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miR-181b在慢性淋巴细胞白血病患者中的表达及其靶基因的预测
被引量：
3
1
作者
寇珍
刘虹
+14 位作者
王一淳
黄琴
王增胜
古再丽努尔
郎涛
聂玉玲
安利
阿孜古丽
木合塔拜尔
张晓燕
富玲
艾何买江
毛敏
王晓敏
李燕
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期808-814,共7页
目的:探讨miR-181b在慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者CD19+B淋巴细胞中的表达水平,分析其表达与CLL预后关系,并利用生物信息学预测miR-181b在CLL中的潜在靶基因。方法:选取2013年6月至2018年6月在新疆自治区人民医院诊治的CLL患者84例、并...
目的:探讨miR-181b在慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者CD19+B淋巴细胞中的表达水平,分析其表达与CLL预后关系,并利用生物信息学预测miR-181b在CLL中的潜在靶基因。方法:选取2013年6月至2018年6月在新疆自治区人民医院诊治的CLL患者84例、并选取健康者20例为对照组。应用磁珠分选CLL患者和对照组外周血CD19+B淋巴细胞后进行RNA提取,检测miR-181b的表达水平,分析其在不同IPI分组中表达差异,探讨miR-181b表达水平与CLL患者PFS相关性。使用网上数据库及文献预测miR-181b靶基因,对候选靶基因进行基因注释分析及相关信号通路分析。结果:miR-181b在CLL患者中表达显著低于对照组(P<0.01)。miR-181b在低危组的表达水平高于高危组和极高危组(P<0.05),但在低危组与中危组间表达无差异(P=1.00),中危组中miR-181b的表达水平高于高危组和极高危组(P<0.05),但在高危组与极高危组间表达无差异。ROC曲线结果显示,曲线下面积(AUC)为0.792(P<0.01),由此显示,miR-181b表达水平处于分界值0.279时,具有较好的敏感性(62.9%)和特异性(91.8%)。生存分析结果提示,与高表达组相比,miR-181b低表达CLL患者具有较差的PFS(log-rank:P=0.047)。使用starBase、Targetscan和PicTar数据库进行靶基因预测,结合文献报道,与血液疾病相关的靶基因有CARD11、ZFP36L1、RUNX1、NR4A3、ATP1B1、PUM1和PLAG1,其中上调的CARD11、ZFP36L1通过促进细胞增殖、抑制细胞衰老参与淋巴系统肿瘤形成。结论:miR-181b在CLL患者中的表达水平明显低于健康对照组,且miR-181b低表达与CLL不良预后有关。通过生物信息学预测并结合文献报道,推测CARD11及ZFP36L1可能作为miR-181b的靶基因参与CLL疾病发生发展,该结果还需要进一步实验进行验证。
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关键词
慢性淋巴细胞白血病
miR-181b
靶基因
生物信息学
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职称材料
CpG-寡核苷酸免疫刺激法在慢性淋巴细胞白血病遗传学研究中的应用
被引量：
1
2
作者
买地娜·艾尔肯
刘虹
+15 位作者
王一林
王一淳
黄琴
王增胜
古再丽努尔
郎涛
聂玉玲
安利
阿孜古丽
木合塔拜尔
张晓燕
富玲
艾何买江
毛敏
王晓敏
李燕
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期470-475,共6页
目的:探索CpG-寡核苷酸(CpG-oligodeoxynucleotide,CpG-ODN)免疫刺激法在慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)细胞染色体培养中的价值,对比国内外相关研究的差异,进一步提高CLL核型培养成功率及异常核型检出率。方法...
目的:探索CpG-寡核苷酸(CpG-oligodeoxynucleotide,CpG-ODN)免疫刺激法在慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)细胞染色体培养中的价值,对比国内外相关研究的差异,进一步提高CLL核型培养成功率及异常核型检出率。方法:收集82例CLL患者的骨髓标本,分别应用植物血凝素(PHA)、CpG-寡核苷酸联合白介素-2(CpG-ODN DSP30+IL-2)刺激培养72 h后收获细胞,制备染色体,进行常规细胞遗传学(conventional cytogenetics,CC)分析。同时应用D13S25、Rb1、ATM、p53和CSP12探针进行间期荧光原位杂交(interphase fluorescence in situ hybridization,iFISH)检测。比较2种细胞刺激剂进行染色体培养及iFISH检测结果的差异性。结果:PHA与CpG-ODN DSP30+IL-22种免疫刺激法核型培养成功率(可分析分裂相t≥20个)分别为90.2%(74例)和68.3%(56例),异常核型检出率分别为13.5%(10例)和46.4%(26例)。PHA组核型培养成功率显著高于CpG-ODN DSP30+IL-2组(P=0.01),而CpG-ODN DSP30+IL-2组异常核型检出率显著高于PHA组(P=0.003)。iFISH异常核型检出率(74.4%,61例)显著高于CpG-ODN DSP30+IL-2组(P=0.000)。iFISH检测能验证CC分析检出的异常。结论:应用CpG-ODN DSP30+IL-2免疫刺激法培养CLL细胞,可提高异常核型检出率,特别是能检出提示预后差的各种易位。
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关键词
慢性淋巴细胞白血病
CpG一寡脱氧核苷酸
染色体
细胞遗传学
间期荧光原位杂交
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职称材料
题名
miR-181b在慢性淋巴细胞白血病患者中的表达及其靶基因的预测
被引量：
3
1
作者
寇珍
刘虹
王一淳
黄琴
王增胜
古再丽努尔
郎涛
聂玉玲
安利
阿孜古丽
木合塔拜尔
张晓燕
富玲
艾何买江
毛敏
王晓敏
李燕
机构
石河子大学医学院
新疆维吾尔自治区人民医院血液病科
