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阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征的差异基因表达分析及中药预测
1
作者
屠思懿
姜望予
+1 位作者
龙梦
陈芳
《浙江临床医学》
2024年第4期494-498,共5页
目的基于GEO数据库获得阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)的相关差异表达基因,探讨其分子机制,并进行中药预测,以期为OSAHS的中西医结合诊疗提供理论依据及新的思路。方法在GEO数据库中以“Obstructivesleepapnea-hypopneasyndrom...
目的基于GEO数据库获得阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)的相关差异表达基因,探讨其分子机制,并进行中药预测,以期为OSAHS的中西医结合诊疗提供理论依据及新的思路。方法在GEO数据库中以“Obstructivesleepapnea-hypopneasyndrome”为关键词检索,获得芯片数据集GSE135917,采用GEO2R在线分析筛选差异表达基因,通过Excel进行数据整理与分析,获得显著差异基因,对其进行GO和KEGG富集分析、蛋白互作(PPI)网络构建及可视化分析,得到关联的信号通路及核心基因,最后通过Coreminemedical数据库进行核心基因映射,得到与疾病相关中药。结果OSAHS相关显著差异表达基因共105个;GO富集分析显示差异基因的生物进程主要集中在对脂多糖、糖皮质激素、细菌来源分子、皮质类固醇等反应中,细胞组分主要富集在低密度脂蛋白颗粒、内吞囊泡管腔、高密度脂蛋白颗粒、溶酶体腔等中;分子功能主要以RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、生长因子活性、DNA转录因子结合、核受体结合为主;KEGG富集分析共得到10条信号通路,包括IL-17信号通路、TNF信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染通路、致病性大肠杆菌感染通路等;蛋白互作网络构建及可视化分析共得到12个核心基因(IL-6、FOS、FOSB、NR4A1、ATF3、DUSP1、EGR1、JUN、ZFP36、PTGS2、CXCL2、SOCS3),核心基因映射共获得89味具有潜在治疗效果的中药,功效以补虚药、清热药、活血化瘀药、化痰止咳平喘药、祛风湿药为主。结论IL-6、FOS等核心基因的表达及IL-17、TNF等信号通路可能在OSAHS病程中起到关键作用,部分清热活血化瘀、补虚化痰止咳的中药可靶向治疗OSAHS,具有潜在治疗效果及良好的应用前景,生物信息学分析可得到OSAHS治疗的多个靶点,对其精准治疗及中西医结合治疗具有重要意义。
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关键词
阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征
生物信息学
GEO数据库
中药预测
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职称材料
红草止鼾胶囊治疗阻塞性睡眠呼吸暂停综合征的临床疗效观察
2
作者
姚钦
冉小琴
+3 位作者
姜望予
屠思懿
龙梦
陈芳
《浙江临床医学》
2023年第2期248-250,共3页
目的 探讨红草止鼾胶囊治疗阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)的疗效.方法 OSAHS患者96例,随机分为对照组及观察组,对照组患者鼓励适度减重,健康有氧运动,避免过度疲劳,认知干预,适度调整饮食结构等,观察组在此基础上予红草止鼾胶...
目的 探讨红草止鼾胶囊治疗阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)的疗效.方法 OSAHS患者96例,随机分为对照组及观察组,对照组患者鼓励适度减重,健康有氧运动,避免过度疲劳,认知干预,适度调整饮食结构等,观察组在此基础上予红草止鼾胶囊口服,4周为1个疗程,共治疗2个疗程.比较治疗前后两组患者临床症状、睡眠呼吸暂停低通气指数(AHI)、夜间最低血氧饱和度(LSpO_(2))水平、夜间平均血氧饱和度水平(MSaO_(2))、Epworth嗜睡量表(ESS)评分、中医证候积分等指标的变化.结果 治疗2个疗程后,两组患者AHI、ESS评分及中医证候评分均有不同程度的下降(P<0.05);观察组治疗后AHI、ESS评分及中医证候评分与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05);观察组临床总有效率约61.5%,明显优于对照组13.63%(P<0.05).结论 红草止鼾胶囊对OSAHS疗效显著,能有效提高患者生活质量,其中对合并鼻炎、咽炎的患者疗效尤为明显,且安全性良好.
