蒙古自治区种业科技创新重大示范工程“揭榜挂帅”项目(2022 JBGS0014)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-34)资助。
文摘
为挖掘蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)抗旱相关基因并探究蒙古冰草响应干旱胁迫分子机制,本研究以蒙古冰草为材料进行转录组测序。首先将不同生长期及干旱胁迫处理后的盆栽蒙古冰草组织按照根、茎、叶、花(穗)4类分别进行混样并利用三代全长转录组测序技术建立蒙古冰草转录本参考序列数据库,共获得26027条转录本,包含25578个基因,利用BlastX在KEGG,KOG,Nr,Swissprot等数据库中进行比对注释,共有25453个转录本得到注释。其次利用二代转录组测序技术对干旱胁迫处理前后水培蒙古冰草幼苗进行测序,发现干旱胁迫处理2 h,6 h后与处理前相比分别有2669个,3668个差异表达基因。此外,根据转录组及荧光定量PCR验证结果,发现基因ERF053,ERF055,NAC100,bZIP23,ERF5和NAM-B1在干旱处理后表达量较高且均上调可能是抗旱调控关键基因,为后续蒙古冰草抗旱相关候选基因克隆及功能验证奠定了基础。
关键词
蒙古冰草
干旱
三代全长转录组
二代转录组测序
转录因子
Keywords
Agropyron mongolicum Keng
Drought
Third-generation full-length transcriptome sequencing
Second-generation transcriptome sequencing
Transcription factor
分类号
S543.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
叶绿体基因编辑技术:进展与展望
被引量:
3
2
作者
原明星
尹康权
李俄仁措
尚海忠
杜芳
机构
北京林业大学生态与自然保护学院
北京林业大学草业与草原学院
青海省三江集团有限责任公司
北京市房山区上方山(林场)国家森林公园管理处
出处
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2024年第6期126-134,共9页
基金
牧草与特色作物生物学教育部重点实验室开放课题资助(FECBOF202100)
草种业核心技术攻关项目(SJCZFY2022-1,SJCZFY2022-3)
内蒙古自治区种业揭榜挂帅项目(2022JBGS0020)。
文摘
叶绿体是植物进行光合作用,参与多个代谢途径和免疫反应的重要场所。叶绿体基因组非常小,只有100多个基因,但对植物生长发育具有重要意义。本文首先总结了叶绿体的起源、结构与功能及叶绿体基因组研究的最新进展。其次,梳理了同源重组、碱基编辑两种叶绿体基因编辑技术,重点介绍了碱基编辑技术中的胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器,认为相较于传统的同源重组技术,碱基编辑技术可以针对特定靶位点进行定向修饰,单次选择就能获得同质转化植株,且可以不用保留外源DNA片段,实现了非转基因的基因编辑。最后展望了叶绿体基因编辑技术的广阔发展前景,以期促进精准高效的叶绿体基因编辑工具开发,为研究叶绿体基因功能以及加速对叶绿体的合理利用开辟新思路。
关键词
叶绿体
叶绿体基因组
基因编辑
同源重组
碱基编辑
Keywords
Chloroplast
Chloroplast genome
Gene editing
Homologous recombination
Base editing
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序筛选蒙古冰草抗旱相关基因
樊璐
唐俊
马琳
张志鹏
蒋庆雪
李俄仁措
马巧玲
王学敏
赵威
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
叶绿体基因编辑技术:进展与展望
原明星
尹康权
李俄仁措
尚海忠
杜芳
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2024
3
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职称材料
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