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狐狸MC1R基因编码区c. 40A>C和c. 41C>T相邻变异研究被引量：2: 1; 作者徐桂利张文香 +6 位作者段玲欣巩元芳葛慕湘刘谢荣王书朋果新苓刘铮铸《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期2020-2026,共7页; 为了检测狐狸MC1R基因多态性及其与毛色表型的相关性,本研究采集两个狐属12种毛色共计163只狐狸的皮肤组织样,利用PCR扩增和产物直接测序的方法获得狐狸MC1R基因1 054bp长的核苷酸序列,并进行了SNPs筛查。用PopGen32和SHEsis软件对突变... 展开更多; 关键词狐狸 MC1R基因 40和41位点多态性毛色; 在线阅读下载PDF 职称材料

靶向食蟹猴NTCP基因的CRISPR/Cas9系统gRNA筛选被引量：1: 2; 作者徐桂利高新 +2 位作者刘铮铸巩元芳宋海峰《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第10期2572-2577,共6页; 本研究旨在通过CRISPR/Cas9体外酶切法及细胞水平上的PCR扩增测序筛选出靶向食蟹猴NTCP基因具有高敲除活性的gRNA。首先通过比对食蟹猴与人类NTCP氨基酸序列,选择差异位点,即第84—87位和第157—165位氨基酸作为基因靶点序列区;利用gRN... 展开更多; 关键词 CRISPR/Cas9 gRNA 食蟹猴 NTCP基因基因敲除; 在线阅读下载PDF 职称材料

狐狸Agouti基因SNPs筛查及其与毛色关联性分析被引量：5: 3; 作者李英杰刘铮铸 +7 位作者巩元芳徐桂利张磊唐家明段玲欣刘谢荣郭秀玲陆奇玉《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1692-1696,共5页; 旨在探究狐狸刺豚鼠基因(Agouti)多态性及其与狐狸被毛颜色之间的关系。本研究采用PCR和直接测序的方法对中国5个狐种58只狐狸的Agouti基因部分序列进行了SNPs筛查和单倍型分析。结果表明,在已测序的58只狐狸中首次发现6个SNPs(g.269G&g... 展开更多; 关键词狐狸 Agouti基因 SNPS 单倍型毛色; 在线阅读下载PDF 职称材料

