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HIV-1 Tat与P-TEFb复合物的分子动力学模拟及结合自由能计算
被引量：
1
1
作者
张寅晖
张瑞生
+1 位作者
胡荣静
袁永娜
《兰州大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期114-121,共8页
P-TEFb结构中与Tat蛋白的结合位点是新型抗HIV-1药物设计和虚拟筛选的重要靶标.对含有两个锌指结构的Tat.P-TEFb复合物体系进行了14ns的分子动力学模拟,应用MM-PBSA/GBSA方法计算体系的结合自由能,以及通过基于氨基酸残基的能量分解来...
P-TEFb结构中与Tat蛋白的结合位点是新型抗HIV-1药物设计和虚拟筛选的重要靶标.对含有两个锌指结构的Tat.P-TEFb复合物体系进行了14ns的分子动力学模拟,应用MM-PBSA/GBSA方法计算体系的结合自由能,以及通过基于氨基酸残基的能量分解来探究体系中蛋白质之间的相互作用.结果表明范德华作用能是复合物形成的主要驱动力,Cys261与ZN88之间的配位作用是结合自由能的最大贡献者.根据Tat.P-TEFb体系的动力学结构信息和残基能量分解结果预测了P-TEFb结构中可能的活性位点.位点Ⅰ和位点Ⅱ应可作为基于受体三维结构的抗HIV-1药物分子设计的起始位点.模拟计算的结果可以为进一步指导药物设计奠定基础.
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关键词
HIV-1Tat
P-TEFB
MM-PBSA/GBSA
结合自由能
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职称材料
H2S与CO2共存条件下气田地面集输系统内腐蚀影响因素分析方法研究
被引量：
19
2
作者
李媛
刘世常
张寅晖
《石油与天然气化工》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期82-86,共5页
CO2和H2S是最常见的两种管道内腐蚀介质,当系统中H2S和CO2共存时,其腐蚀行为远比H2S或CO2单独作用时复杂得多,即便是少量的H2S也会对CO2的腐蚀产生明显的影响,对气田开采与管输设备造成严重的破坏,甚至引发设备失效与安全事故。CO2/H2S...
CO2和H2S是最常见的两种管道内腐蚀介质,当系统中H2S和CO2共存时,其腐蚀行为远比H2S或CO2单独作用时复杂得多,即便是少量的H2S也会对CO2的腐蚀产生明显的影响,对气田开采与管输设备造成严重的破坏,甚至引发设备失效与安全事故。CO2/H2S共存体系下的金属腐蚀规律十分复杂且难于把握,与两种因素单一存在时截然不同。国外早期的研究始于20世纪80年代末,国内起步相对较晚。经过近30年的研究,发现腐蚀过程受CO2或H2S的控制取决于两者的含量、介质温度、压力、流速等因素。根据川东气田的气质和工况环境,进行实验研究与深入的理论归纳分析,得出川东气田H2S与CO2共存条件下地面集输系统内腐蚀影响因素及其交互作用的腐蚀影响权重。在此基础上,利用归一化方法,计算出重庆气矿中高含硫气井的腐蚀风险权重值,筛选出腐蚀敏感度较高的需要重点关注的气井及其采气管线。
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关键词
内腐蚀
影响因素
主导因素
归一化处理
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职称材料
题名
HIV-1 Tat与P-TEFb复合物的分子动力学模拟及结合自由能计算
被引量：
1
1
作者
张寅晖
张瑞生
胡荣静
袁永娜
机构
兰州大学化学化工学院
出处
《兰州大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期114-121,共8页
基金
国家自然科学基金项目(90912003
60773108
+2 种基金
90812001
61011130212)
兰州大学自由探索基金项目(lzujbky-2009-63)
文摘
P-TEFb结构中与Tat蛋白的结合位点是新型抗HIV-1药物设计和虚拟筛选的重要靶标.对含有两个锌指结构的Tat.P-TEFb复合物体系进行了14ns的分子动力学模拟,应用MM-PBSA/GBSA方法计算体系的结合自由能,以及通过基于氨基酸残基的能量分解来探究体系中蛋白质之间的相互作用.结果表明范德华作用能是复合物形成的主要驱动力,Cys261与ZN88之间的配位作用是结合自由能的最大贡献者.根据Tat.P-TEFb体系的动力学结构信息和残基能量分解结果预测了P-TEFb结构中可能的活性位点.位点Ⅰ和位点Ⅱ应可作为基于受体三维结构的抗HIV-1药物分子设计的起始位点.模拟计算的结果可以为进一步指导药物设计奠定基础.
关键词
HIV-1Tat
P-TEFB
MM-PBSA/GBSA
结合自由能
Keywords
HIV-1 Tat
P-TEFb
MM-PBSA/GBSA
binding energy
分类号
O641.3 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
H2S与CO2共存条件下气田地面集输系统内腐蚀影响因素分析方法研究
被引量：
19
2
作者
李媛
刘世常
张寅晖
机构
中国石油西南油气田公司重庆气矿
中国石油西南油气田公司天然气研究院
出处
《石油与天然气化工》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期82-86,共5页
文摘
CO2和H2S是最常见的两种管道内腐蚀介质,当系统中H2S和CO2共存时,其腐蚀行为远比H2S或CO2单独作用时复杂得多,即便是少量的H2S也会对CO2的腐蚀产生明显的影响,对气田开采与管输设备造成严重的破坏,甚至引发设备失效与安全事故。CO2/H2S共存体系下的金属腐蚀规律十分复杂且难于把握,与两种因素单一存在时截然不同。国外早期的研究始于20世纪80年代末,国内起步相对较晚。经过近30年的研究,发现腐蚀过程受CO2或H2S的控制取决于两者的含量、介质温度、压力、流速等因素。根据川东气田的气质和工况环境,进行实验研究与深入的理论归纳分析,得出川东气田H2S与CO2共存条件下地面集输系统内腐蚀影响因素及其交互作用的腐蚀影响权重。在此基础上,利用归一化方法,计算出重庆气矿中高含硫气井的腐蚀风险权重值,筛选出腐蚀敏感度较高的需要重点关注的气井及其采气管线。
关键词
内腐蚀
影响因素
主导因素
归一化处理
Keywords
internal corrosion
affecting factor
main factor
normalization treatment
分类号
TE988 [石油与天然气工程—石油机械设备]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HIV-1 Tat与P-TEFb复合物的分子动力学模拟及结合自由能计算
张寅晖
张瑞生
胡荣静
袁永娜
《兰州大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
在线阅读
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职称材料
2
H2S与CO2共存条件下气田地面集输系统内腐蚀影响因素分析方法研究
李媛
刘世常
张寅晖
《石油与天然气化工》
CAS
CSCD
北大核心
2020
19
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职称材料
已选择
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