基于转录组测序技术鉴别影响莱芜猪滴水损失的关键基因

1

作者 贾万里 王继英 +4 位作者 李菁璇 王彦平 耿立英 张传生 赵雪艳 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第3期1134-1146,共13页

旨在筛选影响莱芜猪滴水损失的关键基因,以提高猪肉质品质并减少滴水带来的经济损失。本研究选取胴体重为(72.30±1.26)kg的28头莱芜猪(公猪19头,母猪9头),测定48 h滴水损失、肉色、肌内脂肪含量和pH等肉质性状,并进行背最长肌组织... 旨在筛选影响莱芜猪滴水损失的关键基因,以提高猪肉质品质并减少滴水带来的经济损失。本研究选取胴体重为(72.30±1.26)kg的28头莱芜猪(公猪19头,母猪9头),测定48 h滴水损失、肉色、肌内脂肪含量和pH等肉质性状,并进行背最长肌组织的转录组测序。利用滴水损失极端个体(每组各3头公猪,1头母猪),在log 2(差异倍数)≥1且校正后P≤0.01的筛选标准下,筛选差异表达基因。结合差异基因与表型的相关分析和蛋白互作分析进一步鉴别影响莱芜猪滴水损失的关键候选基因。结果发现,莱芜猪滴水损失与肌内脂肪含量以及1 h和24 h肉色a*值呈显著负相关(P<0.05)。滴水损失高、低组间共筛选到166个差异表达基因,这些基因显著富集在与血管系统发育与功能、细胞骨架与运动、蛋白质调控与功能等相关的GO条目和通路中。在28个个体中的相关性分析发现,差异表达基因中有110个基因与滴水损失呈显著相关(P<0.05),前10位显著相关的差异表达基因包含了KLF 2和IGF 2等功能上与滴水损失密切相关的基因。进一步的蛋白互作分析发现,差异表达基因中UBR 1和TTBK 2所表达的蛋白与其它蛋白存在最多的互作,其基因mRNA表达量与滴水损失显著相关(P<0.05),且已报道的基因功能也与滴水损失密切相关。因此,结合差异表达基因分析、相关性分析和蛋白互作分析将KLF2、IGF2、UBR 1和TTBK 2作为影响滴水损失的重要候选基因。本研究为猪滴水损失分子机制的解析奠定基础,也为猪肉质性状改良提供了重要借鉴。 展开更多

关键词 莱芜猪 滴水损失 RNA测序 肉质性状 候选基因

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4个绵羊品种线粒体细胞色素b基因的序列差异和系统进化研究 被引量：27

2

作者 张传生 耿立英 +2 位作者 万海伟 李吉涛 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期313-317,共5页

测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,... 测定了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊和鲁北白山羊5个品种羊415bp线粒体DNA细胞色素b基因片段,其中44个位点检出变异。分析其碱基组成和变异情况,并以鲁北白山羊为外群,用UPGMA和NJ法构建了一系列分子系统树,得到相同的拓扑结构,在分子水平从母系遗传的角度澄清4个绵羊品种的起源分化关系。结果显示:在4个绵羊品种之间,洼地绵羊与滩羊关系最近与小尾寒羊亲缘关系最远。绵羊品种内的平均差异为0185%,线粒体DNA多态性相对贫乏,推测4个品种绵羊具有共同的母系祖先。 展开更多

关键词 线粒体细胞色素B基因 绵羊品种 系统进化 序列差异 线粒体DNA多态性 鲁北白山羊 小尾寒羊 洼地绵羊 分子系统树 UPGMA 大尾寒羊 基因片段 碱基组成 拓扑结构 起源分化 母系遗传 分子水平 亲缘关系 平均差 滩羊 变异 种羊

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奶牛OLR1 3'UTR A223C多态的生物学信息分析 被引量：3

3

作者 张传生 耿立英 +3 位作者 尹春光 曹顶国 刘铮铸 付志新 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第1期75-77,共3页

[目的]探索氧化型低密度脂蛋白受体OLR1 3'UTR A223C多态与奶牛乳脂率高低紧密关联的分子机制。[方法]用miRanda(1.0)软件装载牛microRNA数据库,预测OLR1 3'UTR潜在的microRNA。[结果]共预测16个microRNA靶标,OLR1 3'UTR A2... [目的]探索氧化型低密度脂蛋白受体OLR1 3'UTR A223C多态与奶牛乳脂率高低紧密关联的分子机制。[方法]用miRanda(1.0)软件装载牛microRNA数据库,预测OLR1 3'UTR潜在的microRNA。[结果]共预测16个microRNA靶标,OLR1 3'UTR A223C突变定位于bta-miR-370靶标种子序列的互补区。[结论]由于OLR1 3'UTR A→C突变导致bta-miR-370靶标的消失,为OLR1 3'UTR A223C多态与奶牛乳脂率高低紧密关联的分子机制深入研究提供依据。 展开更多

