期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
基于lncRNA-miRNA-mRNA调控网络的骨关节炎关键基因筛选与分析及中药预测
1
作者
孔德隆
陈彦华
+2 位作者
弭德扬
张浩杰
陈高鹏
《现代中医药》
CAS
2024年第4期109-118,共10页
目的 通过构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络揭示骨关节炎的关键基因,并预测其潜在治疗药物。方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库获取骨关节炎(Osteoarthritis, OA)和正常骨关节样品差异表达的lncRNA和mRNA,...
目的 通过构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络揭示骨关节炎的关键基因,并预测其潜在治疗药物。方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库获取骨关节炎(Osteoarthritis, OA)和正常骨关节样品差异表达的lncRNA和mRNA,并通过miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库预测miRNA,并整合lncRNA-miRNA与miRNA-mRNA表达谱的相互作用,以构建ceRNA网络。将miRNA预测靶基因与差异表达mRNA取交集,构建PPI网络图,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用Coremine Medical数据库筛选核心靶点预测得到的中药。结果 共鉴定出339个DEmRNA和476个lncRNA。在ceRNA网络中总共获得了4个差异的lncRNA-miRNA相互作用和39个失调的miRNA-mRNA相互作用,包括4个DElncRNA,20个miRNA和39个DEmRNA。PPI网络图鉴定出VEGFA、DDIT4、MMP2、SESN1、VCAN等10个靶点可能是调控骨关节炎的核心靶点。随后的富集分析表明,这些mRNA在OA的发展过程中调节了生物代谢、细胞外基质的组织和免疫反应等生物过程,并丰富了HIF-1信号通路和PI3K-Akt信号通路。预测得到丹参、郁金、姜黄、黄芪、白花蛇舌草等中药可能是治疗OA的潜在药物。结论 这项研究为OA中与lncRNA相关的ceRNA网络提供了新颖的见解,丹参、郁金、姜黄、白花蛇舌草可能是治疗OA潜在药物。
展开更多
关键词
lncRNA-miRNA-mRNA
骨关节炎
关键基因
药物预测
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于lncRNA-miRNA-mRNA调控网络的骨关节炎关键基因筛选与分析及中药预测
1
作者
孔德隆
陈彦华
弭德扬
张浩杰
陈高鹏
机构
山东中医药大学
山东中医药大学附属医院
济南市章丘区中医医院
出处
《现代中医药》
CAS
2024年第4期109-118,共10页
基金
山东省中医药科技发展计划项目(2019-0113)
山东省中医药科技项目(2020Q016)。
文摘
目的 通过构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络揭示骨关节炎的关键基因,并预测其潜在治疗药物。方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库获取骨关节炎(Osteoarthritis, OA)和正常骨关节样品差异表达的lncRNA和mRNA,并通过miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库预测miRNA,并整合lncRNA-miRNA与miRNA-mRNA表达谱的相互作用,以构建ceRNA网络。将miRNA预测靶基因与差异表达mRNA取交集,构建PPI网络图,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用Coremine Medical数据库筛选核心靶点预测得到的中药。结果 共鉴定出339个DEmRNA和476个lncRNA。在ceRNA网络中总共获得了4个差异的lncRNA-miRNA相互作用和39个失调的miRNA-mRNA相互作用,包括4个DElncRNA,20个miRNA和39个DEmRNA。PPI网络图鉴定出VEGFA、DDIT4、MMP2、SESN1、VCAN等10个靶点可能是调控骨关节炎的核心靶点。随后的富集分析表明,这些mRNA在OA的发展过程中调节了生物代谢、细胞外基质的组织和免疫反应等生物过程,并丰富了HIF-1信号通路和PI3K-Akt信号通路。预测得到丹参、郁金、姜黄、黄芪、白花蛇舌草等中药可能是治疗OA的潜在药物。结论 这项研究为OA中与lncRNA相关的ceRNA网络提供了新颖的见解,丹参、郁金、姜黄、白花蛇舌草可能是治疗OA潜在药物。
关键词
lncRNA-miRNA-mRNA
骨关节炎
关键基因
药物预测
分类号
R274.9 [医药卫生—中西医结合]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于lncRNA-miRNA-mRNA调控网络的骨关节炎关键基因筛选与分析及中药预测
孔德隆
陈彦华
弭德扬
张浩杰
陈高鹏
《现代中医药》
CAS
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部