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辣椒CabHLH71-Like基因的克隆与表达分析
1
作者
李佩茹
方娜英
+2 位作者
毛莲珍
沈逸雨
刘周斌
《辣椒杂志》
2025年第2期10-20,共11页
碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基因家族作为转录因子的一大类,广泛存在于植物中,在调控植物的生长发育过程、信号传递机制、生物合成活动以及对外界非生物胁迫的反应中发挥重要作用。为探究CabHLH71-Like基因的结构特性与功能,深入研究该基因...
碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基因家族作为转录因子的一大类,广泛存在于植物中,在调控植物的生长发育过程、信号传递机制、生物合成活动以及对外界非生物胁迫的反应中发挥重要作用。为探究CabHLH71-Like基因的结构特性与功能,深入研究该基因对辣椒的分子调控机制,本研究选取一个朝天椒材料LY0(Capsicum annuum L)作为试验对象,克隆CabHLH71-Like编码基因的全长,并进行生物信息学分析以及时空表达模式的研究。结果显示,CabHLH71-Like基因的编码序列总长为939个碱基对,共编码342个氨基酸,其蛋白质分子式为C_(1662)H_(2663)N_(481)O_(523)S_(11),相对分子质量约为38104.00 Da,该蛋白为亲水不稳定蛋白。根据亚细胞定位结果以及蛋白跨膜结构分析,预测CabHLH71-Like蛋白位于细胞核区域内且为非跨膜蛋白。进一步进行系统进化树构建分析以及同源基因序列的比对研究,发现该氨基酸序列与黄灯笼辣椒(Capsicum chinense)等物种的氨基酸序列表现出紧密亲缘性,且上述物种的氨基酸序列中均含有保守的bHLH_AtFAMA_like结构域。实时荧光定量结果显示,CabHLH71-Like基因在LY0的叶片中高表达,其次是果实,且在果实不同发育时期该基因表达量随果实成熟过程升高。本研究为深入研究bHLH转录因子家族的生物学功能,以及CabHLH71-Like基因在辣椒中的分子调控机制奠定了基础,特别是在辣椒叶片上的研究提供了一定参考价值。
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关键词
辣椒
转录因子
时空表达
生物信息学
基因克隆
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职称材料
辣椒CaAUX22基因的克隆与表达分析
被引量：
1
2
作者
方娜英
马琦龙
刘周斌
《辣椒杂志》
2023年第3期1-9,19,共10页
AUX/IAA(生长素/吲哚-3-乙酸)基因家族是植物中重要的生长调控元件,主要调控植物生长素响应和信号传导。为揭示辣椒生长素原初响应基因CaAUX22的结构特征及功能,本研究以辣椒自交系6421为试验材料,克隆CaAUX22编码基因全长进行生物信息...
AUX/IAA(生长素/吲哚-3-乙酸)基因家族是植物中重要的生长调控元件,主要调控植物生长素响应和信号传导。为揭示辣椒生长素原初响应基因CaAUX22的结构特征及功能,本研究以辣椒自交系6421为试验材料,克隆CaAUX22编码基因全长进行生物信息学和时空表达模式分析。结果发现,CaAUX22基因编码序列全长552 bp,编码183个氨基酸,蛋白分子量为20 798.85 Da,为亲水不稳定性蛋白。该蛋白不含信号肽,为非分泌蛋白,且不具有叶绿体、线粒体靶向肽。亚细胞定位预测CaAUX22蛋白位于细胞质中。蛋白跨膜结构预测显示CaAUX22蛋白不属于膜结构蛋白。进化树分析和同源基因序列比对表明CaAUX22与黄灯笼辣椒、曼陀罗、三分三的序列高度相似,均含有AUX/IAA结构域,且自身具有高度的保守性。RT-qPCR检测结果显示,辣椒CaAUX22基因在根和茎中微量表达,在花和叶中少量表达,在胎座和种子中表达相对较高,在果皮组织中表达量极高,并随着果实的生长其表达量逐渐升高,至成熟期降低,说明CaAUX22基因参与了辣椒果实的发育过程。这些结果为进一步研究辣椒CaAUX22基因的功能及其作用机制提供了理论依据。
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关键词
辣椒
生长素基因
基因克隆
生物信息学
表达分析
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职称材料
题名
辣椒CabHLH71-Like基因的克隆与表达分析
1
作者
李佩茹
方娜英
毛莲珍
沈逸雨
刘周斌
机构
湖南农业大学园艺学院
出处
《辣椒杂志》
2025年第2期10-20,共11页
