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条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)线粒体全基因组测序及虾蛄科系统发育分析
1
作者
张千钰
马家乐
+1 位作者
叶莹莹
李继姬
《海洋学报》
北大核心
2025年第9期129-144,共16页
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,2...
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,22个tRNA。对碱基含量分析发现A碱基含量最高为35.42%,G碱基最低为12.83%,选择了虾蛄科11个物种的线粒体基因组进行选择压力分析发现所有PCGs都受到纯化选择。另外通过结合软甲纲下2个亚纲的线粒体基因组的13个PCGs构建了系统发育树,结果发现虾蛄科为单系群,科内物种能够形成一个独立的分支,与其他相关的掠虾亚纲动物(如琴虾蛄科等)有明显的分化。对软甲纲的线粒体基因重排进行比较发现口足目未表现出重排现象。从重建的掠虾亚纲的分歧时间的年代图谱,得到现存物种的分化最早发生在中生代白垩纪期,在新生代物种大量分化。这些结果将更好地帮助人们理解不同虾蛄科物种的亲缘关系,以及软甲纲内各亚纲之间的进化地位与关系。
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关键词
虾蛄科
掠虾亚纲
线粒体基因组
系统发育分析
分歧时间
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题名
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)线粒体全基因组测序及虾蛄科系统发育分析
1
作者
张千钰
马家乐
叶莹莹
李继姬
机构
浙江海洋大学海洋科学与技术学院
浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心
出处
《海洋学报》
北大核心
2025年第9期129-144,共16页
基金
国家自然科学基金(42107301)。
文摘
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,22个tRNA。对碱基含量分析发现A碱基含量最高为35.42%,G碱基最低为12.83%,选择了虾蛄科11个物种的线粒体基因组进行选择压力分析发现所有PCGs都受到纯化选择。另外通过结合软甲纲下2个亚纲的线粒体基因组的13个PCGs构建了系统发育树,结果发现虾蛄科为单系群,科内物种能够形成一个独立的分支,与其他相关的掠虾亚纲动物(如琴虾蛄科等)有明显的分化。对软甲纲的线粒体基因重排进行比较发现口足目未表现出重排现象。从重建的掠虾亚纲的分歧时间的年代图谱,得到现存物种的分化最早发生在中生代白垩纪期,在新生代物种大量分化。这些结果将更好地帮助人们理解不同虾蛄科物种的亲缘关系,以及软甲纲内各亚纲之间的进化地位与关系。
关键词
虾蛄科
掠虾亚纲
线粒体基因组
系统发育分析
分歧时间
Keywords
Squillidae
Stomatopod
mitochondrial genome
phylogenetic analysis
divergence time
分类号
Q951.3 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)线粒体全基因组测序及虾蛄科系统发育分析
张千钰
马家乐
叶莹莹
李继姬
《海洋学报》
北大核心
2025
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