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稻瘟病病菌线粒体基因密码子使用偏好性分析
被引量:
10
1
作者
徐苏丽
王俊峰
陈士华
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期722-726,756,共6页
利用Mobyle,DNAStar,SPSS等软件分析稻瘟病病菌线粒体13个基因密码子的使用模式和形成原因.结果显示,稻瘟病病菌线粒体基因组密码子GC含量较低、偏好性强,偏好使用A/T结尾的密码子,终止密码子偏好使用TAA.通过计算相对同义密码子使用度(...
利用Mobyle,DNAStar,SPSS等软件分析稻瘟病病菌线粒体13个基因密码子的使用模式和形成原因.结果显示,稻瘟病病菌线粒体基因组密码子GC含量较低、偏好性强,偏好使用A/T结尾的密码子,终止密码子偏好使用TAA.通过计算相对同义密码子使用度(RSCU)和密码子适应指数(CAI)确定了CCT,TGA等19个以A/T碱基结尾的最优密码子,并且它们的使用度随基因的表达水平升高而增加.中性绘图分析结果表明,密码子使用模式主要受选择作用的影响.
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关键词
稻瘟病
线粒体
密码子偏好性
最优密码子
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职称材料
AP631炭疽噬菌体裂解蜡样芽胞杆菌的发现和鉴定
被引量:
5
2
作者
张慧娟
刘东立
+11 位作者
贺莉
李伟
张恩民
魏建春
纪建军
徐苏丽
刘玮
张发信
马国柱
石一
马琳
梁旭东
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期507-511,共5页
目的 AP631炭疽噬菌体裂解蜡样芽胞杆菌的发现和鉴定。方法通过革兰氏染色、菌落形态特征、噬菌体裂解试验、青霉素敏感试验、溶血试验、生化试验和蛋白质毒素结晶试验对炭疽疫点现场分离的5株菌进行蜡样芽胞杆菌的鉴定,通过PCR扩增、...
目的 AP631炭疽噬菌体裂解蜡样芽胞杆菌的发现和鉴定。方法通过革兰氏染色、菌落形态特征、噬菌体裂解试验、青霉素敏感试验、溶血试验、生化试验和蛋白质毒素结晶试验对炭疽疫点现场分离的5株菌进行蜡样芽胞杆菌的鉴定,通过PCR扩增、小白鼠毒力测定试验和MLST基因检测等方法对该5株菌和本实验室保存的3株被AP631炭疽噬菌体裂解的蜡样芽胞杆菌进行毒力和基因测定。结果确定了8株可被AP631炭疽噬菌体不完全裂解的蜡样芽胞杆菌。从疫点采集分离的5株菌青霉素敏感试验阴性,炭疽毒力基因PCR扩增阴性,排除了炭疽芽胞杆菌;蛋白质毒素结晶试验染色试验为阴性,排除了苏云金芽胞杆菌;根据溶血试验和生化反应等一系列鉴别实验鉴定为蜡样芽胞杆菌。8株菌的MLST基因检测发现5株菌有新的等位基因位点或ST型。结论本研究首次证明我国使用的炭疽芽胞杆菌诊断AP631噬菌体可以不完全裂解部分蜡样芽胞杆菌,存在非特异性裂解现象,提示在今后使用噬菌体鉴定炭疽杆菌时,对于外环境分离到的可疑芽胞杆菌,特别要注意关于噬菌体不完全裂解的问题,这将为炭疽诊断标准的正确制订提供新的认识并具有重要的指导意义。
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关键词
AP631炭疽噬菌体
蜡样芽胞杆菌
鉴定
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职称材料
LAMP技术在动物病毒病原检测中的应用进展
被引量:
6
3
作者
周广舟
徐苏丽
+1 位作者
谭晓荣
陈小兵
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期179-182,共4页
环介导等温扩增技术(LAMP)是一种具有简单、快速、特异性强和扩增效率高的核酸检测技术,目前已在食品、卫生及疾病预防控制检验等领域得到了诸多应用。本文主要介绍了LAMP技术在实验及临床过程中检测肝炎病毒、流感病毒、HIV-1、狂犬病...
环介导等温扩增技术(LAMP)是一种具有简单、快速、特异性强和扩增效率高的核酸检测技术,目前已在食品、卫生及疾病预防控制检验等领域得到了诸多应用。本文主要介绍了LAMP技术在实验及临床过程中检测肝炎病毒、流感病毒、HIV-1、狂犬病毒、乙脑病毒、冠状病毒、登革病毒等病毒病原感染的应用进展。
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关键词
核酸
环介导等温扩增
病毒
检测
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职称材料
鱼类细胞自噬研究进展
被引量:
2
4
作者
周广舟
张璐
+2 位作者
卢延克
司灿
徐苏丽
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期41-44,共4页
自噬是广泛存在于真核生物中的生命现象,对于细胞的生长、分化、发育和维持细胞内环境稳态等方面具有重要意义。尽管对于作为低等脊椎动物的鱼类细胞自噬研究起步较晚,但近几年围绕其自噬的诱导、自噬相关基因表达及调控、鱼类病原诱导...
