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系统发育谱法研究牛蛋白质相互作用网络
1
作者
沈庆航
徐加豹
+1 位作者
江明锋
钟金城
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期8-17,共10页
旨在对牛蛋白质相互作用网络进行研究,除了为牛的后基因组学提供研究基础外,其研究成果还可运用到牛的生产实践中。本研究通过系统发育谱法,利用线虫、酵母和人的蛋白相互作用数据对牛的蛋白相互作用进行预测。结果,得到了一个包含2 95...
旨在对牛蛋白质相互作用网络进行研究,除了为牛的后基因组学提供研究基础外,其研究成果还可运用到牛的生产实践中。本研究通过系统发育谱法,利用线虫、酵母和人的蛋白相互作用数据对牛的蛋白相互作用进行预测。结果,得到了一个包含2 953个蛋白、3 034对相互作用关系的牛蛋白相互作用网络。分析表明该网络具有scale-free属性,同时对预测出的ENSBTAP00000011562等23个未知功能蛋白进行了诠释。通过结合已有的生物学知识和蛋白的已知功能信息对脂代谢相关蛋白的局部网络进行分析,进一步认识了脂代谢相关机理,为改进牛奶质量和提高牛奶产量提供了有效信息。
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关键词
牛
蛋白相互作用
相互作用网络
功能预测
脂代谢
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职称材料
题名
系统发育谱法研究牛蛋白质相互作用网络
1
作者
沈庆航
徐加豹
江明锋
钟金城
机构
动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室
西南民族大学生命科学与技术学院
四川大学生命科学学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期8-17,共10页
基金
四川省青年科技基金(09ZQ026-011)
文摘
旨在对牛蛋白质相互作用网络进行研究,除了为牛的后基因组学提供研究基础外,其研究成果还可运用到牛的生产实践中。本研究通过系统发育谱法,利用线虫、酵母和人的蛋白相互作用数据对牛的蛋白相互作用进行预测。结果,得到了一个包含2 953个蛋白、3 034对相互作用关系的牛蛋白相互作用网络。分析表明该网络具有scale-free属性,同时对预测出的ENSBTAP00000011562等23个未知功能蛋白进行了诠释。通过结合已有的生物学知识和蛋白的已知功能信息对脂代谢相关蛋白的局部网络进行分析,进一步认识了脂代谢相关机理,为改进牛奶质量和提高牛奶产量提供了有效信息。
关键词
牛
蛋白相互作用
相互作用网络
功能预测
脂代谢
Keywords
cattle
protein interaction
interaction network
function prediction
lipid metabolism
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
系统发育谱法研究牛蛋白质相互作用网络
沈庆航
徐加豹
江明锋
钟金城
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
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