关键词 OLR1 3'UTR mir-370 生物信息 MICRORNA

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鸡cENS-2基因U3-R序列的克隆分析与表达载体的构建 被引量：1

4

作者 张传生 耿立英 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期987-990,共4页

克隆并测序了1.2 kb的鸡cENS-2(chicken normastem cell gene-2,cENS-2)基因3′端U3-R样结构调控序列。经序列分析和同源性比较表明,所克隆的U3-R序列包含多个转录因子结合位点如AP-1、GATA-1等,同时还包括一个重要的顺式调控元件B区,... 克隆并测序了1.2 kb的鸡cENS-2(chicken normastem cell gene-2,cENS-2)基因3′端U3-R样结构调控序列。经序列分析和同源性比较表明,所克隆的U3-R序列包含多个转录因子结合位点如AP-1、GATA-1等,同时还包括一个重要的顺式调控元件B区,该区域在鸡正常的胚胎干细胞中有特异的增强子活性。该序列经pMD-18T载体过渡后,定向连接于切去启动子的pEGFP-N1载体的上游,构建了鸡cENS-2基因U3-R样序列调控的绿色荧光蛋白基因报告载体,为下一步对鸡胚胎干细胞(CES)细胞标记研究打下基础。 展开更多

关键词 鸡胚胎于细胞 cENS-2 U3-R 绿色荧光蛋白

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服药时应避免损伤食管黏膜 被引量：1

5

作者 张传生 《求医问药》 2008年第4期25-25,共1页

人们在服用药物以后,有时药物会黏附于用药者的食管内壁黏膜上,并对其造成损伤。医学研究表明：药物在入胃前可依次经过3处食管的狭窄部位：食管起始处、食管与左支气管的交叉处和食管经过膈的食管裂孔处。人们服用药物时,药物就可能停... 人们在服用药物以后,有时药物会黏附于用药者的食管内壁黏膜上,并对其造成损伤。医学研究表明：药物在入胃前可依次经过3处食管的狭窄部位：食管起始处、食管与左支气管的交叉处和食管经过膈的食管裂孔处。人们服用药物时,药物就可能停留并黏附于这些部位的食管内壁黏膜上。在下面的情况下服药,药物黏附在食管黏膜上的几率会更大：①干吞药物。 展开更多

关键词 食管黏膜 损伤 服药 用药物 狭窄部位 医学研究 食管裂孔 黏附

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山东地方鸡种遗传距离与聚类分析方法比较研究 被引量：54

6

作者 陈红菊 岳永生 +2 位作者 樊新忠 张传生 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期33-36,共4页

选用5个多态性较好的微卫星标记,检测了山东省仅存的5个地方鸡种:寿光鸡、日照麻鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡、鲁西斗鸡,以及一个外来鸡种———安卡黄鸡和一个外省地方鸡种———广西黄鸡共7个鸡种的遗传多样性。根据测试结果计算了每个... 选用5个多态性较好的微卫星标记,检测了山东省仅存的5个地方鸡种:寿光鸡、日照麻鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡、鲁西斗鸡,以及一个外来鸡种———安卡黄鸡和一个外省地方鸡种———广西黄鸡共7个鸡种的遗传多样性。根据测试结果计算了每个等位基因的频率,并以基因频率为基础计算了Nei氏标准遗传距离(Ds)和DA遗传距离,发现日照麻鸡与济宁百日鸡的距离最近,而鲁西斗鸡与其他6个鸡种距离都较远。根据两种遗传距离分别进行了NJ法和UPGMA法聚类,得到4个聚类图。结果表明:DA遗传距离的UPGMA聚类图比较可靠。 展开更多

关键词 山东 地方鸡种 遗传距离 聚类分析 的微卫星标记 遗传多样性

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同构影射及在数字通信电路中的应用

7

作者 张传生 《无线电工程》 1994年第2期26-29,共4页

本文介绍了两个二元域{0,1}和{+1,-1}之间的同构影射在数字通信及信号处理电路中的应用。

关键词 同构影射 数字通信 信息处理 电路

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山羊MyoG基因启动子区序列分析与结构预测 被引量：11

8

作者 刘铮铸 巩元芳 +4 位作者 张文香 付志新 张传生 宋瑜 马艳华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期29-36,共8页

