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miR-22-3p在鼻咽癌中的表达及靶基因功能分析
被引量：
2
1
作者
尹梦婕
吕艳茹
+7 位作者
蒿艳蓉
曹宇华
袁贤彬
谢嫣嫣
徐志勇
高珊
莫华清
沈婧怡
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2020年第11期1127-1133,共7页
目的目前关于鼻咽癌中miR-22-3p的表达情况和作用机制尚不明确。文中旨在研究miR-22-3p在鼻咽癌中的表达情况,分析其表达对鼻咽癌发生发展的影响。方法从GEO数据库中下载鼻咽癌组织miRNA表达数据GSE36682,分析miR-22-3p在鼻咽癌组织中...
目的目前关于鼻咽癌中miR-22-3p的表达情况和作用机制尚不明确。文中旨在研究miR-22-3p在鼻咽癌中的表达情况,分析其表达对鼻咽癌发生发展的影响。方法从GEO数据库中下载鼻咽癌组织miRNA表达数据GSE36682,分析miR-22-3p在鼻咽癌组织中的表达变化,应用qRT-PCR在鼻咽癌细胞中进一步验证。根据慢病毒转染分为:过表达组(转染miR-22-3p过表达慢病毒)、阴性对照组(空载病毒)、空白组(不转染)。应用生物信息学软件及数据集GSE53819中预测并筛选表达有差异的靶基因,并进行GO功能及KEGG通路富集分析,同时构建靶基因的蛋白互作网络并找出其关键基因,探究miR-22-3p表达失调在鼻咽癌中发生发展过程中的作用。结果鼻咽癌中miR-22-3p呈明显低表达(P<0.01)。ROC曲线表明在鼻咽癌中miR-22-3p的表达具有一定诊断效能(AUC:0.984,95%CI:0.970~0.998)。过表达组WNT5A相对表达量(0.423±0.079)明显低于空白组(1.000±0.000)、阴性对照组(0.915±0.237),差异有统计学意义(P<0.05);CXCL5亦明显降低(P<0.05)。在生物信息学软件及数据集中预测并筛选后得到201个差异表达的miR-22-3p的靶基因,GO功能分析表明miR-22-3p靶基因产物主要涉及对无机及有机物质的反应、Wnt受体信号通路等生物学过程,还包括跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、蛋白域特异性结合等分子功能,KEGG通路富集分析表明这些靶基因主要参与趋化因子信号通路、癌症通路。此外,WNT5A、GNG7、CXCR5、CCR7、CXCL5、TFRC、STAT1、CX3CR1、KIAA0319为筛选出的miR-22-3p的关键靶基因,其中WNT5A、CXCL5、TFRC、STAT1呈现表达上调,CXCR5、GNG7、CCR7、CX3CR1、KIAA0319呈现表达下降(P<0.01)。预后分析发现GNG7、CXCR5、CCR7、CX3CR1低表达及TFRC的高表达与头颈部鳞癌的不良预后具有明显的相关性(P<0.01)。结论miR-22-3p在鼻咽癌中表达下调,可能通过调控其靶基因WNT5A、CXCL 5等在鼻咽癌中发挥重要作用。
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关键词
鼻咽癌
miR-22-3p
生物信息学
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职称材料
ACCase Trp-1999-Leu突变对菵草种子萌发的影响
被引量：
1
2
作者
尹梦婕
刘国平
+3 位作者
李怡慧
姜波
白霜
李凌绪
《山东农业科学》
北大核心
2021年第12期44-49,共6页
为了确定菵草(Beckmannia syzigachne)乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-coenzyme A carboxylase,ACCase)Trp-1999-Leu突变对种子萌发的影响,采用衍生酶切扩增序列多态性法(derived cleaved amplified polymorphism sequences,dCAPS)从JS-26种群...
