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题名一种鉴别栽培柿品种SNP标记的新方法
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作者
梁晋军
朱溯远
张宇琴
张鹏飞
温鹏飞
杨运良
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机构
山西农业大学园艺学院
山西农业大学棉花研究所
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期160-167,共8页
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基金
山西农业大学博士科研启动项目(2021BQ32)
山西农业大学生物育种工程项目(YZGC113)
+2 种基金
山西省青年科学研究项目(20210302124067)
运城市科学技术局现代农业项目(YCKJ-2021021,YCKJ-2022048)
运城市科学技术局基础项目(YCKJ-2021043)。
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文摘
【目的】为了鉴别栽培柿品种间的遗传差异,开发一种基于核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA internally transcribed spacer)序列简单、高效的SNP分子标记新方法,为种质的收集、利用及推广应用提供参考。【方法】以18种六倍体栽培柿品种叶片为试材,对其ITS区进行扩增测序,并分析序列差异,最后用Sau96 I限制性内切酶对151处杂合位点进行酶切验证。【结果】18份柿品种ITS长度均为730 bp,共存在6个杂合位点,分别在151、168、205、278、279和622 bp处。六倍体柿杂合位点处碱基峰图面积比例存在一定的规律,即C∶T=2∶1、C∶T=1∶1、C∶T=1∶2和A∶G=1∶1,利用出现的杂合位点及其峰图面积比例规律差异将18份栽培柿品种分成11类。【结论】151处位点的酶切结果验证了酶切产物浓度与峰图面积比例一致。这种基于nrDNAITS序列SNP分子标记的新方法能将18份栽培柿品种分成11类。
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关键词
栽培柿
nrDNAITS
SNP
杂合位点
遗传差异
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Keywords
cultivated persimmon
nrDNA ITS
SNP
heterozygous site
genetic difference
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分类号
S665.2
[农业科学—果树学]
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