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期808-814,共7页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2017D01C116)。
文摘
目的:探讨miR-181b在慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者CD19+B淋巴细胞中的表达水平,分析其表达与CLL预后关系,并利用生物信息学预测miR-181b在CLL中的潜在靶基因。方法:选取2013年6月至2018年6月在新疆自治区人民医院诊治的CLL患者84例、并选取健康者20例为对照组。应用磁珠分选CLL患者和对照组外周血CD19+B淋巴细胞后进行RNA提取,检测miR-181b的表达水平,分析其在不同IPI分组中表达差异,探讨miR-181b表达水平与CLL患者PFS相关性。使用网上数据库及文献预测miR-181b靶基因,对候选靶基因进行基因注释分析及相关信号通路分析。结果:miR-181b在CLL患者中表达显著低于对照组(P<0.01)。miR-181b在低危组的表达水平高于高危组和极高危组(P<0.05),但在低危组与中危组间表达无差异(P=1.00),中危组中miR-181b的表达水平高于高危组和极高危组(P<0.05),但在高危组与极高危组间表达无差异。ROC曲线结果显示,曲线下面积(AUC)为0.792(P<0.01),由此显示,miR-181b表达水平处于分界值0.279时,具有较好的敏感性(62.9%)和特异性(91.8%)。生存分析结果提示,与高表达组相比,miR-181b低表达CLL患者具有较差的PFS(log-rank:P=0.047)。使用starBase、Targetscan和PicTar数据库进行靶基因预测,结合文献报道,与血液疾病相关的靶基因有CARD11、ZFP36L1、RUNX1、NR4A3、ATP1B1、PUM1和PLAG1,其中上调的CARD11、ZFP36L1通过促进细胞增殖、抑制细胞衰老参与淋巴系统肿瘤形成。结论:miR-181b在CLL患者中的表达水平明显低于健康对照组,且miR-181b低表达与CLL不良预后有关。通过生物信息学预测并结合文献报道,推测CARD11及ZFP36L1可能作为miR-181b的靶基因参与CLL疾病发生发展,该结果还需要进一步实验进行验证。
关键词
慢性淋巴细胞白血病
miR-181b
靶基因
生物信息学
Keywords
chronic lymphocytic leukemia
miR-181b
target genes
bioinformatics
分类号
R733.72 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
CpG-寡核苷酸免疫刺激法在慢性淋巴细胞白血病遗传学研究中的应用
被引量：
1
2
作者
买地娜·艾尔肯
刘虹
王一林
王一淳
黄琴
王增胜
古再丽努尔
郎涛
聂玉玲
安利
阿孜古丽
木合塔拜尔
张晓燕
富玲
艾何买江
毛敏
王晓敏
李燕
机构
新疆维吾尔自治区人民医院血液病科
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期470-475,共6页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(107D01C116)。
文摘
目的:探索CpG-寡核苷酸(CpG-oligodeoxynucleotide,CpG-ODN)免疫刺激法在慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)细胞染色体培养中的价值,对比国内外相关研究的差异,进一步提高CLL核型培养成功率及异常核型检出率。方法:收集82例CLL患者的骨髓标本,分别应用植物血凝素(PHA)、CpG-寡核苷酸联合白介素-2(CpG-ODN DSP30+IL-2)刺激培养72 h后收获细胞,制备染色体,进行常规细胞遗传学(conventional cytogenetics,CC)分析。同时应用D13S25、Rb1、ATM、p53和CSP12探针进行间期荧光原位杂交(interphase fluorescence in situ hybridization,iFISH)检测。比较2种细胞刺激剂进行染色体培养及iFISH检测结果的差异性。结果:PHA与CpG-ODN DSP30+IL-22种免疫刺激法核型培养成功率(可分析分裂相t≥20个)分别为90.2%(74例)和68.3%(56例),异常核型检出率分别为13.5%(10例)和46.4%(26例)。PHA组核型培养成功率显著高于CpG-ODN DSP30+IL-2组(P=0.01),而CpG-ODN DSP30+IL-2组异常核型检出率显著高于PHA组(P=0.003)。iFISH异常核型检出率(74.4%,61例)显著高于CpG-ODN DSP30+IL-2组(P=0.000)。iFISH检测能验证CC分析检出的异常。结论:应用CpG-ODN DSP30+IL-2免疫刺激法培养CLL细胞,可提高异常核型检出率,特别是能检出提示预后差的各种易位。
关键词
慢性淋巴细胞白血病
CpG一寡脱氧核苷酸
染色体
细胞遗传学
间期荧光原位杂交
Keywords
chronic lymphocytic leukemia
CpG-oligodeoxynucleotides
chromosome
cytogenetics
interphase fluorescence in situ hybridization
分类号
R733.72 [医药卫生—肿瘤]
R394.2 [医药卫生—医学遗传学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
miR-181b在慢性淋巴细胞白血病患者中的表达及其靶基因的预测
寇珍
刘虹
王一淳
黄琴
王增胜
古再丽努尔
郎涛
聂玉玲
安利
阿孜古丽
木合塔拜尔
张晓燕
富玲
艾何买江
毛敏
王晓敏
李燕
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
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职称材料
2
CpG-寡核苷酸免疫刺激法在慢性淋巴细胞白血病遗传学研究中的应用
买地娜·艾尔肯
刘虹
王一林
王一淳
黄琴
王增胜
古再丽努尔
郎涛
聂玉玲
安利
阿孜古丽
木合塔拜尔
张晓燕
富玲
艾何买江
毛敏
王晓敏
李燕
《中国实验血液学杂志》
CAS
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