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高坡猪肌肉生长抑制素基因多态性及其与肉质性状的相关性分析 被引量:14
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作者 易恒洁 李辉 +3 位作者 赵忠海 杨华婷 彭邦星 王玉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第4期1102-1107,共6页
为了探讨肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的多态性对高坡猪肉质性状(水分、粗脂肪、粗蛋白质、粗灰分、眼肌面积、大理石纹、pH、肉色、嫩度、滴水损失、失水率)的影响,试验以MSTN基因作为肉质性状候选基因,以10月龄的50头高坡猪为... 为了探讨肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的多态性对高坡猪肉质性状(水分、粗脂肪、粗蛋白质、粗灰分、眼肌面积、大理石纹、pH、肉色、嫩度、滴水损失、失水率)的影响,试验以MSTN基因作为肉质性状候选基因,以10月龄的50头高坡猪为研究对象,采用PCR扩增产物直接测序的方法对高坡猪MSTN基因3个外显子的单核苷酸多态性(SNP)进行研究,运用SPSS 20.0软件分析MSTN基因SNP与肉质性状的关联性。结果表明,仅在高坡猪MSTN基因第3外显子63bp处检测到1个C/T突变位点,该突变为同义突变,未引起编码氨基酸的改变。基因型分析发现,仅有3个个体在该位点发生突变,CC基因型为优势基因型,C为优势等位基因,无TT纯合基因型。经χ~2适合性检验分析,该SNP在研究群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。群体遗传参数分析发现,C63T标记位点的杂合度(He)相对较低,表明其在高坡猪群体中的变异较小;就多态信息含量(PIC)而言,该位点属于低度多态(PIC<0.25),说明该遗传标记能够提供少量的遗传信息。将该位点的不同基因型与肉质性状指标进行关联分析表明,所有肉质性状指标在不同基因型间差异均不显著(P>0.05)。综上所述,MSTN基因外显子在高坡猪中存在多态性,但变异较少,相对保守,能否作为高坡猪肉质性状的遗传标记有待于扩大样本数量进一步研究。 展开更多
关键词 高坡猪 MSTN基因 肉质性状
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三穗鸭肌细胞增强因子基因多态性与屠宰性状的相关性分析 被引量:5
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作者 易恒洁 李辉 +2 位作者 杨胜林 彭邦星 赵忠海 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第5期1232-1239,共8页
为了解三穗鸭肌细胞增强因子(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)SNPs与屠宰性状的相关性,本研究以60只三穗鸭为研究对象,采用PCR-SSCP方法结合PCR产物直接测序技术对三穗鸭MEF2A基因多态性进行检测,并进行SNPs与屠宰性状各指标的相关... 为了解三穗鸭肌细胞增强因子(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)SNPs与屠宰性状的相关性,本研究以60只三穗鸭为研究对象,采用PCR-SSCP方法结合PCR产物直接测序技术对三穗鸭MEF2A基因多态性进行检测,并进行SNPs与屠宰性状各指标的相关分析。结果表明,在MEF2A基因中共发现了2个SNPs:第11外显子的g.47915G>A位点和g.47918G>A位点,g.47915G>A位点发生的G/A突变使密码子由GAA变为AAA,翻译出的氨基酸由谷氨酸变成赖氨酸,g.47918G>A位点的G/A突变引起的密码子由GAT变成AAT,翻译出的氨基酸由天冬氨酸变成天冬酰胺。SNPs与屠宰性状的关联性分析表明,g.47915G>A和g.47918G>A位点影响全净膛率。这一结果揭示了MEF2A基因的多态性对三穗鸭屠体性状具有重要的影响。 展开更多
关键词 三穗鸭 肌细胞增强因子 屠宰性状
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三穗鸭肌肉生长抑制素基因的生物信息学分析 被引量:2
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作者 易恒洁 李辉 +2 位作者 杨胜林 赵忠海 彭邦星 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第4期1-6,共6页