为探明山羊MyoG基因的启动子序列与结构及转录调控机制,本研究设计了1对引物,采用PCR扩增、测序以及序列比对分析,从波尔山羊基因组中扩增出一段长度为969bp的山羊MyoG基因的5′侧翼序列,其GC含量为50.6%。经过生物信息学分析,确定了其... 为探明山羊MyoG基因的启动子序列与结构及转录调控机制,本研究设计了1对引物,采用PCR扩增、测序以及序列比对分析,从波尔山羊基因组中扩增出一段长度为969bp的山羊MyoG基因的5′侧翼序列,其GC含量为50.6%。经过生物信息学分析,确定了其转录起始位点及活性区域;发现在转录起始位点上游-24bp处存在1个TATA-box,另外还发现了1个GC-box、2个CAAT-box、2个E-box和1个富含A-T碱基的模体结构;该序列还包含HSF、ADR1和cap等转录因子结合位点。通过比对分析,所得山羊MyoG基因5′侧翼序列与牛、马鹿、人、小鼠和鸡同源序列的相似性在37.22%～96.85%之间,说明不同物种间该序列具有一定的保守性。本研究为进一步探讨山羊MyoG基因的表达和调控机制奠定了理论基础。 展开更多

关键词 山羊 MYOG基因 启动子区 序列分析 结构预测

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波尔山羊MyoG基因的鉴定和序列分析 被引量：19

9

作者 刘铮铸 巩元芳 +4 位作者 张传生 付志新 张文香 李付春 房秀敏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1337-1341,共5页

为了探明山羊MyoG基因的序列结构及其对肌肉的分化调控机制,用PCR产物直接测序的方法获得了波尔山羊MyoG基因2363bp长的DNA序列,并对该序列进行了分析。结果表明,波尔山羊MyoG基因包括3个外显子、2个内含子及部分5′UTR(74bp)和3′UTR(2... 为了探明山羊MyoG基因的序列结构及其对肌肉的分化调控机制,用PCR产物直接测序的方法获得了波尔山羊MyoG基因2363bp长的DNA序列,并对该序列进行了分析。结果表明,波尔山羊MyoG基因包括3个外显子、2个内含子及部分5′UTR(74bp)和3′UTR(260bp)区,编码序列长675bp,共编码224个氨基酸。结构分析表明,该序列所编码的肽链没有信号肽,第1～138个氨基酸为波尔山羊MyoG基因的bHLH结构域。通过比对分析波尔山羊与已知的GenBank中的人类及其它物种MyoG基因发现,该基因编码区核苷酸以及推测的氨基酸同源性和物种间的亲缘关系相一致,无根系统进化树的聚类结果与这些物种本身的生理特性以及传统分类学中已知的生物分类结果相一致。波尔山羊MyoG基因的鉴定及序列分析为山羊肌肉发育调控的机理以及肉质改良等的研究提供了很好的生物学基础信息。 展开更多

关键词 波尔山羊 MYOG基因 序列分析

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坝上长尾鸡品种资源调查报告 被引量：19

10

作者 刘小辉 李祥龙 +4 位作者 周荣艳 李兰会 张传生 王茂森 李海明 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第6期182-187,共6页

坝上长尾鸡是坝上人民经长期选育，逐步形成的体型外貌和生产性能相对稳定的优质蛋肉兼用型地方品种，因分布于河北北部的承德、张家口坝上地区而得名，外形偏于蛋用型鸡，体型小，体躯较长，尾羽高翘，背线呈V形，主要特征是尾羽较长... 坝上长尾鸡是坝上人民经长期选育，逐步形成的体型外貌和生产性能相对稳定的优质蛋肉兼用型地方品种，因分布于河北北部的承德、张家口坝上地区而得名，外形偏于蛋用型鸡，体型小，体躯较长，尾羽高翘，背线呈V形，主要特征是尾羽较长，公鸡有2～3根大翘羽，所测得的数据中最长达52cm。母鸡尾羽上翘，主尾羽长15～20cm，分两侧呈八字形。蛋白透明、口感弹性细腻，蛋黄大，呈金黄色，该鸡具有野外觅食力强、耐粗饲、抗病力强、肉嫩味美等特点。通过本次调研将坝上长尾鸡数量最多的沽源县长梁乡、平定堡镇和康保县丹清河乡作为重点保种基地，设立保种场，进一步建立保种核心群。同时，对坝上长尾鸡进行系统选育，巩固和提高其原有优良性状与特性。 展开更多

关键词 坝上长尾鸡 资源调查 保种 选育

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山羊MyoG基因内含子Ⅱ变异及其在体质量上的遗传效应分析 被引量：8

