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鸽圆环病毒新疆株全基因组克隆与序列分析
被引量：
6
1
作者
米晓云
吴建勇
+5 位作者
马文戈
日孜瓦古·努尔东
王琦
盛肖刚
黄炯
魏玉荣
《塔里木大学学报》
2021年第1期1-8,共8页
采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2031 bp,存在ORF V1(41~994 nt)...
采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2031 bp,存在ORF V1(41~994 nt)、ORF C1(1166~1981 nt)、ORF C2(410~790 nt)、ORF C3(2~292 nt)和ORF C4(739~984 nt)5个阅读框,5’端和3’端基因间隔区长度分别为90 nt和171 nt。XJ1与已报道的24株鸽圆环病毒全基因组序列同源性为87.2%~94.9%,其中与GF17和GH1834的同源性最高(均为94.9%),基于基因遗传进化树显示,XJ1株与Cap蛋白起始密码子"ATG"分支中GF82、JF007及GH1834亲缘关系最近。鸽圆环病毒新疆株全基因组序列的分析为疫苗开发提供资料参考。
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关键词
鸽圆环病毒
全基因
序列分析
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职称材料
鸽圆环病毒Cap及Rep基因的克隆与进化分析
被引量：
5
2
作者
日孜瓦古·努尔东
米晓云
+7 位作者
魏玉荣
吴建勇
苗书魁
马文戈
韩涛
葛丽娟
魏婕
黄炯
《塔里木大学学报》
2020年第1期1-6,共6页
为了解新疆和田地区某规模化种鸽场鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)感染情况和潜在来源,本研究采集了200份鸽粪便和3份鸽病料样本,对其进行PiCV Cap及Rep基因的PCR扩增、序列测定与分析。研究结果表明,PiCV检出率为47.29%(96/203)...
为了解新疆和田地区某规模化种鸽场鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)感染情况和潜在来源,本研究采集了200份鸽粪便和3份鸽病料样本,对其进行PiCV Cap及Rep基因的PCR扩增、序列测定与分析。研究结果表明,PiCV检出率为47.29%(96/203)。测序毒株被命名为PiCV-XJ2018,其Cap基因与GF82/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为94.98%,Rep基因与GF71/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为97.17%。遗传进化分析结果显示,PiCV-XJ2018毒株与国内2014年检测的广东株及上海株亲缘关系较近。本研究将为本地区鸽圆环病毒的诊断与防控提供参考数据。
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关键词
鸽圆环病毒
Rep基因
Cap基因
进化分析
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职称材料
题名
鸽圆环病毒新疆株全基因组克隆与序列分析
被引量：
6
1
作者
米晓云
吴建勇
马文戈
日孜瓦古·努尔东
王琦
盛肖刚
黄炯
魏玉荣
机构
新疆畜牧科学院兽医研究所
巴音郭楞职业技术学院
新疆维吾尔自治区动物卫生监督所
出处
《塔里木大学学报》
2021年第1期1-8,共8页
基金
国家重点研发计划项目“家禽主要传染病综合防控研究及国际科技合作平台建设”(2016YFE0203200)。
文摘
采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2031 bp,存在ORF V1(41~994 nt)、ORF C1(1166~1981 nt)、ORF C2(410~790 nt)、ORF C3(2~292 nt)和ORF C4(739~984 nt)5个阅读框,5’端和3’端基因间隔区长度分别为90 nt和171 nt。XJ1与已报道的24株鸽圆环病毒全基因组序列同源性为87.2%~94.9%,其中与GF17和GH1834的同源性最高(均为94.9%),基于基因遗传进化树显示,XJ1株与Cap蛋白起始密码子"ATG"分支中GF82、JF007及GH1834亲缘关系最近。鸽圆环病毒新疆株全基因组序列的分析为疫苗开发提供资料参考。
关键词
鸽圆环病毒
全基因
序列分析
Keywords
pigeon circovirus
genome
sequence analysis
分类号
S8 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
鸽圆环病毒Cap及Rep基因的克隆与进化分析
被引量：
5
2
作者
日孜瓦古·努尔东
米晓云
魏玉荣
吴建勇
苗书魁
马文戈
韩涛
葛丽娟
魏婕
黄炯
机构
新疆农业大学动物医学学院
新疆畜牧科学院兽医研究所
出处
《塔里木大学学报》
2020年第1期1-6,共6页
基金
新疆维吾尔自治区创新环境(人才、基地)建设专项科技创新基地建设(资源共享平台建设)“新疆兽医微生物平台建设”(PT1809)。
文摘
为了解新疆和田地区某规模化种鸽场鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)感染情况和潜在来源,本研究采集了200份鸽粪便和3份鸽病料样本,对其进行PiCV Cap及Rep基因的PCR扩增、序列测定与分析。研究结果表明,PiCV检出率为47.29%(96/203)。测序毒株被命名为PiCV-XJ2018,其Cap基因与GF82/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为94.98%,Rep基因与GF71/Guangdong/2014毒株核苷酸同源性为97.17%。遗传进化分析结果显示,PiCV-XJ2018毒株与国内2014年检测的广东株及上海株亲缘关系较近。本研究将为本地区鸽圆环病毒的诊断与防控提供参考数据。
关键词
鸽圆环病毒
Rep基因
Cap基因
进化分析
Keywords
PiCV
Rep gene
Cap gene
phylogenetic analysis
分类号
S836 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸽圆环病毒新疆株全基因组克隆与序列分析
米晓云
吴建勇
马文戈
日孜瓦古·努尔东
王琦
盛肖刚
黄炯
魏玉荣
《塔里木大学学报》
2021
6
在线阅读
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职称材料
2
鸽圆环病毒Cap及Rep基因的克隆与进化分析
日孜瓦古·努尔东
米晓云
魏玉荣
吴建勇
苗书魁
马文戈
韩涛
葛丽娟
魏婕
黄炯
《塔里木大学学报》
2020
5
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