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关键词
红草止鼾胶囊
临床疗效
阻塞性睡眠呼吸暂停综合征
中医药制剂
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职称材料
基于GEO数据库的肺纤维化相关差异表达基因生物信息学分析
3
作者
冉小琴
姚钦
+3 位作者
姜望予
屠思懿
龙梦
陈芳
《浙江临床医学》
2022年第12期1755-1758,共4页
目的利用生物信息学工具筛选在肺纤维化中差异表达的基因及信号通路,为肺纤维化的研究提供新思路.方法在高通量基因表达(GEO)数据库中搜索"Idiopathic pulmonary fibrosis",下载含正常肺组织和肺纤维化的芯片数据集GSE53845,...
目的利用生物信息学工具筛选在肺纤维化中差异表达的基因及信号通路,为肺纤维化的研究提供新思路.方法在高通量基因表达(GEO)数据库中搜索"Idiopathic pulmonary fibrosis",下载含正常肺组织和肺纤维化的芯片数据集GSE53845,使用GEO2R分析并筛选出IPF和正常肺组织之间的差异表达基因.通过DAVID网站对筛选出的基因进行富集分析,利用STRING数据库对获得的差异基因进行蛋白互作(PPI)网络构建.最终通过Cytoscape对PPI网络进行可视化分析并筛选核心基因.结果IPF组织中涉及差异表达基因共148个,其中高表达108个,低表达40个.GO富集分析显示差异表达基因主要富集于趋化因子活性、细胞因子活性等;KEGG通路富集分析显示差异表达基因主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路等.通过STRING数据库和Cytoscape软件筛选出趋化因子、基质金属蛋白酶等核心基因.其中趋化因子、细胞因子等基因与肺纤维化的发生发展关系密切.结论趋化因子、细胞因子等基因表达可能在肺纤维化的发生发展过程中起重要作用.
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关键词
肺纤维化
生物信息学
基因靶点
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职称材料
题名
阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征的差异基因表达分析及中药预测
1
作者
屠思懿
姜望予
龙梦
陈芳
机构
浙江中医药大学第一临床医学院
浙江中医药大学附属第一医院(浙江省中医院)
出处
《浙江临床医学》
2024年第4期494-498,共5页
基金
浙江省医药卫生科技计划项目(2023KY865)。
文摘
目的基于GEO数据库获得阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)的相关差异表达基因,探讨其分子机制,并进行中药预测,以期为OSAHS的中西医结合诊疗提供理论依据及新的思路。方法在GEO数据库中以“Obstructivesleepapnea-hypopneasyndrome”为关键词检索,获得芯片数据集GSE135917,采用GEO2R在线分析筛选差异表达基因,通过Excel进行数据整理与分析,获得显著差异基因,对其进行GO和KEGG富集分析、蛋白互作(PPI)网络构建及可视化分析,得到关联的信号通路及核心基因,最后通过Coreminemedical数据库进行核心基因映射,得到与疾病相关中药。结果OSAHS相关显著差异表达基因共105个;GO富集分析显示差异基因的生物进程主要集中在对脂多糖、糖皮质激素、细菌来源分子、皮质类固醇等反应中,细胞组分主要富集在低密度脂蛋白颗粒、内吞囊泡管腔、高密度脂蛋白颗粒、溶酶体腔等中;分子功能主要以RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、生长因子活性、DNA转录因子结合、核受体结合为主;KEGG富集分析共得到10条信号通路,包括IL-17信号通路、TNF信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染通路、致病性大肠杆菌感染通路等;蛋白互作网络构建及可视化分析共得到12个核心基因(IL-6、FOS、FOSB、NR4A1、ATF3、DUSP1、EGR1、JUN、ZFP36、PTGS2、CXCL2、SOCS3),核心基因映射共获得89味具有潜在治疗效果的中药,功效以补虚药、清热药、活血化瘀药、化痰止咳平喘药、祛风湿药为主。结论IL-6、FOS等核心基因的表达及IL-17、TNF等信号通路可能在OSAHS病程中起到关键作用,部分清热活血化瘀、补虚化痰止咳的中药可靶向治疗OSAHS,具有潜在治疗效果及良好的应用前景,生物信息学分析可得到OSAHS治疗的多个靶点,对其精准治疗及中西医结合治疗具有重要意义。
关键词
阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征
生物信息学
GEO数据库
中药预测
Keywords
Obstructive sleep apnea hypopnea syndrome
