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牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
岳英伟
王鑫
+2 位作者
杜淼
马文芝
郭宏
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第2期311-318,共8页
试验旨在对牛MARK2、CREB5基因进行克隆和生物信息学分析。首先在GenBank数据库中利用人MARK2和CREB5基因序列比对获得牛的表达序列标签(ESTs)的序列,进行引物设计并利用RT-PCR方法从牛肩胛骨肌肉中克隆出MARK2和CREB5基因的cDNA序列,...
试验旨在对牛MARK2、CREB5基因进行克隆和生物信息学分析。首先在GenBank数据库中利用人MARK2和CREB5基因序列比对获得牛的表达序列标签(ESTs)的序列,进行引物设计并利用RT-PCR方法从牛肩胛骨肌肉中克隆出MARK2和CREB5基因的cDNA序列,补足空缺部分,最终获得牛MARK2和CREB5基因。通过对牛MARK2和CREB5基因的生物学特性进行分析可知:牛MARK2基因的编码区长为2 076bp,编码691个氨基酸,CREB5基因的编码区长1 527bp,编码508个氨基酸;经蛋白质理化性质预测MARK2和CREB5蛋白均为亲水性蛋白;MARK2和CREB5蛋白的磷酸化位点均分布于苏氨酸(Thr)、丝氨酸(Ser)和酪氨酸(Tyr)残基上;MARK2蛋白与CREB5蛋白的二级结构预测以无规则卷曲为主;亚细胞定位预测MARK2蛋白主要分布在细胞质中,CREB5蛋白主要分布在细胞核中,两者均不属于分泌型蛋白;MARK2蛋白保守结构域预测含1个S_TKc和1个UBA功能结构域,CREB5蛋白保守结构域预测含有1个ZnF_C2H2、1个BRLZ功能结构域和5个低复杂度区域且二者均不具有跨膜结构。
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关键词
克隆
MARK2基因
CREB5基因
生物信息学
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职称材料
酵母双杂交方法对牛CMYA1中Xin Repeat结构域的鉴定
2
作者
王婷
岳英伟
+4 位作者
杨淑萍
靳聪飞
辛向博
张晓娟
郭宏
《天津农学院学报》
CAS
2017年第1期28-33,共6页
CMYA1是肌肉生长发育相关基因,其表达产物包含若干个由16个氨基酸构成的重复序列,该重复序列被命名为Xin Repeat。为确定CMYA1的蛋白结合核心结构域,本研究利用酵母双杂交方法,以牛CMYA1基因的表达产物中含有Xin Repeat的区域作为预测...
CMYA1是肌肉生长发育相关基因,其表达产物包含若干个由16个氨基酸构成的重复序列,该重复序列被命名为Xin Repeat。为确定CMYA1的蛋白结合核心结构域,本研究利用酵母双杂交方法,以牛CMYA1基因的表达产物中含有Xin Repeat的区域作为预测结构域,通过对该区域的不同区段进行克隆建立酵母诱饵表达载体,并转化酵母菌,再与CMYA1的互作蛋白EIF3G和RPL35A进行酵母双杂交。结果表明,共获得了6个不同区段的CMYA1片段,并确定了4个Xin Repeat序列是蛋白结合结构域的最小功能单位。本研究结果有助于揭示CMYA1结构及Xin Repeat的功能,为进一步研究牛肌肉生长发育的分子机制提供理论依据。
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关键词
CMYA1
Xin
REPEAT
结构域
酵母双杂交
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职称材料
子宫蓄脓对犬子宫内膜组织中IGF-2及IGF-1R蛋白表达的影响
被引量：
1
3
作者
杜淼
岳英伟
+2 位作者
周朋洋
李爽
马文芝
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第5期1263-1269,共7页
探讨IGF-2及IGF-1R蛋白质在子宫蓄脓的表达及与子宫蓄脓发病的相关性。采用免疫组织化学PV法与Western blotting检测5例正常子宫内膜(对照组)、19例子宫蓄脓(试验组)子宫内膜组织中IGF-2及IGF-1R的表达情况。结果表明,免疫组化与Western...