11

作者 刘铮铸 巩元芳 +4 位作者 付志新 张传生 张文香 宋瑜 马艳华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1015-1021,共7页

旨在研究MyoG基因内含子Ⅱ多态性与波尔山羊及其级进杂交后代部分生长性状的关系。以纯种波尔山羊及波尔山羊与唐山奶山羊级进杂交一代(F1)、二代(F2)和三代(F3)为研究对象,采用测序和PCR-RFLP方法对山羊MyoG基因遗传多态性进行分析,并... 旨在研究MyoG基因内含子Ⅱ多态性与波尔山羊及其级进杂交后代部分生长性状的关系。以纯种波尔山羊及波尔山羊与唐山奶山羊级进杂交一代(F1)、二代(F2)和三代(F3)为研究对象,采用测序和PCR-RFLP方法对山羊MyoG基因遗传多态性进行分析,并研究基因型对初生体质量、1月龄体质量和断奶体质量的影响。结果在MyoG基因内含子Ⅱ的1 823bp处(依据序列号:FJ607135)发现了1个SNP(C→T),且存在3种基因型(AA、AB和BB),这3种基因型在波尔山羊和波唐级进杂交后代4个群体中的分布基本一致,B等位基因为优势等位基因。通过对有效等位基因数(Ne)、群体杂合度(H)、Shannons信息指数(I)和多态信息含量(PIC)等群体遗传参数的计算,发现此SNP是1个中、低多态位点。最小二乘分析结果表明,AA基因型与其它2种基因型比较有较小的初生体质量且达到显著水平(P<0.05),而对于1月龄体质量和断奶体质量,3种基因型间虽未达显著水平(P>0.05),但具AA基因型个体的表型值明显低于具其它2种基因型个体的表型值,AA、AB和BB 3种基因型在这3个生长性状的大小排列顺序均为BB>AB>AA。推测MyoG基因对山羊生长性状存在一定影响,提示选择带有B等位基因的个体有望提高山羊体质量相关的生长性状。 展开更多

关键词 山羊 MYOG基因 遗传多态性 遗传效应

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坝上长尾鸡MITF基因核心启动子鉴定与分析 被引量：5

12

作者 刘小辉 彭永东 +2 位作者 周荣艳 张传生 李祥龙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1116-1123,共8页

旨在探明坝上长尾鸡小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)基因启动子活性区与结构,为研究MITF基因在毛囊组织中的表达调控提供依据。本研究采用双荧光素酶表达载体的方法,构建了6个含有不同长度... 旨在探明坝上长尾鸡小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)基因启动子活性区与结构,为研究MITF基因在毛囊组织中的表达调控提供依据。本研究采用双荧光素酶表达载体的方法,构建了6个含有不同长度坝上长尾鸡MITF基因启动子片段的pGL3-Basic表达载体及4个核心启动子区突变载体,转染DF1细胞48h后检测双荧光素酶活性。结果,确定了鸡MITF基因启动子的核心区域为-660^+200bp。其中突变位点-579bp、-505bp、-274bp、-220bp、-203^-202bp、-98bp、-46bp、-14bp、+1bp、+28bp对MITF基因启动子活性有较大影响,在突变区域预测到HOX家族(HOXA3、HOXD8、HOXD9、HOXD10、HOX11)、NF-1、DBP、TFIID和TFIIB与MITF序列的结合性发生了变化。 展开更多

关键词 坝上长尾鸡 MITF基因 启动子 转录因子

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善待黑痣防恶变

13

作者 张传生 《求医问药》 2005年第11期15-16,共2页

关键词 黑痣 发病率 恶性黑色素瘤 正常皮肤 激光 恶变 紫外线照射 免疫缺陷 皮肤科医生 复发转移

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警惕双侧乳腺癌

14

作者 张传生 《求医问药》 2005年第7期12-13,共2页

关键词 双侧乳腺癌 乳腺癌患者 恶性肿瘤 乳腺癌术后 高危因素 异时发生 转移灶 绝经前 年轻女性 双侧原发性乳腺癌

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肺功能正常是胸腹部手术的坚强支柱

15

作者 张传生 《求医问药》 2005年第5期15-15,共1页

关键词 肺功能 胸腹部手术 呼吸功能 正常值 肺通气量 评价指标 开胸手术 肺组织 上消化道钡餐 医院

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利用正交试验法优化配置遗传算法参数 被引量：6

16

作者 丁承民 张传生 刘贵忠 《西安交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第9期81-86,共6页

