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ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中高表达:基于Oncomine数据库及生物信息学方法
被引量:
6
1
作者
王卉
陈学平
+4 位作者
陈运
曹颖诗
陈瑶
刘国炳
黄莉萍
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期555-561,共7页
目的探讨ENTPD5在上皮性卵巢癌中的表达及临床价值。方法通过Oncomine、TCGA数据库对ENTPD5在上皮性卵巢癌中的表达水平进行分析,UALCAN数据库分析ENTPD5表达水平与上皮性卵巢癌患者临床性状的相关性,基因富集分析(GSEA)软件分析ENTPD5...
目的探讨ENTPD5在上皮性卵巢癌中的表达及临床价值。方法通过Oncomine、TCGA数据库对ENTPD5在上皮性卵巢癌中的表达水平进行分析,UALCAN数据库分析ENTPD5表达水平与上皮性卵巢癌患者临床性状的相关性,基因富集分析(GSEA)软件分析ENTPD5在上皮性卵巢癌中的可能作用机制,CIBERSORT包探讨ENTPD5的表达量与免疫浸润的相关性。为进一步验证生物信息挖掘结果,RT-qPCR及Western blot检测23例上皮性卵巢癌组织和15例正常卵巢组织中ENTPD5的表达水平,免疫组化法检测50例上皮性卵巢癌石蜡样本和6例正常卵巢石蜡样本中ENTPD5的表达水平。结果Oncomine、TCGA数据库发现与正常卵巢组织相比,ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中表达显著增高(P<0.05),ENTPD5表达水平与上皮性卵巢癌患者生存呈负相关(P<0.05)。UALCAN数据库发现ENTPD5表达水平与患者年龄相关。GSEA软件分析发现ENTPD5参与ABC转运蛋白、WNT信号通路、胰岛素信号通路以及糖降解等过程,并在其中高度富集。CIBERSORT包分析显示ENTPD5表达水平与NK细胞、肥大细胞及嗜酸性粒细胞的含量呈负相关(P<0.05)。RT-qPCR结果提示ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中的表达水平(2.592±0.339)显著高于其在正常卵巢组织表达水平(1.00±0.123)(t=4.312,P<0.01)。Western blot结果提示上皮性卵巢癌组织中的ENTPD5表达显著高于正常卵巢组织(P<0.05)。免疫组化结果提示ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中高表达。结论ENTPD5在上皮性卵巢癌中高表达,其可能通过参与细胞多种功能过程以及细胞免疫浸润,参与上皮性卵巢癌的发生发展。
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关键词
ENTPD5基因
卵巢癌
生存
生物信息学
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题名
ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中高表达:基于Oncomine数据库及生物信息学方法
被引量:
6
1
作者
王卉
陈学平
陈运
曹颖诗
陈瑶
刘国炳
黄莉萍
机构
南方医科大学第一临床医学院
南方医科大学南方医院妇产科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期555-561,共7页
基金
国家自然科学基金青年科学基金(81703078)
广东省科技计划项目(2017A010105025)。
文摘
目的探讨ENTPD5在上皮性卵巢癌中的表达及临床价值。方法通过Oncomine、TCGA数据库对ENTPD5在上皮性卵巢癌中的表达水平进行分析,UALCAN数据库分析ENTPD5表达水平与上皮性卵巢癌患者临床性状的相关性,基因富集分析(GSEA)软件分析ENTPD5在上皮性卵巢癌中的可能作用机制,CIBERSORT包探讨ENTPD5的表达量与免疫浸润的相关性。为进一步验证生物信息挖掘结果,RT-qPCR及Western blot检测23例上皮性卵巢癌组织和15例正常卵巢组织中ENTPD5的表达水平,免疫组化法检测50例上皮性卵巢癌石蜡样本和6例正常卵巢石蜡样本中ENTPD5的表达水平。结果Oncomine、TCGA数据库发现与正常卵巢组织相比,ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中表达显著增高(P<0.05),ENTPD5表达水平与上皮性卵巢癌患者生存呈负相关(P<0.05)。UALCAN数据库发现ENTPD5表达水平与患者年龄相关。GSEA软件分析发现ENTPD5参与ABC转运蛋白、WNT信号通路、胰岛素信号通路以及糖降解等过程,并在其中高度富集。CIBERSORT包分析显示ENTPD5表达水平与NK细胞、肥大细胞及嗜酸性粒细胞的含量呈负相关(P<0.05)。RT-qPCR结果提示ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中的表达水平(2.592±0.339)显著高于其在正常卵巢组织表达水平(1.00±0.123)(t=4.312,P<0.01)。Western blot结果提示上皮性卵巢癌组织中的ENTPD5表达显著高于正常卵巢组织(P<0.05)。免疫组化结果提示ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中高表达。结论ENTPD5在上皮性卵巢癌中高表达,其可能通过参与细胞多种功能过程以及细胞免疫浸润,参与上皮性卵巢癌的发生发展。
关键词
ENTPD5基因
卵巢癌
生存
生物信息学
Keywords
ENTPD5 gene
epithelial ovarian cancer
survival
bioinformatics
分类号
R737.31 [医药卫生—肿瘤]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
ENTPD5在上皮性卵巢癌组织中高表达:基于Oncomine数据库及生物信息学方法
王卉
陈学平
陈运
曹颖诗
陈瑶
刘国炳
黄莉萍
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
6
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