自噬是广泛存在于真核生物中的生命现象,对于细胞的生长、分化、发育和维持细胞内环境稳态等方面具有重要意义。尽管对于作为低等脊椎动物的鱼类细胞自噬研究起步较晚,但近几年围绕其自噬的诱导、自噬相关基因表达及调控、鱼类病原诱导的自噬,特别是以斑马鱼为试验模型开展的自噬与发育调控关系等研究都取得了一些进展,就此进行综述。
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关键词
细胞自噬
鱼类细胞
鱼类病毒
细菌
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职称材料
题名
稻瘟病病菌线粒体基因密码子使用偏好性分析
被引量:
10
1
作者
徐苏丽
王俊峰
陈士华
机构
河南工业大学生物工程学院
出处
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期722-726,756,共6页
基金
河南省青年骨干教师资助项目(2010GGJS-086)
文摘
利用Mobyle,DNAStar,SPSS等软件分析稻瘟病病菌线粒体13个基因密码子的使用模式和形成原因.结果显示,稻瘟病病菌线粒体基因组密码子GC含量较低、偏好性强,偏好使用A/T结尾的密码子,终止密码子偏好使用TAA.通过计算相对同义密码子使用度(RSCU)和密码子适应指数(CAI)确定了CCT,TGA等19个以A/T碱基结尾的最优密码子,并且它们的使用度随基因的表达水平升高而增加.中性绘图分析结果表明,密码子使用模式主要受选择作用的影响.
关键词
稻瘟病
线粒体
密码子偏好性
最优密码子
Keywords
Magaporthe orisea
mitochondria
codon bias
optimal codon
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
AP631炭疽噬菌体裂解蜡样芽胞杆菌的发现和鉴定
被引量:
5
2
作者
张慧娟
刘东立
贺莉
李伟
张恩民
魏建春
纪建军
徐苏丽
刘玮
张发信
马国柱
石一
马琳
梁旭东
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
陕西省疾病预防控制中心
延安市疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期507-511,共5页
基金
传染病预防控制国家重点实验室资助项目(No.2011SKLID210)~~
文摘
目的 AP631炭疽噬菌体裂解蜡样芽胞杆菌的发现和鉴定。方法通过革兰氏染色、菌落形态特征、噬菌体裂解试验、青霉素敏感试验、溶血试验、生化试验和蛋白质毒素结晶试验对炭疽疫点现场分离的5株菌进行蜡样芽胞杆菌的鉴定,通过PCR扩增、小白鼠毒力测定试验和MLST基因检测等方法对该5株菌和本实验室保存的3株被AP631炭疽噬菌体裂解的蜡样芽胞杆菌进行毒力和基因测定。结果确定了8株可被AP631炭疽噬菌体不完全裂解的蜡样芽胞杆菌。从疫点采集分离的5株菌青霉素敏感试验阴性,炭疽毒力基因PCR扩增阴性,排除了炭疽芽胞杆菌;蛋白质毒素结晶试验染色试验为阴性,排除了苏云金芽胞杆菌;根据溶血试验和生化反应等一系列鉴别实验鉴定为蜡样芽胞杆菌。8株菌的MLST基因检测发现5株菌有新的等位基因位点或ST型。结论本研究首次证明我国使用的炭疽芽胞杆菌诊断AP631噬菌体可以不完全裂解部分蜡样芽胞杆菌,存在非特异性裂解现象,提示在今后使用噬菌体鉴定炭疽杆菌时,对于外环境分离到的可疑芽胞杆菌,特别要注意关于噬菌体不完全裂解的问题,这将为炭疽诊断标准的正确制订提供新的认识并具有重要的指导意义。
关键词
AP631炭疽噬菌体
蜡样芽胞杆菌
鉴定
Keywords
phage AP631
Bacillus cereus
identification
分类号
R378.7 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
LAMP技术在动物病毒病原检测中的应用进展
被引量:
6
3
作者
周广舟
徐苏丽
谭晓荣
陈小兵
机构
河南工业大学生物工程学院
郑州大学附属肿瘤医院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期179-182,共4页
基金
国家自然科学基金(No.31101931
No.81172240)
+1 种基金
河南工业大学科技创新人才培育计划(No.11CXRC13)
河南工业大学博士启动专项基金(No.2010BS016)联合资助~~
文摘
环介导等温扩增技术(LAMP)是一种具有简单、快速、特异性强和扩增效率高的核酸检测技术,目前已在食品、卫生及疾病预防控制检验等领域得到了诸多应用。本文主要介绍了LAMP技术在实验及临床过程中检测肝炎病毒、流感病毒、HIV-1、狂犬病毒、乙脑病毒、冠状病毒、登革病毒等病毒病原感染的应用进展。
关键词
核酸
环介导等温扩增
病毒
检测
Keywords
nucleotides
loop-mediated isothermal amplification
virus
detection
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
鱼类细胞自噬研究进展
被引量:
2
4
作者
周广舟
张璐
卢延克
司灿
徐苏丽
机构
河南工业大学生物工程学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期41-44,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31101931)
河南工业大学博士启动专项基金项目(2010BS016)
文摘
自噬是广泛存在于真核生物中的生命现象,对于细胞的生长、分化、发育和维持细胞内环境稳态等方面具有重要意义。尽管对于作为低等脊椎动物的鱼类细胞自噬研究起步较晚,但近几年围绕其自噬的诱导、自噬相关基因表达及调控、鱼类病原诱导的自噬,特别是以斑马鱼为试验模型开展的自噬与发育调控关系等研究都取得了一些进展,就此进行综述。
关键词
细胞自噬
鱼类细胞
鱼类病毒
细菌
Keywords
Cell autophagy Fish cells Fish viruses Bacteria
分类号
Q952.5 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
稻瘟病病菌线粒体基因密码子使用偏好性分析
徐苏丽
王俊峰
陈士华
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
AP631炭疽噬菌体裂解蜡样芽胞杆菌的发现和鉴定
张慧娟
刘东立
贺莉
李伟
张恩民
魏建春
纪建军
徐苏丽
刘玮
张发信
马国柱
石一
马琳
梁旭东
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
LAMP技术在动物病毒病原检测中的应用进展
周广舟
徐苏丽
谭晓荣
陈小兵
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
鱼类细胞自噬研究进展
周广舟
张璐
卢延克
司灿
徐苏丽
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
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职称材料
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