采用PCR产物直接测序的方法获得肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的编码区序列,并运用生物信息学方法对该基因编码蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、二级结构、三级结构和功能结构域进行分析。结果表明,三穗鸭MSTN蛋白是一个疏水... 采用PCR产物直接测序的方法获得肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的编码区序列,并运用生物信息学方法对该基因编码蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、二级结构、三级结构和功能结构域进行分析。结果表明,三穗鸭MSTN蛋白是一个疏水性不稳定蛋白,作为信号肽的可能性很大;含有22个α螺旋、26个β折叠、26个T转角、20个无规则卷曲,有1个跨膜结构,具有TGF-β的主要结构。研究结果为MSTN基因的进一步研究提供参考。 展开更多
关键词 三穗鸭 肌肉生长抑制素基因 生物信息学
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基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)序列分析贵妃鸡的遗传多样性 被引量:20
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作者 吴婵 李辉 +4 位作者 李敬瑞 张大权 谢国午 孔嫣 易恒洁 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第12期137-140,共4页
采用PCR产物直接测序技术对30只贵妃鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明,在所分析的D-loop区部分序列中(520 bp),A、G、C、T平均含量分别为26.8%、13.0%、31.1%和29.1%;共发现13个核苷酸多态位点... 采用PCR产物直接测序技术对30只贵妃鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明,在所分析的D-loop区部分序列中(520 bp),A、G、C、T平均含量分别为26.8%、13.0%、31.1%和29.1%;共发现13个核苷酸多态位点,均为转换位点,未检测到插入/缺失和颠换,核苷酸多样度(Pi)为0.0059,单倍型变异度(Hd)为0.538,中性检验Tajima’s D值为-0.67065。通过群体构建的NJ聚类图分子系统树发现,贵妃鸡起源于红原鸡。 展开更多
关键词 贵妃鸡 线粒体DNA D-LOOP 遗传多样性 单倍型
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贵妃鸡肌肉脂肪酸的GC-MS分析 被引量:8
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作者 李辉 易恒洁 +1 位作者 彭邦星 赵忠海 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期96-97,102,共3页
应用气相色谱-质谱(GC-MS)联合技术对贵妃鸡肌肉脂肪酸组分进行分析,并计算各脂肪酸的相对百分比含量。结果表明,贵妃鸡肌肉中共分离和鉴定出21种脂肪酸,其中饱和脂肪酸6种,分别是豆蔻酸、十五烷酸、棕榈酸、十七烷酸、硬脂酸和花生酸,... 应用气相色谱-质谱(GC-MS)联合技术对贵妃鸡肌肉脂肪酸组分进行分析,并计算各脂肪酸的相对百分比含量。结果表明,贵妃鸡肌肉中共分离和鉴定出21种脂肪酸,其中饱和脂肪酸6种,分别是豆蔻酸、十五烷酸、棕榈酸、十七烷酸、硬脂酸和花生酸,占总脂肪酸的28.61%;不饱和脂肪酸(UFA)15种,分别是十四碳一烯酸、棕榈油酸、油酸、亚油酸、十七碳烯酸、9,12,15-十八碳三烯酸、11-二十碳一烯酸、11,14二十碳二烯酸、8,11,14-二十碳三烯酸、花生四烯酸(AA)、芥酸、二十二碳五烯酸(DPA)、4,7,10,13,16,19-二十二碳六烯酸甲酯(DHA)、γ-亚麻酸、11,14,17-二十碳三烯酸,占总脂肪酸含量的71.45%。多不饱和脂肪酸(PUFAs)占总脂肪酸含量的25.08%,必需脂肪酸占总脂肪酸含量的23.52%。 展开更多
关键词 贵妃鸡 脂肪酸 气相色谱-质谱
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贵妃鸡肌细胞生成素基因SNPs检测及其与屠宰性状的相关性分析 被引量:7
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作者 赵忠海 李辉 +4 位作者 吴婵 易恒洁 唐汉超 杨茜 李先富 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第11期148-152,共5页
试验以肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因作为屠宰性状候选基因,以相同饲养条件下13周龄的贵妃鸡为研究对象,采用PCR扩增产物直接测序,检测该基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并进行MyoG基因SNP位点与屠宰性... 试验以肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因作为屠宰性状候选基因,以相同饲养条件下13周龄的贵妃鸡为研究对象,采用PCR扩增产物直接测序,检测该基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并进行MyoG基因SNP位点与屠宰性状的相关性分析。结果发现,在研究群体中检测到4个SNPs位点,存在T-T-A-G、T-T-A-A、C-C-A-G和C-C-G-A共4种单倍型,分别命名为H1、H2、H3和H4,经序列对比,可构建出H1H1、H1H2、H1H3、H1H4和H2H3共5种双倍型,对所定义的5种双倍型与贵妃鸡屠宰性状间进行关联分析,结果均未达到显著水平。 展开更多