针对遗传算法参数多，且配置困难的问题，提出一种利用正交试验优化选择参数的方法，它使得对于不同领域的优化问题只需用正交试验进行一次参数配置，然后用遗传算法进行具体寻优即可取得较好效果．这种方法易于编程的实现，且在一定程... 针对遗传算法参数多，且配置困难的问题，提出一种利用正交试验优化选择参数的方法，它使得对于不同领域的优化问题只需用正交试验进行一次参数配置，然后用遗传算法进行具体寻优即可取得较好效果．这种方法易于编程的实现，且在一定程度上避免了遗传算法参数配置的盲目性． 展开更多

关键词 遗传算法 正交试验 参数配置 最佳化

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怎样鉴别和治疗骨转移癌——异常腰腿痛患者要警惕骨转移癌

17

作者 张传生 《求医问药》 2007年第4期22-23,共2页

老颜今年50岁,是一位农民出身的采矿业老板。平时除了开会谈生意之外,大多数的时间他都和工人们一起在作业现场忙个不停。由于常年在潮湿的环境里工作,老颜落下个腰腿痛的毛病。最近一段时间,老颜的腰痛频繁发作。

关键词 骨转移癌 腰腿痛 溶骨性

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怎样防治咳嗽晕厥综合征

18

作者 张传生 《求医问药》 2007年第3期11-11,共1页

我父亲今年75岁,喜好抽烟,其烟龄少说也有50年了。平时他身体没啥大毛病。可近十多年来,他每到冬春季节就咳嗽、痰多。前几天,他竟在剧烈咳嗽时突然晕倒,虽然一会儿就自己醒了过来,但却摔伤了。经过医生的详细检查,他被确诊为“咳嗽晕... 我父亲今年75岁,喜好抽烟,其烟龄少说也有50年了。平时他身体没啥大毛病。可近十多年来,他每到冬春季节就咳嗽、痰多。前几天,他竟在剧烈咳嗽时突然晕倒,虽然一会儿就自己醒了过来,但却摔伤了。经过医生的详细检查,他被确诊为“咳嗽晕厥综合征”。请问,这种病到底是怎么回事,应怎样防治? 展开更多

关键词 咳嗽晕厥综合征 一过性意识丧失 肺部疾病

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细胞色素b基因标记绵羊种内亲缘关系的初步研究 被引量：1

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作者 耿立英 张传生 +4 位作者 尹春光 曹顶国 杜立新 刘铮铸 付志新 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第33期18871-18873,共3页

[目的]从群体的角度,初步探讨细胞色素b(Cytb)基因标记绵羊种内亲缘关系。[方法]用PCR方法扩增出滩羊和洼地绵羊2个地方绵羊品种共112个个体的线粒体DNA(m tDNA)Cytb基因,用限制性内切酶EcoRΙ对其进行限制性长度多态性(RFLP)分析。[结... [目的]从群体的角度,初步探讨细胞色素b(Cytb)基因标记绵羊种内亲缘关系。[方法]用PCR方法扩增出滩羊和洼地绵羊2个地方绵羊品种共112个个体的线粒体DNA(m tDNA)Cytb基因,用限制性内切酶EcoRΙ对其进行限制性长度多态性(RFLP)分析。[结果]在56个滩羊样品中,有51个个体检测到1个酶切位点,5个个体没有检测到切点,呈现出2种限制性态型。在56个洼地绵羊样品中均能检测到酶切位点,表现为1种限制性态型。[结论]受试绵羊品种线粒体DNA多态性较贫乏,且m tDNA Cytb基因在绵羊品种内、品种间都有很强的保守性。因此,Cytb基因标记绵羊种内亲缘关系有一定的局限性。 展开更多

关键词 绵羊 细胞色素B基因 种内亲缘关系

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级联码结合交织技术的纠错性能研究 被引量：8

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作者 王霞 张传生 张荷芳 《无线通信技术》 2000年第2期29-32,共4页

本文将格状编码调制 (TCM )技术与RS纠错码相结合 ,研究在数字传输系统中的纠错性能与抗干扰能力 ,给出了数据交织与非交织条件下差错控制系统的计算机模拟结果。模拟结果表明 :采用级联码与交织技术可使信道传输的误码率从 1 0 -3 降至... 本文将格状编码调制 (TCM )技术与RS纠错码相结合 ,研究在数字传输系统中的纠错性能与抗干扰能力 ,给出了数据交织与非交织条件下差错控制系统的计算机模拟结果。模拟结果表明 :采用级联码与交织技术可使信道传输的误码率从 1 0 -3 降至 1 0 -7,编码增益提高 35dB。 展开更多

关键词 交织技术 级联码 纠错性能 编码增益 格状编码调制 误码率 数字传输系统 纠错码 数据 抗干扰能力

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