基金
湖南省自然科学基金(2025JJ40022)
长沙市科技计划项目(kq2506023)
+1 种基金
国家自然科学基金青年项目(32302574)
抗病抗逆辣椒良种攻关项目(2022010501)。
文摘
碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基因家族作为转录因子的一大类,广泛存在于植物中,在调控植物的生长发育过程、信号传递机制、生物合成活动以及对外界非生物胁迫的反应中发挥重要作用。为探究CabHLH71-Like基因的结构特性与功能,深入研究该基因对辣椒的分子调控机制,本研究选取一个朝天椒材料LY0(Capsicum annuum L)作为试验对象,克隆CabHLH71-Like编码基因的全长,并进行生物信息学分析以及时空表达模式的研究。结果显示,CabHLH71-Like基因的编码序列总长为939个碱基对,共编码342个氨基酸,其蛋白质分子式为C_(1662)H_(2663)N_(481)O_(523)S_(11),相对分子质量约为38104.00 Da,该蛋白为亲水不稳定蛋白。根据亚细胞定位结果以及蛋白跨膜结构分析,预测CabHLH71-Like蛋白位于细胞核区域内且为非跨膜蛋白。进一步进行系统进化树构建分析以及同源基因序列的比对研究,发现该氨基酸序列与黄灯笼辣椒(Capsicum chinense)等物种的氨基酸序列表现出紧密亲缘性,且上述物种的氨基酸序列中均含有保守的bHLH_AtFAMA_like结构域。实时荧光定量结果显示,CabHLH71-Like基因在LY0的叶片中高表达,其次是果实,且在果实不同发育时期该基因表达量随果实成熟过程升高。本研究为深入研究bHLH转录因子家族的生物学功能,以及CabHLH71-Like基因在辣椒中的分子调控机制奠定了基础,特别是在辣椒叶片上的研究提供了一定参考价值。
关键词
辣椒
转录因子
时空表达
生物信息学
基因克隆
Keywords
Capsicum annuum L
transcription factor
spatiotemporal expression
bioinformatics
gene cloning
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
辣椒CaAUX22基因的克隆与表达分析
被引量：
1
2
作者
方娜英
马琦龙
刘周斌
机构
湖南农业大学园艺学院
出处
《辣椒杂志》
2023年第3期1-9,19,共10页
基金
湖南省自然科学基金青年基金项目(2021JJ40240)
云南省科技计划项目(202204BI090004)。
文摘
AUX/IAA(生长素/吲哚-3-乙酸)基因家族是植物中重要的生长调控元件,主要调控植物生长素响应和信号传导。为揭示辣椒生长素原初响应基因CaAUX22的结构特征及功能,本研究以辣椒自交系6421为试验材料,克隆CaAUX22编码基因全长进行生物信息学和时空表达模式分析。结果发现,CaAUX22基因编码序列全长552 bp,编码183个氨基酸,蛋白分子量为20 798.85 Da,为亲水不稳定性蛋白。该蛋白不含信号肽,为非分泌蛋白,且不具有叶绿体、线粒体靶向肽。亚细胞定位预测CaAUX22蛋白位于细胞质中。蛋白跨膜结构预测显示CaAUX22蛋白不属于膜结构蛋白。进化树分析和同源基因序列比对表明CaAUX22与黄灯笼辣椒、曼陀罗、三分三的序列高度相似,均含有AUX/IAA结构域,且自身具有高度的保守性。RT-qPCR检测结果显示,辣椒CaAUX22基因在根和茎中微量表达,在花和叶中少量表达,在胎座和种子中表达相对较高,在果皮组织中表达量极高,并随着果实的生长其表达量逐渐升高,至成熟期降低,说明CaAUX22基因参与了辣椒果实的发育过程。这些结果为进一步研究辣椒CaAUX22基因的功能及其作用机制提供了理论依据。
关键词
辣椒
生长素基因
基因克隆
生物信息学
表达分析
Keywords
pepper
auxin gene
gene cloning
bioinformatics
expression analysis
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
辣椒CabHLH71-Like基因的克隆与表达分析
李佩茹
方娜英
毛莲珍
沈逸雨
刘周斌
《辣椒杂志》
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
辣椒CaAUX22基因的克隆与表达分析
方娜英
马琦龙
刘周斌
《辣椒杂志》
2023
1
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职称材料
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