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基于BSA-seq和GWAS技术的豇豆花色基因定位分析
1
作者
胡格格
朱姝萌
+4 位作者
苏晓佳
康研
刘明慧
郭瑞
潘磊
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第7期1459-1468,I0034-I0040,共17页
豇豆(Vigna unguiculata)是主要豆科农作物之一,广泛分布在全球热带和亚热带地区,我国各地均有种植。豇豆花色是一种重要农艺性状,在其繁殖过程中发挥着重要作用,但是豇豆花色变异的分子遗传基础尚不清楚。为此,采用基于重组自交系群体...
豇豆(Vigna unguiculata)是主要豆科农作物之一,广泛分布在全球热带和亚热带地区,我国各地均有种植。豇豆花色是一种重要农艺性状,在其繁殖过程中发挥着重要作用,但是豇豆花色变异的分子遗传基础尚不清楚。为此,采用基于重组自交系群体花色的BSA-seq分析与豇豆自然群体(271份)花色的全基因组关联分析相结合,将控制花色的基因定位于第9号染色体上31.9 Mb~32.3 Mb之间(0.4 Mb)。分析表明该区间包含30个基因,其中TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)基因位于SNP-index峰值附近,且在拟南芥中参与调控花青素的生物合成。进一步采用RT-qPCR分析发现,紫色和白色旗瓣的TTG1基因表达量存在显著差异。此外,在该区域内筛选出2对多态性SSR引物,能够区分RILs群体中紫色和白色旗瓣个体。本研究结果可为豇豆花色遗传变异和分子育种提供一定的理论依据。
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关键词
豇豆
花色
BSA-seq
全基因组关联分析
分子标记
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职称材料
题名
基于BSA-seq和GWAS技术的豇豆花色基因定位分析
1
作者
胡格格
朱姝萌
苏晓佳
康研
刘明慧
郭瑞
潘磊
机构
江汉大学生命科学学院/湖北省食用豆类植物自然科技资源中心/湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心
出处
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第7期1459-1468,I0034-I0040,共17页
基金
国家自然科学基金项目(31501369)
湖北省科技计划自然科学基金面上项目(2017CFB442)
+1 种基金
湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心开放基金项目(2019-01)
湖北省科技创新基地(平台)计划(2024CFA018)。
文摘
豇豆(Vigna unguiculata)是主要豆科农作物之一,广泛分布在全球热带和亚热带地区,我国各地均有种植。豇豆花色是一种重要农艺性状,在其繁殖过程中发挥着重要作用,但是豇豆花色变异的分子遗传基础尚不清楚。为此,采用基于重组自交系群体花色的BSA-seq分析与豇豆自然群体(271份)花色的全基因组关联分析相结合,将控制花色的基因定位于第9号染色体上31.9 Mb~32.3 Mb之间(0.4 Mb)。分析表明该区间包含30个基因,其中TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)基因位于SNP-index峰值附近,且在拟南芥中参与调控花青素的生物合成。进一步采用RT-qPCR分析发现,紫色和白色旗瓣的TTG1基因表达量存在显著差异。此外,在该区域内筛选出2对多态性SSR引物,能够区分RILs群体中紫色和白色旗瓣个体。本研究结果可为豇豆花色遗传变异和分子育种提供一定的理论依据。
关键词
豇豆
花色
BSA-seq
全基因组关联分析
分子标记
Keywords
cowpea
flower color
BSA-seq
genome-wide association analysis
molecular marker
分类号
S643.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于BSA-seq和GWAS技术的豇豆花色基因定位分析
胡格格
朱姝萌
苏晓佳
康研
刘明慧
郭瑞
潘磊
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025
0
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