关键词 贵妃鸡 屠宰性状 肌细胞生成素基因
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兴义鸭MEF2A基因的SNPs筛选及其生物信息学分析 被引量:2
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作者 彭邦星 李辉 +3 位作者 张达 易恒洁 赵忠海 廉明政 《广东农业科学》 CAS 2015年第4期86-92,F0002,共8页
为了解鸭MEF2A基因的功能和结构以及其对鸭遗传效应的影响,采用混合DNA池、基因克隆、PCR产物直接测序和生物信息学相结合的方法 ,对兴义鸭的MEF2A基因进行研究。结果并未发现SNP位点,运用生物信息学方法对其蛋白质一级结构和二级结构... 为了解鸭MEF2A基因的功能和结构以及其对鸭遗传效应的影响,采用混合DNA池、基因克隆、PCR产物直接测序和生物信息学相结合的方法 ,对兴义鸭的MEF2A基因进行研究。结果并未发现SNP位点,运用生物信息学方法对其蛋白质一级结构和二级结构进行分析,发现其包含33个α螺旋、20个β折叠、44个无规则卷曲。将获得的鸭的MEF2A蛋白序列与NCBI上提交的家鼠、牛、斑马鱼、猪、鸡的MEF2A序列相比对,结果显示:鸭与鸡、鱼的亲缘关系相近,与家鼠的亲缘关系较远。 展开更多
关键词 兴义鸭 MEF2A基因 SNPS 生物信息学
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兴义鸭肌肉生长抑制素基因多态性与屠宰性状的相关性分析 被引量:3
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作者 彭邦星 李辉 +1 位作者 易恒洁 赵忠海 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第12期225-230,共6页
为了解兴义鸭肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因SNPs与屠宰性状的相关性,本研究采用基因克隆及PCR产物直接测序的方法,将MSTN基因作为鸭屠宰性状的候选基因,对兴义鸭的MSTN基因外显子进行多态性检测。结果表明,在60个兴义鸭个体中筛选... 为了解兴义鸭肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因SNPs与屠宰性状的相关性,本研究采用基因克隆及PCR产物直接测序的方法,将MSTN基因作为鸭屠宰性状的候选基因,对兴义鸭的MSTN基因外显子进行多态性检测。结果表明,在60个兴义鸭个体中筛选出8个SNPs,其中,第1外显子有5个突变位点:SNP1(G77A)、SNP2(A91G)、SNP3(G130A)、SNP4(C325T)和SNP5(C331T);在第2外显子中并未发现突变位点;第3外显子有3个突变位点:SNP6(C206T)、SNP7(A235G)和SNP8(C256A);对这8个SNPs与屠宰性状进行关联性分析,结果并未达到显著水平(P>0.05)。本研究结果可丰富MSTN基因的研究数据,为鸭的育种提供参考。 展开更多
关键词 肌肉生长抑制素基因 兴义鸭 屠宰性状
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非洲猪瘟研究现状及防控措施
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作者 张芳 王珍梅 +2 位作者 唐明艳 易恒洁 谢艳 《国外畜牧学(猪与禽)》 2024年第2期48-53,共6页
非洲猪瘟(African swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起的一种毁灭性猪传染性疾病,传播快且范围广,致死率高,预防难。猪感染ASFV后皮肤和内脏器官出血。非洲猪瘟病毒基因强大,变异性强,持续传播影响... 非洲猪瘟(African swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起的一种毁灭性猪传染性疾病,传播快且范围广,致死率高,预防难。猪感染ASFV后皮肤和内脏器官出血。非洲猪瘟病毒基因强大,变异性强,持续传播影响着世界范围内的养猪业,威胁着粮食安全和生物多样性。本文从非洲猪瘟起源、病毒特征、检测方法、国内外疫苗研究现状及疫病防控措施等方面进行综述,旨在为后续研究及防控提供参考。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 非洲猪瘟病毒 疫苗 研究现状 防控措施
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