银黑狐MC1R基因核心启动子区的鉴定被引量：2: 4; 作者刘华云张磊 +5 位作者徐桂利张天浩谢遇春段玲欣刘铮铸巩元芳《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第7期2442-2450,共9页; 【目的】确定银黑狐黑素皮质激素受体1(melanocortin 1 receptor,MC1R)基因的核心启动子区,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据。【方法】以银黑狐基因组DNA为模板,PCR扩增获得MC1R基因5′-UTR区序列,利用3个在线生物学软件综合预... 展开更多; 关键词银黑狐 MC1R基因启动子核心区; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名狐狸MC1R基因编码区c. 40A>C和c. 41C>T相邻变异研究被引量：2: 1; 作者徐桂利张文香段玲欣巩元芳葛慕湘刘谢荣王书朋果新苓刘铮铸; 机构河北科技师范学院动物科技学院河北东光县农业局; 出处《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期2020-2026,共7页; 基金国家自然科学基金(31272412) 河北省自然科学基金(C2013407101 +2 种基金 C2016407114) 河北科技师范学院科学研究基金(1); 文摘为了检测狐狸MC1R基因多态性及其与毛色表型的相关性,本研究采集两个狐属12种毛色共计163只狐狸的皮肤组织样,利用PCR扩增和产物直接测序的方法获得狐狸MC1R基因1 054bp长的核苷酸序列,并进行了SNPs筛查。用PopGen32和SHEsis软件对突变位点进行了群体遗传学分析,用PANTHER软件评估了突变对基因产生的功能影响,用SPSS二元变量相关统计方法分析了多态位点与毛色表型间的相关性。结果表明,狐狸MC1R基因编码区40(c.40A>C)和41位点(c.41C>T)存在2个相邻错义突变,导致其编码的第14位氨基酸发生了变异:当第40位点为A时,氨基酸由苏氨酸(Thr)转变为异亮氨酸(Ile);当第40位点为C时,氨基酸由脯氨酸(Pro)转变为亮氨酸(Leu)。北极狐属狐在41位点基因型全部为TT型,而狐属狐大部分个体均为CC型,不存在TT型,推测该位点可能是区分狐狸属间的一个重要功能位点。PANTHER预测获知第41位点突变导致的氨基酸替换(p.Pro14Leu)对MC1R功能有显著影响。SPSS二元变量相关分析结果表明,41位点多态性与狐狸毛色表型存在显著低度相关性,推测狐狸MC1R基因编码区第41位点可能是参与其毛色形成的一个相对重要功能位点。; 关键词狐狸 MC1R基因 40和41位点多态性毛色; Keywords fox MC1R genes40 and 41 sites polymorphism coat color; 分类号 S829.9 [农业科学—畜牧学] S813.3 [农业科学—畜牧学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名靶向食蟹猴NTCP基因的CRISPR/Cas9系统gRNA筛选被引量：1: 2; 作者徐桂利高新刘铮铸巩元芳宋海峰; 机构河北科技师范学院动物科技学院军事医学科学院放射与辐射医学研究所; 出处《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第10期2572-2577,共6页; 基金国家"重大新药创制"科技重大专项:生物类似药非临床与临床研究的药代动力学药效动力学以及免疫原性评价的关键技术(2015ZX09501008-006); 文摘本研究旨在通过CRISPR/Cas9体外酶切法及细胞水平上的PCR扩增测序筛选出靶向食蟹猴NTCP基因具有高敲除活性的gRNA。首先通过比对食蟹猴与人类NTCP氨基酸序列,选择差异位点,即第84—87位和第157—165位氨基酸作为基因靶点序列区;利用gRNA软件设计针对上述基因靶点序列的gRNA,每个靶点设计3～4条候选gRNA序列;然后利用gRNA体外检测试剂盒,筛选出靶向NTCP基因的体外敲除活性较高的两条gRNA序列：gRNA1.2和gRNA2.1。将gRNA1.2和gRNA2.1分别插入pLV hUbC-Cas9-T2A-GFP载体中,转染食蟹猴原代肝细胞。提取转染后细胞基因组DNA,通过PCR扩增NTCP基因并将其克隆到T载体中进行测序分析。结果表明,gRNA1.2和gRNA2.1均可使NTCP基因产生移码突变,但gRNA2.1比gRNA1.2具有更高的敲除活性。本研究为下一步编辑食蟹猴NTCP基因及研究其在乙型肝炎病毒（HBV）感染中的功能奠定了基础。; 关键词 CRISPR/Cas9 gRNA 食蟹猴 NTCP基因基因敲除; Keywords CRISPR/Cas9 gRNA Macaca fascicularis NTCPgene gene knockout; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名狐狸Agouti基因SNPs筛查及其与毛色关联性分析被引量：5: 3; 作者李英杰刘铮铸巩元芳徐桂利张磊唐家明段玲欣刘谢荣郭秀玲陆奇玉; 机构河北科技师范学院动物科技学院河北昌黎县畜牧发展局; 出处《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1692-1696,共5页; 基金国家自然科学基金(31040048 31272412) +1 种基金河北省自然科学基金(C2013407101); 文摘旨在探究狐狸刺豚鼠基因(Agouti)多态性及其与狐狸被毛颜色之间的关系。本研究采用PCR和直接测序的方法对中国5个狐种58只狐狸的Agouti基因部分序列进行了SNPs筛查和单倍型分析。结果表明,在已测序的58只狐狸中首次发现6个SNPs(g.269G>T、g.295C>T、g.325T>G、g.518G>A、g.608C>A和g.846G>A),它们全部存在于内含子2上。狐属的所有个体(25只)在6个位点全部为纯合子基因型,依次为GG、CC、TT、GG、CC和GG型,而北极狐属的所有个体(33只)在这6个位点则均为另一种纯合子基因型,依次为TT、TT、GG、AA、AA和AA型。6个SNPs形成两种单倍型:单倍型Ⅰ(H1:GCTGCG)和单倍型Ⅱ(H2:TTGAAA),分布频率分别为42.1%和57.9%。单倍型Ⅰ(H1)分布于狐属3个狐种的所有受试个体中,单倍型Ⅱ(H2)分布于北极狐属两个狐种的所有受试个体中。进一步分析没有发现6个SNPs及其单倍型与狐狸毛色的明显关联性,但推测它们是区分狐属和北极狐属的重要功能位点和重要单倍型。; 关键词狐狸 Agouti基因 SNPS 单倍型毛色; Keywords fox Agouti gene SNPs haplotype coat color; 分类号 S865.23 [农业科学—野生动物驯养]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名银黑狐MC1R基因核心启动子区的鉴定被引量：2: 4; 作者刘华云张磊徐桂利张天浩谢遇春段玲欣刘铮铸巩元芳; 机构河北科技师范学院动物科技学院; 出处《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第7期2442-2450,共9页; 基金河北省自然科学基金项目(C2021407011)。; 文摘【目的】确定银黑狐黑素皮质激素受体1(melanocortin 1 receptor,MC1R)基因的核心启动子区,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据。【方法】以银黑狐基因组DNA为模板,PCR扩增获得MC1R基因5′-UTR区序列,利用3个在线生物学软件综合预测MC1R基因启动子活性区;PCR扩增获得该基因5′-UTR区不同长度的缺失片段,并克隆至pMD19-T载体,将重组质粒转染至黑色素B16细胞中,利用双荧光素酶检测技术对10个缺失片段进行荧光素酶活性检测。【结果】成功获得银黑狐MC1R基因5′-UTR区序列,软件预测显示-596/+73 bp可能为启动子活性区。双荧光素酶活性检测发现,构建的10个缺失片段的荧光素酶表达载体均具有启动子活性,其中pGL3-MC1RP8(-520/+73 bp)有较强的活性,提示其为核心启动子区,与软件预测结果基本一致。【结论】试验确定了银黑狐MC1R基因的核心启动子区为―520/+73 bp,为深入研究该基因的毛色调控机制奠定了理论基础。; 关键词银黑狐 MC1R基因启动子核心区; Keywords silver fox MC1R gene promoter core region; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	狐狸MC1R基因编码区c. 40A>C和c. 41C>T相邻变异研究	徐桂利张文香段玲欣巩元芳葛慕湘刘谢荣王书朋果新苓刘铮铸	《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心	2016	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	靶向食蟹猴NTCP基因的CRISPR/Cas9系统gRNA筛选	徐桂利高新刘铮铸巩元芳宋海峰	《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心	2016	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	狐狸Agouti基因SNPs筛查及其与毛色关联性分析	李英杰刘铮铸巩元芳徐桂利张磊唐家明段玲欣刘谢荣郭秀玲陆奇玉	《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心	2015	5	在线阅读下载PDF 职称材料
4	银黑狐MC1R基因核心启动子区的鉴定	刘华云张磊徐桂利张天浩谢遇春段玲欣刘铮铸巩元芳	《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心	2022	2	在线阅读下载PDF 职称材料