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自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建
被引量：
1
1
作者
何莹
徐睿
扈晓宇
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期975-981,共7页
目的:筛选在肝细胞癌(HCC)中具有预后价值的核心自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)。方法:选择癌症基因组图谱数据库(TCGA)和人类自噬数据库(HADb)进行生物信息学分析。以多因素Cox回归,最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归构建风险评分模...
目的:筛选在肝细胞癌(HCC)中具有预后价值的核心自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)。方法:选择癌症基因组图谱数据库(TCGA)和人类自噬数据库(HADb)进行生物信息学分析。以多因素Cox回归,最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归构建风险评分模型。模型的特异度和敏感度由受试者工作特征曲线(ROC)评估。相关生物学功能由Metascape数据库和基因集富集分析(GSEA)鉴定。结果:共鉴定了10个关键lncRNAs并据此构建风险评分模型。生存分析显示高风险组患者总生存期显著低于低风险组(P<0.001)。该模型在预测HCC患者一年、三年、五年生存率方面表现良好,曲线下面积分别是0.810、0.751、0.736。多因素Cox回归表明,该模型是HCC的独立预后因素(HR=3.666,P<0.001)。结论:本研究鉴定了10个自噬相关lncRNAs,并以之构建了1个用于HCC的预后风险模型,有望成为潜在的治疗靶点和新的预测指标。
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关键词
肝细胞癌
自噬
长链非编码RNA
计算生物学
预后
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职称材料
题名
自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建
被引量：
1
1
作者
何莹
徐睿
扈晓宇
(
指导
)
机构
成都中医药大学附属医院感染科
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期975-981,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81973840)。
文摘
目的:筛选在肝细胞癌(HCC)中具有预后价值的核心自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)。方法:选择癌症基因组图谱数据库(TCGA)和人类自噬数据库(HADb)进行生物信息学分析。以多因素Cox回归,最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归构建风险评分模型。模型的特异度和敏感度由受试者工作特征曲线(ROC)评估。相关生物学功能由Metascape数据库和基因集富集分析(GSEA)鉴定。结果:共鉴定了10个关键lncRNAs并据此构建风险评分模型。生存分析显示高风险组患者总生存期显著低于低风险组(P<0.001)。该模型在预测HCC患者一年、三年、五年生存率方面表现良好,曲线下面积分别是0.810、0.751、0.736。多因素Cox回归表明,该模型是HCC的独立预后因素(HR=3.666,P<0.001)。结论:本研究鉴定了10个自噬相关lncRNAs,并以之构建了1个用于HCC的预后风险模型,有望成为潜在的治疗靶点和新的预测指标。
关键词
肝细胞癌
自噬
长链非编码RNA
计算生物学
预后
Keywords
Hepatocellular carcinoma
Autophagy
Long non-coding RNA
Computational biology
Prognosis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建
何莹
徐睿
扈晓宇
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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