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家驴TGF-β基因家族成员的鉴定、表达及多态分析
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作者 黄恩泽 赵舒悦 +4 位作者 王雨数 张欢 殷杰 张翔鳞 党瑞华 《畜牧兽医杂志》 2025年第3期10-19,共10页
转化生长因子-β(TGF-β)基因家族在细胞生长、分化、凋亡以及细胞外基质合成与沉积等多种生物学过程中发挥着关键作用。为了探究该基因家族在驴上的表达情况,本研究对驴TGF-β基因家族进行了系统的调查分析,包括基因鉴定、表达分析及... 转化生长因子-β(TGF-β)基因家族在细胞生长、分化、凋亡以及细胞外基质合成与沉积等多种生物学过程中发挥着关键作用。为了探究该基因家族在驴上的表达情况,本研究对驴TGF-β基因家族进行了系统的调查分析,包括基因鉴定、表达分析及其功能和进化关系的探讨。使用HMMER软件包和BLAST工具对驴TGF-β基因家族成员进行鉴定,并结合多种生物信息学工具对其序列进行了深入分析。此外,运用转录组数据分析该基因家族在不同组织中的表达模式。结果表明,家驴TGF-β基因家族共包含33个成员,编码蛋白质的氨基酸数目为153~507 aa,分子质量在16.19~55.67 kD之间,等电点分布为4.84~11.66,所有成员均为亲水性蛋白。蛋白质二级结构预测表明,TGF-β基因家族成员二级结构以无规则卷曲为主,其次是α-螺旋,最后是β-折叠。亚细胞定位结果显示,31个成员定位于细胞外基质、BMP2位于内质网上、BMP10位于细胞质膜上、BMP7位于线粒体。系统发育分析表明,TGF-β基因家族分为两个亚类,其中驴和人的基因家族成员分别聚集,表明其具有较近的进化关系。转录组数据进一步显示,大多数TGF-β基因家族成员在成年驴的13种组织中均有表达,其中NODAL基因在所有组织中均表现出较高的表达水平。该研究结果为深入解析驴TGF-β基因家族的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 驴 TGF-β基因家族 系统进化 表达分析
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