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江西省三个地方鸡种群体有效规模的估算
被引量:
1
1
作者
王樟凤
朱学农
+5 位作者
饶昕昊
肖月玲
陈颖
柴学文
张仁颠
饶友生
《中国家禽》
北大核心
2016年第20期10-15,共6页
在鸡1号染色体(GGA1)的Contig.060226.1上一个500 kb的区域选取30个SNP位点,研究江西省三个地方鸡种(宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡)的单核苷酸多态性及连锁不平衡模式,估算其不同世代的群体有效规模大小。结果显示:在鸡驯养的较早期...
在鸡1号染色体(GGA1)的Contig.060226.1上一个500 kb的区域选取30个SNP位点,研究江西省三个地方鸡种(宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡)的单核苷酸多态性及连锁不平衡模式,估算其不同世代的群体有效规模大小。结果显示:在鸡驯养的较早期阶段(t=769),各品种的群体有效规模较大,宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡分别为4 074、3 090、1 480;在鸡驯养的较晚期阶段,宁都黄鸡(t≤59)的群体有效规模为550,白耳黄鸡、安义瓦灰鸡(t≤45)分别为300、277。使用Sved模型对连锁不平衡系数r^2及传递的物理距离进行拟合,结果发现:宁都黄鸡、安义瓦灰鸡拟合状况良好(P=0.0272,R2=0.9196;P=0.0193,R^2=0.7276);白耳黄鸡虽未达到显著水平(P=0.3837,R^2=0.2541),但也表现出逐步递减的趋势,其r^2总变异方差的25.41%是由传递距离引起的。表明对宁都黄鸡、安义瓦灰鸡群体有效规模的估算相对准确,对白耳黄鸡群体有效规模的估算可能有偏。研究结果对于江西省三个地方鸡种特别是宁都黄鸡、安义瓦灰鸡的原位保存有重要的理论指导意义。
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关键词
宁都黄鸡
白耳黄鸡
安义瓦灰鸡
连锁不平衡
群体有效规模
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职称材料
题名
江西省三个地方鸡种群体有效规模的估算
被引量:
1
1
作者
王樟凤
朱学农
饶昕昊
肖月玲
陈颖
柴学文
张仁颠
饶友生
机构
南昌师范学院生物技术研究所
南昌大学软件学院
出处
《中国家禽》
北大核心
2016年第20期10-15,共6页
基金
江西省自然科学基金项目(2010GZN0021)
国家自然科学基金项目(31460595)
南昌师范学院分子育种创新团队项目
文摘
在鸡1号染色体(GGA1)的Contig.060226.1上一个500 kb的区域选取30个SNP位点,研究江西省三个地方鸡种(宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡)的单核苷酸多态性及连锁不平衡模式,估算其不同世代的群体有效规模大小。结果显示:在鸡驯养的较早期阶段(t=769),各品种的群体有效规模较大,宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡分别为4 074、3 090、1 480;在鸡驯养的较晚期阶段,宁都黄鸡(t≤59)的群体有效规模为550,白耳黄鸡、安义瓦灰鸡(t≤45)分别为300、277。使用Sved模型对连锁不平衡系数r^2及传递的物理距离进行拟合,结果发现:宁都黄鸡、安义瓦灰鸡拟合状况良好(P=0.0272,R2=0.9196;P=0.0193,R^2=0.7276);白耳黄鸡虽未达到显著水平(P=0.3837,R^2=0.2541),但也表现出逐步递减的趋势,其r^2总变异方差的25.41%是由传递距离引起的。表明对宁都黄鸡、安义瓦灰鸡群体有效规模的估算相对准确,对白耳黄鸡群体有效规模的估算可能有偏。研究结果对于江西省三个地方鸡种特别是宁都黄鸡、安义瓦灰鸡的原位保存有重要的理论指导意义。
关键词
宁都黄鸡
白耳黄鸡
安义瓦灰鸡
连锁不平衡
群体有效规模
Keywords
Ningdu Huang chicken
Baler Huang chicken
Anyi Wahui chicken
linkage disequilibrium
effectivepopulation size
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
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1
江西省三个地方鸡种群体有效规模的估算
王樟凤
朱学农
饶昕昊
肖月玲
陈颖
柴学文
张仁颠
饶友生
《中国家禽》
北大核心
2016
1
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