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生防菌株Bacillus velezensis Z全基因组测序分析
被引量：
11
1
作者
高圣风
徐毕爽
+5 位作者
陆大倩
刘爱勤
苟亚峰
孙世伟
王政
孟倩倩
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2021年第5期1216-1222,共7页
生防菌株Bacillus velezensis Z对胡椒瘟病等多种植物病害具有良好的生防效果;全基因组测序能够为其分子机理研究和开发应用提供信息基础。本研究开展该菌株全基因组测序,并进行比较基因组学和抑菌次生代谢产物合成基因簇预测研究。结...
生防菌株Bacillus velezensis Z对胡椒瘟病等多种植物病害具有良好的生防效果;全基因组测序能够为其分子机理研究和开发应用提供信息基础。本研究开展该菌株全基因组测序,并进行比较基因组学和抑菌次生代谢产物合成基因簇预测研究。结果表明:B.velezensis Z菌株的基因组中含有1条4054780 bp大小的环形染色体DNA和1个17122 bp大小的环形质粒,总基因组的GC含量为46.24%,共编码基因4173个;包含27个rRNA,86个tRNA基因,34个sRNA;含有串联重复序列179个,其中13个微卫星DNA,138个小卫星DNA;通过比较基因组学分析,结果发现该菌株与贝莱斯芽孢杆菌模式菌株FZB42同源性极高,与枯草芽孢杆菌模式菌株168之间具有一定的遗传距离;同时发现B.velezensis Z基因组中共编码次生代谢产物合成基因簇13个,其中8个与表面活性素(surfactin)、泛革素(fengycin)、溶杆菌素(bacilysin)、macrolactin H、bacillaene、difficidin、plantazolicin、amylocyclicin等已知基因簇完全相似或高度相似,其他5个基因簇皆功能未知。总之,本研究揭示了B.velezensis Z的全基因组遗传信息,明确其与贝莱斯芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌的比较基因组学关系,预测了抑菌产物合成编码基因簇,为该生防菌株及其抑菌产物的机理研究和开发应用奠定基础。
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关键词
贝莱斯芽孢杆菌
全基因组测序
比较基因组学
次生代谢产物
抑菌
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职称材料
题名
生防菌株Bacillus velezensis Z全基因组测序分析
被引量：
11
1
作者
高圣风
徐毕爽
陆大倩
刘爱勤
苟亚峰
孙世伟
王政
孟倩倩
机构
中国热带农业科学院香料饮料研究所
海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室
云南农业大学热带作物学院
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2021年第5期1216-1222,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(No.31972329)
中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金项目(No.1630142018015)。
文摘
生防菌株Bacillus velezensis Z对胡椒瘟病等多种植物病害具有良好的生防效果;全基因组测序能够为其分子机理研究和开发应用提供信息基础。本研究开展该菌株全基因组测序,并进行比较基因组学和抑菌次生代谢产物合成基因簇预测研究。结果表明:B.velezensis Z菌株的基因组中含有1条4054780 bp大小的环形染色体DNA和1个17122 bp大小的环形质粒,总基因组的GC含量为46.24%,共编码基因4173个;包含27个rRNA,86个tRNA基因,34个sRNA;含有串联重复序列179个,其中13个微卫星DNA,138个小卫星DNA;通过比较基因组学分析,结果发现该菌株与贝莱斯芽孢杆菌模式菌株FZB42同源性极高,与枯草芽孢杆菌模式菌株168之间具有一定的遗传距离;同时发现B.velezensis Z基因组中共编码次生代谢产物合成基因簇13个,其中8个与表面活性素(surfactin)、泛革素(fengycin)、溶杆菌素(bacilysin)、macrolactin H、bacillaene、difficidin、plantazolicin、amylocyclicin等已知基因簇完全相似或高度相似,其他5个基因簇皆功能未知。总之,本研究揭示了B.velezensis Z的全基因组遗传信息,明确其与贝莱斯芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌的比较基因组学关系,预测了抑菌产物合成编码基因簇,为该生防菌株及其抑菌产物的机理研究和开发应用奠定基础。
关键词
贝莱斯芽孢杆菌
全基因组测序
比较基因组学
次生代谢产物
抑菌
Keywords
Bacillus velezensis
whole genome sequencing
comparative genomics
secondary metabolite
antibiotic
分类号
S435.73 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
生防菌株Bacillus velezensis Z全基因组测序分析
高圣风
徐毕爽
陆大倩
刘爱勤
苟亚峰
孙世伟
王政
孟倩倩
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2021
11
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