探讨IGF-2及IGF-1R蛋白质在子宫蓄脓的表达及与子宫蓄脓发病的相关性。采用免疫组织化学PV法与Western blotting检测5例正常子宫内膜(对照组)、19例子宫蓄脓(试验组)子宫内膜组织中IGF-2及IGF-1R的表达情况。结果表明,免疫组化与Western blotting检测结果一致,IGF-2和IGF-1R在蓄脓子宫组中的表达量极显著高于正常子宫(P<0.01)。对子宫蓄脓组中IGF-1R与IGF-2进行相关性分析,免疫组化结果表明IGF-1R与IGF-2之间低度相关(r=0.423),Western blotting结果显示IGF-1R与IGF-2之间高度相关(r=0.927)。结果提示,IGF-2阳性表达上调及IGF-1R的异常高表达,在子宫蓄脓的发生和发展过程中可能具有重要作用。
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关键词
IGF-2
IGF-1R
子宫蓄脓
免疫组化
WESTERN
BLOTTING
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职称材料
题名
牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
岳英伟
王鑫
杜淼
马文芝
郭宏
机构
天津农学院动物科学与动物医学学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第2期311-318,共8页
基金
国家转基因重大专项:高产转基因肉牛新品种培育(2014ZX08007-002)
文摘
试验旨在对牛MARK2、CREB5基因进行克隆和生物信息学分析。首先在GenBank数据库中利用人MARK2和CREB5基因序列比对获得牛的表达序列标签(ESTs)的序列,进行引物设计并利用RT-PCR方法从牛肩胛骨肌肉中克隆出MARK2和CREB5基因的cDNA序列,补足空缺部分,最终获得牛MARK2和CREB5基因。通过对牛MARK2和CREB5基因的生物学特性进行分析可知:牛MARK2基因的编码区长为2 076bp,编码691个氨基酸,CREB5基因的编码区长1 527bp,编码508个氨基酸;经蛋白质理化性质预测MARK2和CREB5蛋白均为亲水性蛋白;MARK2和CREB5蛋白的磷酸化位点均分布于苏氨酸(Thr)、丝氨酸(Ser)和酪氨酸(Tyr)残基上;MARK2蛋白与CREB5蛋白的二级结构预测以无规则卷曲为主;亚细胞定位预测MARK2蛋白主要分布在细胞质中,CREB5蛋白主要分布在细胞核中,两者均不属于分泌型蛋白;MARK2蛋白保守结构域预测含1个S_TKc和1个UBA功能结构域,CREB5蛋白保守结构域预测含有1个ZnF_C2H2、1个BRLZ功能结构域和5个低复杂度区域且二者均不具有跨膜结构。
关键词
克隆
MARK2基因
CREB5基因
生物信息学
Keywords
clone
MARK2 gene
CREB5 gene
bioinformatics
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
酵母双杂交方法对牛CMYA1中Xin Repeat结构域的鉴定
2
作者
王婷
岳英伟
杨淑萍
靳聪飞
辛向博
张晓娟
郭宏
机构
天津农学院动物科学与动物医学学院
出处
《天津农学院学报》
CAS
2017年第1期28-33,共6页
基金
天津市自然科学基金项目"牛CMYA家族基因结构与功能研究"(11JCZDJC17600)
文摘
CMYA1是肌肉生长发育相关基因,其表达产物包含若干个由16个氨基酸构成的重复序列,该重复序列被命名为Xin Repeat。为确定CMYA1的蛋白结合核心结构域,本研究利用酵母双杂交方法,以牛CMYA1基因的表达产物中含有Xin Repeat的区域作为预测结构域,通过对该区域的不同区段进行克隆建立酵母诱饵表达载体,并转化酵母菌,再与CMYA1的互作蛋白EIF3G和RPL35A进行酵母双杂交。结果表明,共获得了6个不同区段的CMYA1片段,并确定了4个Xin Repeat序列是蛋白结合结构域的最小功能单位。本研究结果有助于揭示CMYA1结构及Xin Repeat的功能,为进一步研究牛肌肉生长发育的分子机制提供理论依据。
关键词
CMYA1
Xin
REPEAT
结构域
酵母双杂交
Keywords
CMYA1
Xin Repeat
domain
Yeast two-Hybrid
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
子宫蓄脓对犬子宫内膜组织中IGF-2及IGF-1R蛋白表达的影响
被引量：
1
3
作者
杜淼
岳英伟
周朋洋
李爽
马文芝
机构
天津农学院动物科学与动物医学学院
国药集团(天津)医疗器械有限公司
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第5期1263-1269,共7页
基金
天津市财政专项项目<转基因家畜新品种培育
健康养殖新技术研究与开发利用>(2011CZZX)
文摘
探讨IGF-2及IGF-1R蛋白质在子宫蓄脓的表达及与子宫蓄脓发病的相关性。采用免疫组织化学PV法与Western blotting检测5例正常子宫内膜(对照组)、19例子宫蓄脓(试验组)子宫内膜组织中IGF-2及IGF-1R的表达情况。结果表明,免疫组化与Western blotting检测结果一致,IGF-2和IGF-1R在蓄脓子宫组中的表达量极显著高于正常子宫(P<0.01)。对子宫蓄脓组中IGF-1R与IGF-2进行相关性分析,免疫组化结果表明IGF-1R与IGF-2之间低度相关(r=0.423),Western blotting结果显示IGF-1R与IGF-2之间高度相关(r=0.927)。结果提示,IGF-2阳性表达上调及IGF-1R的异常高表达,在子宫蓄脓的发生和发展过程中可能具有重要作用。
关键词
IGF-2
IGF-1R
子宫蓄脓
免疫组化
WESTERN
BLOTTING
Keywords
IGF-2
IGF-1R
canine pyometra
immunohistochemistry
Western blotting
分类号
S829.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牛MARK2、CREB5基因的克隆和生物信息学分析
岳英伟
王鑫
杜淼
马文芝
郭宏
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
酵母双杂交方法对牛CMYA1中Xin Repeat结构域的鉴定
王婷
岳英伟
杨淑萍
靳聪飞
辛向博
张晓娟
郭宏
《天津农学院学报》
CAS
2017
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
子宫蓄脓对犬子宫内膜组织中IGF-2及IGF-1R蛋白表达的影响
杜淼
岳英伟
周朋洋
李爽
马文芝
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016
1
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职称材料
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