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肿瘤相关抗原CEA的B细胞表位预测
被引量：
3
1
作者
王鹏飞
欧琴
+2 位作者
朱珊丽
朱冠保
张丽芳
《生物医学工程与临床》
CAS
2007年第5期402-405,共4页
目的分析癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)的B细胞表位,为肿瘤治疗提供理论基础。方法以CEA的完整氨基酸序列为研究基础,采用Hopp&Woods的亲水性方案,Emini表面可及性方案和Jameson-Wolf抗原指数方案,辅以CEA的二级结构及其...
目的分析癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)的B细胞表位,为肿瘤治疗提供理论基础。方法以CEA的完整氨基酸序列为研究基础,采用Hopp&Woods的亲水性方案,Emini表面可及性方案和Jameson-Wolf抗原指数方案,辅以CEA的二级结构及其柔性区域分析,预测CEA的B细胞表位。结果预测的B细胞表位可能位于CEA的N端第150￣160、168￣172、207￣211、332￣338、372￣377、467￣472、485￣490、507￣516、580￣584区段。结论应用多参数预测CEA的B细胞表位,可进一步用于CEA相关肿瘤治疗性表位疫苗的分子设计和研究。
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关键词
癌胚抗原
B细胞表位
预测
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职称材料
基于生物信息学方法的沙眼衣原体主要外膜蛋白免疫优势表位预测及分析
被引量：
1
2
作者
李明洋
徐远久
+4 位作者
鲁小龙
张雷
苏惠婷
朱珊丽
张友秀
《山东医药》
CAS
2022年第20期24-29,共6页
目的预测和分析沙眼衣原体主要外膜蛋白(MOMP)的免疫优势表位。方法以UniProt蛋白质数据库中检索CtMOMP的氨基酸序列为基础,针对MOMP的理化性质、二级结构、亲水性参数、表面可及性参数、极性参数、抗原性和柔韧性参数,预测其B细胞表位;...
目的预测和分析沙眼衣原体主要外膜蛋白(MOMP)的免疫优势表位。方法以UniProt蛋白质数据库中检索CtMOMP的氨基酸序列为基础,针对MOMP的理化性质、二级结构、亲水性参数、表面可及性参数、极性参数、抗原性和柔韧性参数,预测其B细胞表位;用SYFPEITHI、IEDB及NetCTI 1.2 server预测MOMP的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位;用RANKPEP及SYFPEITHI预测MOMP的辅助T细胞(Th)表位,筛选分值共同较高的多肽片段作为候选表位。应用GalaxyWEB对MOMP进行三维结构建模分析。结果MOMP由393个氨基酸残基组成,以无规则卷曲及α螺旋为主;推测MOMP的B细胞表位位于N端42~52 aa、161~179 aa、259~265 aa和349~358 aa区段;其CTL表位主要集中于近C端,且以HLA-A*02:01、HLA-A*03限制性表位为主;Th表位各表型候选表位肽数目均较多。结论沙眼衣原体MOMP含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位,其免疫优势表位主要位于N端42~65 aa、155~185 aa区段和C端342~359 aa区段。
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关键词
沙眼衣原体
主要外膜蛋白
抗原表位
生物信息学
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职称材料
题名
肿瘤相关抗原CEA的B细胞表位预测
被引量：
3
1
作者
王鹏飞
欧琴
朱珊丽
朱冠保
张丽芳
机构
温州医学院附属第一医院胃肠外科
温州医学院微生物学和免疫学教研室
出处
《生物医学工程与临床》
CAS
2007年第5期402-405,共4页
基金
浙江省自然科学基金资助项目(Y204055)
文摘
目的分析癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)的B细胞表位,为肿瘤治疗提供理论基础。方法以CEA的完整氨基酸序列为研究基础,采用Hopp&Woods的亲水性方案,Emini表面可及性方案和Jameson-Wolf抗原指数方案,辅以CEA的二级结构及其柔性区域分析,预测CEA的B细胞表位。结果预测的B细胞表位可能位于CEA的N端第150￣160、168￣172、207￣211、332￣338、372￣377、467￣472、485￣490、507￣516、580￣584区段。结论应用多参数预测CEA的B细胞表位,可进一步用于CEA相关肿瘤治疗性表位疫苗的分子设计和研究。
关键词
癌胚抗原
B细胞表位
预测
Keywords
carcinoembryonic antigen（CEA）
B cell epitope
prediction
分类号
R730.5 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于生物信息学方法的沙眼衣原体主要外膜蛋白免疫优势表位预测及分析
被引量：
1
2
作者
李明洋
徐远久
鲁小龙
张雷
苏惠婷
朱珊丽
张友秀
机构
四川大学华西广安医院检验科
温州医科大学分子病毒与免疫研究所微生物学与免疫学教研室
四川大学华西广安医院外围手术室
出处
《山东医药》
CAS
2022年第20期24-29,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31700160)
温州市科技局资助项目(Y20170011)。
文摘
目的预测和分析沙眼衣原体主要外膜蛋白(MOMP)的免疫优势表位。方法以UniProt蛋白质数据库中检索CtMOMP的氨基酸序列为基础,针对MOMP的理化性质、二级结构、亲水性参数、表面可及性参数、极性参数、抗原性和柔韧性参数,预测其B细胞表位;用SYFPEITHI、IEDB及NetCTI 1.2 server预测MOMP的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位;用RANKPEP及SYFPEITHI预测MOMP的辅助T细胞(Th)表位,筛选分值共同较高的多肽片段作为候选表位。应用GalaxyWEB对MOMP进行三维结构建模分析。结果MOMP由393个氨基酸残基组成,以无规则卷曲及α螺旋为主;推测MOMP的B细胞表位位于N端42~52 aa、161~179 aa、259~265 aa和349~358 aa区段;其CTL表位主要集中于近C端,且以HLA-A*02:01、HLA-A*03限制性表位为主;Th表位各表型候选表位肽数目均较多。结论沙眼衣原体MOMP含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位,其免疫优势表位主要位于N端42~65 aa、155~185 aa区段和C端342~359 aa区段。
关键词
沙眼衣原体
主要外膜蛋白
抗原表位
生物信息学
Keywords
Chlamydia trachomatis
major outer membrane protein
epitope
bioinformatics
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肿瘤相关抗原CEA的B细胞表位预测
王鹏飞
欧琴
朱珊丽
朱冠保
张丽芳
《生物医学工程与临床》
CAS
2007
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于生物信息学方法的沙眼衣原体主要外膜蛋白免疫优势表位预测及分析
李明洋
徐远久
鲁小龙
张雷
苏惠婷
朱珊丽
张友秀
《山东医药》
CAS
2022
1
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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