为了确定菵草(Beckmannia syzigachne)乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-coenzyme A carboxylase,ACCase)Trp-1999-Leu突变对种子萌发的影响,采用衍生酶切扩增序列多态性法(derived cleaved amplified polymorphism sequences,dCAPS)从JS-26种群中分离出基因背景一致的1999位突变纯合子(1999Trp/Trp,RR)和野生型(1999Leu/Leu,SS),并在室内测定其种子萌发的动态差异,及在pH、水分、盐等胁迫下的萌发差异。结果表明,Trp-1999-Leu突变能够提高菵草种子的萌发率,使菵草种子在偏酸性或偏碱性条件下的萌发率降低;但能显著提高菵草种子萌发对水分和盐胁迫的耐受力,水势为-0.4 MPa时,RR萌发率比SS高23个百分点,NaCl浓度为80 mmol/L时,RR的萌发率为SS的4.4倍。
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关键词
菵草
乙酰辅酶A羧化酶
Trp-1999-Leu突变
种子萌发
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职称材料
环境因素对播娘蒿种子萌发的影响
被引量：
4
3
作者
李怡慧
徐琼
+3 位作者
尹梦婕
白霜
罗小勇
李凌绪
《山东农业科学》
2020年第9期45-48,共4页
通过皿内试验和温室试验研究温度、光照、p H值、水分、盐分、埋深等环境因素对播娘蒿(Descurainia sophia)种子萌发的影响。结果表明,播娘蒿种子萌发对光照非常敏感,可见光可完全抑制其萌发;5~30℃范围内种子均可萌发,20/10℃变温条件...
通过皿内试验和温室试验研究温度、光照、p H值、水分、盐分、埋深等环境因素对播娘蒿(Descurainia sophia)种子萌发的影响。结果表明,播娘蒿种子萌发对光照非常敏感,可见光可完全抑制其萌发;5~30℃范围内种子均可萌发,20/10℃变温条件下萌发率最高;随着p H值升高,萌发率逐渐下降;种子萌发对干旱有一定的耐受力,但对盐分非常敏感,当Na Cl浓度超过20 mmol/L时,萌发被完全抑制;种子在土壤表层时出苗率最高,埋深超过1 cm不能萌发出苗。
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关键词
播娘蒿
种子
萌发率
环境因子
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职称材料
题名
miR-22-3p在鼻咽癌中的表达及靶基因功能分析
被引量：
2
1
作者
尹梦婕
吕艳茹
蒿艳蓉
曹宇华
袁贤彬
谢嫣嫣
徐志勇
高珊
莫华清
沈婧怡
机构
广西壮族自治区人民医院临床肿瘤中心
出处
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2020年第11期1127-1133,共7页
基金
广西壮族自治区卫生健康委员会自筹经费科研课题(Z20190671)
广西壮族自治区研究生教育创新计划项目(YCSW2019121)。
文摘
目的目前关于鼻咽癌中miR-22-3p的表达情况和作用机制尚不明确。文中旨在研究miR-22-3p在鼻咽癌中的表达情况,分析其表达对鼻咽癌发生发展的影响。方法从GEO数据库中下载鼻咽癌组织miRNA表达数据GSE36682,分析miR-22-3p在鼻咽癌组织中的表达变化,应用qRT-PCR在鼻咽癌细胞中进一步验证。根据慢病毒转染分为:过表达组(转染miR-22-3p过表达慢病毒)、阴性对照组(空载病毒)、空白组(不转染)。应用生物信息学软件及数据集GSE53819中预测并筛选表达有差异的靶基因,并进行GO功能及KEGG通路富集分析,同时构建靶基因的蛋白互作网络并找出其关键基因,探究miR-22-3p表达失调在鼻咽癌中发生发展过程中的作用。结果鼻咽癌中miR-22-3p呈明显低表达(P<0.01)。ROC曲线表明在鼻咽癌中miR-22-3p的表达具有一定诊断效能(AUC:0.984,95%CI:0.970~0.998)。过表达组WNT5A相对表达量(0.423±0.079)明显低于空白组(1.000±0.000)、阴性对照组(0.915±0.237),差异有统计学意义(P<0.05);CXCL5亦明显降低(P<0.05)。在生物信息学软件及数据集中预测并筛选后得到201个差异表达的miR-22-3p的靶基因,GO功能分析表明miR-22-3p靶基因产物主要涉及对无机及有机物质的反应、Wnt受体信号通路等生物学过程,还包括跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、蛋白域特异性结合等分子功能,KEGG通路富集分析表明这些靶基因主要参与趋化因子信号通路、癌症通路。此外,WNT5A、GNG7、CXCR5、CCR7、CXCL5、TFRC、STAT1、CX3CR1、KIAA0319为筛选出的miR-22-3p的关键靶基因,其中WNT5A、CXCL5、TFRC、STAT1呈现表达上调,CXCR5、GNG7、CCR7、CX3CR1、KIAA0319呈现表达下降(P<0.01)。预后分析发现GNG7、CXCR5、CCR7、CX3CR1低表达及TFRC的高表达与头颈部鳞癌的不良预后具有明显的相关性(P<0.01)。结论miR-22-3p在鼻咽癌中表达下调,可能通过调控其靶基因WNT5A、CXCL 5等在鼻咽癌中发挥重要作用。
