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水稻抽穗期的QTL定位及转录组测序分析
1
作者
熊佳铭
张露倩
+5 位作者
袁红亮
易石武
周宇
阮彬洲
张丽颖
王悦
《山东农业科学》
北大核心
2025年第8期1-7,共7页
抽穗期是决定水稻结实粒数的关键时期,极大影响着水稻生育进程,适时抽穗是水稻稳产的前提。为解析水稻抽穗期的遗传特性,本研究设置5月7、17、27日3个播期处理(分别标记为M7、M17、M27),对两个抽穗期相差较大的水稻品种RT与SC及其重组...
抽穗期是决定水稻结实粒数的关键时期,极大影响着水稻生育进程,适时抽穗是水稻稳产的前提。为解析水稻抽穗期的遗传特性,本研究设置5月7、17、27日3个播期处理(分别标记为M7、M17、M27),对两个抽穗期相差较大的水稻品种RT与SC及其重组自交系(RILs)F_(7)代群体的抽穗期进行调查,分析其抽穗期性状的遗传变异特征,同时利用前期构建的遗传图谱对RILs群体进行抽穗期性状的数量性状基因座(QTL)定位,并结合RNA-seq分析挖掘调控水稻抽穗期性状的相关候选基因。结果表明,不同播期处理下的抽穗期表现出连续性变异特点,亲本及其RILs群体的抽穗期性状的变异系数均随着播期的推迟而变大,M7、M17、M27处理的变异系数分别为9.08%、9.29%、14.69%。对RILs群体M7、M17、M27处理下的抽穗期性状进行QTL分析,共检测到4个相关QTL位点,分布在3号和7号染色体上,LOD值(对数优势值)介于3.47~18.63之间,贡献率介于7.46%~26.57%之间。对2个亲本剑叶的RNA-seq结果进行分析,在QTL定位区间内共检测到70个差异表达基因,其中31个基因上调表达,39个基因下调表达。GO功能注释分析结果表明,多数差异表达基因通过参与生物过程调控水稻抽穗期,涉及细胞过程、代谢过程等。KEGG富集通路分析结果表明,差异表达基因主要参与到非同源末端连接修复、维生素B_(6)代谢、光合作用等调控途径。这些QTL位点和候选基因可用于进一步的精细定位和功能分析,对指导水稻抽穗期精细调控的分子育种和生产实践具有重要意义。
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关键词
水稻
抽穗期
遗传分析
QTL定位
转录组测序
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职称材料
题名
水稻抽穗期的QTL定位及转录组测序分析
1
作者
熊佳铭
张露倩
袁红亮
易石武
周宇
阮彬洲
张丽颖
王悦
机构
湖南农业大学农学院
萍乡市农业技术推广中心
湖南省烟草公司邵阳市公司
出处
《山东农业科学》
北大核心
2025年第8期1-7,共7页
基金
湖南省自然科学基金项目(2020JJ4360)
中国烟草总公司湖南省公司科技项目(HN2023KJ03)。
文摘
抽穗期是决定水稻结实粒数的关键时期,极大影响着水稻生育进程,适时抽穗是水稻稳产的前提。为解析水稻抽穗期的遗传特性,本研究设置5月7、17、27日3个播期处理(分别标记为M7、M17、M27),对两个抽穗期相差较大的水稻品种RT与SC及其重组自交系(RILs)F_(7)代群体的抽穗期进行调查,分析其抽穗期性状的遗传变异特征,同时利用前期构建的遗传图谱对RILs群体进行抽穗期性状的数量性状基因座(QTL)定位,并结合RNA-seq分析挖掘调控水稻抽穗期性状的相关候选基因。结果表明,不同播期处理下的抽穗期表现出连续性变异特点,亲本及其RILs群体的抽穗期性状的变异系数均随着播期的推迟而变大,M7、M17、M27处理的变异系数分别为9.08%、9.29%、14.69%。对RILs群体M7、M17、M27处理下的抽穗期性状进行QTL分析,共检测到4个相关QTL位点,分布在3号和7号染色体上,LOD值(对数优势值)介于3.47~18.63之间,贡献率介于7.46%~26.57%之间。对2个亲本剑叶的RNA-seq结果进行分析,在QTL定位区间内共检测到70个差异表达基因,其中31个基因上调表达,39个基因下调表达。GO功能注释分析结果表明,多数差异表达基因通过参与生物过程调控水稻抽穗期,涉及细胞过程、代谢过程等。KEGG富集通路分析结果表明,差异表达基因主要参与到非同源末端连接修复、维生素B_(6)代谢、光合作用等调控途径。这些QTL位点和候选基因可用于进一步的精细定位和功能分析,对指导水稻抽穗期精细调控的分子育种和生产实践具有重要意义。
关键词
水稻
抽穗期
遗传分析
QTL定位
转录组测序
Keywords
Rice
Heading date
Genetic analysis
QTL mapping
RNA-seq
分类号
S511.035.3 [农业科学—作物学]
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1
水稻抽穗期的QTL定位及转录组测序分析
熊佳铭
张露倩
袁红亮
易石武
周宇
阮彬洲
张丽颖
王悦
《山东农业科学》
北大核心
2025
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