Bioinformatics
GEO database
Traditional Chinese medicine prediction
分类号
R766 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
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职称材料
题名
红草止鼾胶囊治疗阻塞性睡眠呼吸暂停综合征的临床疗效观察
2
作者
姚钦
冉小琴
姜望予
屠思懿
龙梦
陈芳
机构
浙江中医药大学附属第一医院(浙江省中医院)
出处
《浙江临床医学》
2023年第2期248-250,共3页
文摘
目的 探讨红草止鼾胶囊治疗阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)的疗效.方法 OSAHS患者96例,随机分为对照组及观察组,对照组患者鼓励适度减重,健康有氧运动,避免过度疲劳,认知干预,适度调整饮食结构等,观察组在此基础上予红草止鼾胶囊口服,4周为1个疗程,共治疗2个疗程.比较治疗前后两组患者临床症状、睡眠呼吸暂停低通气指数(AHI)、夜间最低血氧饱和度(LSpO_(2))水平、夜间平均血氧饱和度水平(MSaO_(2))、Epworth嗜睡量表(ESS)评分、中医证候积分等指标的变化.结果 治疗2个疗程后,两组患者AHI、ESS评分及中医证候评分均有不同程度的下降(P<0.05);观察组治疗后AHI、ESS评分及中医证候评分与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05);观察组临床总有效率约61.5%,明显优于对照组13.63%(P<0.05).结论 红草止鼾胶囊对OSAHS疗效显著,能有效提高患者生活质量,其中对合并鼻炎、咽炎的患者疗效尤为明显,且安全性良好.
关键词
红草止鼾胶囊
临床疗效
阻塞性睡眠呼吸暂停综合征
中医药制剂
Keywords
Hongcaozhihan capsule
Clinical efficacy
Obstructive sleep apnea-hypopnea syndrome
Traditional chinesemedicine preparations
分类号
R766 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
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职称材料
题名
基于GEO数据库的肺纤维化相关差异表达基因生物信息学分析
3
作者
冉小琴
姚钦
姜望予
屠思懿
龙梦
陈芳
机构
浙江中医药大学第一临床医学院
浙江省中医院
出处
《浙江临床医学》
2022年第12期1755-1758,共4页
基金
浙江省中医药科技计划项目(2020ZB089)。
文摘
目的利用生物信息学工具筛选在肺纤维化中差异表达的基因及信号通路,为肺纤维化的研究提供新思路.方法在高通量基因表达(GEO)数据库中搜索"Idiopathic pulmonary fibrosis",下载含正常肺组织和肺纤维化的芯片数据集GSE53845,使用GEO2R分析并筛选出IPF和正常肺组织之间的差异表达基因.通过DAVID网站对筛选出的基因进行富集分析,利用STRING数据库对获得的差异基因进行蛋白互作(PPI)网络构建.最终通过Cytoscape对PPI网络进行可视化分析并筛选核心基因.结果IPF组织中涉及差异表达基因共148个,其中高表达108个,低表达40个.GO富集分析显示差异表达基因主要富集于趋化因子活性、细胞因子活性等;KEGG通路富集分析显示差异表达基因主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路等.通过STRING数据库和Cytoscape软件筛选出趋化因子、基质金属蛋白酶等核心基因.其中趋化因子、细胞因子等基因与肺纤维化的发生发展关系密切.结论趋化因子、细胞因子等基因表达可能在肺纤维化的发生发展过程中起重要作用.
关键词
肺纤维化
生物信息学
基因靶点
Keywords
Pulmonary fibrosis
Bioinformatics
Gene target
分类号
R563 [医药卫生—呼吸系统]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征的差异基因表达分析及中药预测
屠思懿
姜望予
龙梦
陈芳
《浙江临床医学》
2024
0
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职称材料
2
红草止鼾胶囊治疗阻塞性睡眠呼吸暂停综合征的临床疗效观察
姚钦
冉小琴
姜望予
屠思懿
龙梦
陈芳
《浙江临床医学》
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于GEO数据库的肺纤维化相关差异表达基因生物信息学分析
冉小琴
姚钦
姜望予
屠思懿
龙梦
陈芳
《浙江临床医学》
2022
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