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题名黄瓜MTP基因家族分析及重金属胁迫下表达特征
被引量：3
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作者
朱雄萌
蒋昕晨
席克勇
杨静
尹军良
朱永兴
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机构
长江大学园艺园林学院
长江大学农学院
重庆工程职业技术学院
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期933-943,共11页
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基金
湖北省教育厅科学技术研究项目(D20201301)。
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文摘
该研究以模式物种(拟南芥、水稻、玉米)的MTP序列作为种子序列,对黄瓜MTP基因家族(CsMTP)成员进行了系统鉴定和分析;并以Zn^(2+)、Cd^(2+)、Mn^(2+)、Cu^(2+)、Fe^(2+)和Mo^(2+)处理后的黄瓜叶片和根系为材料,对CsMTP响应金属离子的表达模式进行了研究,为探究该基因家族对黄瓜重金属胁迫调控机制提供理论依据。结果表明:(1)黄瓜含有10个CsMTP,可进一步分为Fe/Zn-CDF(2个)、Mn-CDF(3个)和Zn-CDF(5个)三个亚家族,Mn-CDF成员含有保守基序DxxxD,Zn-CDF和Fe/Zn-CDFs成员含有保守基序HxxxD,大部分CsMTP成员含有6个跨膜结构域。(2)RNA-seq数据分析表明,CsMTP具备组织特异性表达和响应不同处理的特征,CsMTP11、CsMTP3和CsMTP7在不同组织和处理下普遍高水平表达,且外源化学试剂处理可诱导同一基因的不同表达模式。(3)RT-PCR分析表明,CsMTPs可被不同重金属离子诱导差异表达,包括不是MTP家族潜在底物的重金属。
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关键词
黄瓜
重金属胁迫
CDF家族
生物信息学
表达模式分析
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Keywords
cucumber
heavy metal stress
cation diffusion facilitator family
bioinformatics
expression pattern analysis
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分类号
Q786
[生物学—分子生物学]
Q789
[生物学—分子生物学]
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