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题名细角螺微卫星DNA富集文库构建及特征分析
被引量：2
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作者
李清荟
陈晓姣
黎中宝
曹媛钰
陈丽娜
戴刚
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机构
集美大学水产学院
福建省海洋渔业资源与生态环境重点实验室
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出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期1-5,共5页
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基金
集美大学创新团队基金项目(2010A004)
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文摘
采用生物素磁珠富集法,用生物素标记的(GT)15和(CT)15两种探针与细角螺基因组MseI酶切的300～1200bp片段杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段。最后将磁珠捕获到的重复序列与PMD19-T载体连接后克隆到DH5α中构建微卫星基因组文库。通过PCR检测出354个阳性克隆,从中随机选取248个片段大于500bp的阳性克隆进行测序,结果显示,在220个成功测序的阳性克隆中共获得278个微卫星序列,其中完美型171个,占61.5%;非完美型81个,占29.1%;复合型26个,占9.4%。除探针使用的GT和CT的重复序列外,还筛选到三碱基GTT、TGG、GAA、CAA;四碱基TCTA、ACAG、TAGA、GTGA、GTCT、GATA及五碱基TTTTG的重复序列。在278条序列中共有82条可以设计引物。
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关键词
细角螺(Hemifusus
ternatanus)
磁珠富集
微卫星
构建
DNA文库
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Keywords
Hemifusus ternatanus
enrichment by magnetic beads
microsatellite DNA
construction
DNA library
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分类号
S917
[农业科学—水产科学]
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