关键词
鼻咽癌
miR-22-3p
生物信息学
Keywords
nasopharyngeal carcinoma
miR-22-3p
bioinformatics
分类号
R739.62 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
ACCase Trp-1999-Leu突变对菵草种子萌发的影响
被引量：
1
2
作者
尹梦婕
刘国平
李怡慧
姜波
白霜
李凌绪
机构
青岛农业大学植物医学学院/山东省植物病虫害综合防控重点实验室
安丘市景芝镇社区中心
出处
《山东农业科学》
北大核心
2021年第12期44-49,共6页
基金
山东省自然科学基金项目(ZR2019MC043,ZR2020QC136)。
文摘
为了确定菵草(Beckmannia syzigachne)乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-coenzyme A carboxylase,ACCase)Trp-1999-Leu突变对种子萌发的影响,采用衍生酶切扩增序列多态性法(derived cleaved amplified polymorphism sequences,dCAPS)从JS-26种群中分离出基因背景一致的1999位突变纯合子(1999Trp/Trp,RR)和野生型(1999Leu/Leu,SS),并在室内测定其种子萌发的动态差异,及在pH、水分、盐等胁迫下的萌发差异。结果表明,Trp-1999-Leu突变能够提高菵草种子的萌发率,使菵草种子在偏酸性或偏碱性条件下的萌发率降低;但能显著提高菵草种子萌发对水分和盐胁迫的耐受力,水势为-0.4 MPa时,RR萌发率比SS高23个百分点,NaCl浓度为80 mmol/L时,RR的萌发率为SS的4.4倍。
关键词
菵草
乙酰辅酶A羧化酶
Trp-1999-Leu突变
种子萌发
Keywords
Beckmannia syzigachne
Acetyl coenzyme A carboxylase
Trp-1999-Leu mutation
Seed germination
分类号
S451 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
环境因素对播娘蒿种子萌发的影响
被引量：
4
3
作者
李怡慧
徐琼
尹梦婕
白霜
罗小勇
李凌绪
机构
青岛农业大学植物医学学院
青岛大港海关
出处
《山东农业科学》
2020年第9期45-48,共4页
基金
山东省自然科学基金项目(ZR2019MC043)
青岛农业大学大学生科技创新项目。
文摘
通过皿内试验和温室试验研究温度、光照、p H值、水分、盐分、埋深等环境因素对播娘蒿(Descurainia sophia)种子萌发的影响。结果表明,播娘蒿种子萌发对光照非常敏感,可见光可完全抑制其萌发;5~30℃范围内种子均可萌发,20/10℃变温条件下萌发率最高;随着p H值升高,萌发率逐渐下降;种子萌发对干旱有一定的耐受力,但对盐分非常敏感,当Na Cl浓度超过20 mmol/L时,萌发被完全抑制;种子在土壤表层时出苗率最高,埋深超过1 cm不能萌发出苗。
关键词
播娘蒿
种子
萌发率
环境因子
Keywords
Flixweed
Seed
Germination rate
Environmental factors
分类号
S544 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
miR-22-3p在鼻咽癌中的表达及靶基因功能分析
尹梦婕
吕艳茹
蒿艳蓉
曹宇华
袁贤彬
谢嫣嫣
徐志勇
高珊
莫华清
沈婧怡
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2020
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
ACCase Trp-1999-Leu突变对菵草种子萌发的影响
尹梦婕
刘国平
李怡慧
姜波
白霜
李凌绪
《山东农业科学》
北大核心
2021
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
环境因素对播娘蒿种子萌发的影响
李怡慧
徐琼
尹梦婕
白霜
罗小勇
李凌绪
《山东农业科学》
2020
4
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职称材料
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