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小麦穗粒数QTL整合与元分析
被引量:
4
1
作者
左煜昕
马靖福
+6 位作者
刘媛
张沛沛
栗孟飞
程宏波
陈思瑾
幸华
杨德龙
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期771-779,共9页
小麦穗粒数是由多基因控制的复杂数量性状。为发掘控制小麦穗粒数(KNS)的真实主效数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),本研究利用生物信息学手段,借助小麦高密度分子标记遗传图谱,对来自不同遗传作图群体的控制小麦穗粒数的163...
小麦穗粒数是由多基因控制的复杂数量性状。为发掘控制小麦穗粒数(KNS)的真实主效数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),本研究利用生物信息学手段,借助小麦高密度分子标记遗传图谱,对来自不同遗传作图群体的控制小麦穗粒数的163个QTL位点进行图谱整合、映射和元分析。结果表明,目标性状QTL在小麦21条染色体上不均匀分布,在2B染色体上最多,在7D染色体上最少;建立控制小麦KNS的QTL一致性图谱,最终获得35个一致性QTL(meta quantitative trait loci,MQTL)位点及其紧密连锁的候选分子标记,置信区间最小可达到0.55cM。
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关键词
小麦
穗粒数
元分析
一致性QTL
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职称材料
基于全基因组SNP标记的抗旱冬小麦品种的遗传多样性分析
被引量:
3
2
作者
左煜昕
马靖福
+5 位作者
刘媛
张沛沛
栗孟飞
程宏波
陈思瑾
杨德龙
《甘肃农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期47-54,共8页
【目的】研究分析124份优异抗旱冬小麦的亲缘关系和遗传多样性,为小麦抗旱亲本选择提供理论依据.【方法】利用35K基因芯片对小麦全基因组进行扫描,并在PowermarkerV3.2.5中计算等位变异频率、遗传多样性指数和多态性信息量;采用非加权...
【目的】研究分析124份优异抗旱冬小麦的亲缘关系和遗传多样性,为小麦抗旱亲本选择提供理论依据.【方法】利用35K基因芯片对小麦全基因组进行扫描,并在PowermarkerV3.2.5中计算等位变异频率、遗传多样性指数和多态性信息量;采用非加权平均法(UPGMA)对124份小麦材料进行分类.【结果】通过全基因组扫描,共筛选出15947个多态性SNP标记,每个多态性SNP位点平均等位变异频率为0.75,遗传多样性指数为0.35,多态性信息量为0.31,根据遗传相似系数,采用UPGMA在遗传相似系数0.38处将124份冬小麦材料分为7个亚群.【结论】在长期的育种过程中促进了不同区域的小麦种质材料之间的基因交流,但是在部份相同地理来源的材料之间的遗传多样性仍较差,因此在育种过程中应该引进新的品种,丰富小麦的遗传背景.
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关键词
小麦
抗旱品种
SNP标记
遗传多样性
聚类分析
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职称材料
题名
小麦穗粒数QTL整合与元分析
被引量:
4
1
作者
左煜昕
马靖福
刘媛
张沛沛
栗孟飞
程宏波
陈思瑾
幸华
杨德龙
机构
甘肃省干旱生境作物学重点实验室
甘肃农业大学生命科学技术学院
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期771-779,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31760385,31460348)
甘肃省现代农业产业技术体系项目(GARS-01-04)。
文摘
小麦穗粒数是由多基因控制的复杂数量性状。为发掘控制小麦穗粒数(KNS)的真实主效数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),本研究利用生物信息学手段,借助小麦高密度分子标记遗传图谱,对来自不同遗传作图群体的控制小麦穗粒数的163个QTL位点进行图谱整合、映射和元分析。结果表明,目标性状QTL在小麦21条染色体上不均匀分布,在2B染色体上最多,在7D染色体上最少;建立控制小麦KNS的QTL一致性图谱,最终获得35个一致性QTL(meta quantitative trait loci,MQTL)位点及其紧密连锁的候选分子标记,置信区间最小可达到0.55cM。
关键词
小麦
穗粒数
元分析
一致性QTL
Keywords
Wheat
Kernel number per spike
Meta-analysis
Consensus QTL
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
基于全基因组SNP标记的抗旱冬小麦品种的遗传多样性分析
被引量:
3
2
作者
左煜昕
马靖福
刘媛
张沛沛
栗孟飞
程宏波
陈思瑾
杨德龙
机构
甘肃省干旱生境作物学重点实验室
甘肃农业大学生命科学技术学院
出处
《甘肃农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期47-54,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31760385,31460348)
甘肃省现代农业产业技术体系项目(GARS-01-04)
文摘
【目的】研究分析124份优异抗旱冬小麦的亲缘关系和遗传多样性,为小麦抗旱亲本选择提供理论依据.【方法】利用35K基因芯片对小麦全基因组进行扫描,并在PowermarkerV3.2.5中计算等位变异频率、遗传多样性指数和多态性信息量;采用非加权平均法(UPGMA)对124份小麦材料进行分类.【结果】通过全基因组扫描,共筛选出15947个多态性SNP标记,每个多态性SNP位点平均等位变异频率为0.75,遗传多样性指数为0.35,多态性信息量为0.31,根据遗传相似系数,采用UPGMA在遗传相似系数0.38处将124份冬小麦材料分为7个亚群.【结论】在长期的育种过程中促进了不同区域的小麦种质材料之间的基因交流,但是在部份相同地理来源的材料之间的遗传多样性仍较差,因此在育种过程中应该引进新的品种,丰富小麦的遗传背景.
关键词
小麦
抗旱品种
SNP标记
遗传多样性
聚类分析
Keywords
wheat
drought-tolerant cultivar
SNP marker
genetic diversity
clustering analysis
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦穗粒数QTL整合与元分析
左煜昕
马靖福
刘媛
张沛沛
栗孟飞
程宏波
陈思瑾
幸华
杨德龙
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于全基因组SNP标记的抗旱冬小麦品种的遗传多样性分析
左煜昕
马靖福
刘媛
张沛沛
栗孟飞
程宏波
陈思瑾
杨德龙
《甘肃农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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