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一种基于小波变换的图像消噪算法 被引量：7
1
作者 宋锦萍 宋玲珍 +1 位作者 杨晓艺 李登峰 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2007年第1期43-46,共4页
该文在自适应树小波萎缩法的基础上,结合小波系数的零树编码思想和小波变换的信噪分离特性给出了一种新的小波消噪算法。该算法不仅减少了运算量,而且在消噪和保留奇异点信息方面也取得了较好的效果。
关键词 图像消噪 零树编码 信噪分离 小波变换
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In-fusion连接技术优化及其在大片段重组载体构建中的应用 被引量：3
2
作者 李玲玲 张伟 +3 位作者 宋玲珍 胡新德 陈树林 赵善廷 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第5期1-7,共7页
随着大规模基因组测序的完成和表达序列标签数据库的建立,基因组的研究已由结构基因组向功能基因组转化,而基因功能研究的关键是基因融合技术。为高效率高保真地构建融合大片段的重组载体,本试验利用In-fusion技术进行大片段载体构建,... 随着大规模基因组测序的完成和表达序列标签数据库的建立,基因组的研究已由结构基因组向功能基因组转化,而基因功能研究的关键是基因融合技术。为高效率高保真地构建融合大片段的重组载体,本试验利用In-fusion技术进行大片段载体构建,以不同的融合时间进行比较,通过细胞转染以及免疫印迹等方法对载体质量进行验证。通过对体系中连接时间的优化,构建出了含插入片段10、8、4ku的真核表达载体,并可正确表达。In-fusion技术的优化,提高了大片段真核表达载体构建的效率,为研究大片段基因的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 基因融合 In—fusion 大片段PCR扩增产物 优化 重组载体
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小鼠海马发育过程中丝切蛋白及其磷酸化调节基因表达差异分析 被引量：1
3
作者 胡新德 张伟 +5 位作者 刘笙腩 李玲玲 宋玲珍 柴学军 陈树林 赵善廷 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2013年第7期6-11,共6页
论文旨在研究小鼠海马发育不同时期丝切蛋白及其磷酸化状态调节基因的表达量变化模式,为进一步研究丝切蛋白在海马发育过程中的功能以及其活性调节奠定基础。用半定量PCR检测不同时期丝切蛋白及其磷酸化调节基因相对表达量,通过ImageJ... 论文旨在研究小鼠海马发育不同时期丝切蛋白及其磷酸化状态调节基因的表达量变化模式,为进一步研究丝切蛋白在海马发育过程中的功能以及其活性调节奠定基础。用半定量PCR检测不同时期丝切蛋白及其磷酸化调节基因相对表达量,通过ImageJ对结果进行分析,得出丝切蛋白及其磷酸化调节基因在小鼠海马发育不同时期表达量的变化趋势。结果表明,在小鼠海马发育不同时期丝切蛋白一直处于高表达状态,随着海马发育成熟丝切蛋白的表达量呈缓慢下降趋势。在这个过程中丝切蛋白磷酸化基因表达量呈明显下降趋势,P0时期LIMK1的表达量是P14时期的5.05倍(n=3)。与此相反,随着海马的发育中丝切蛋白去磷酸化基因表达量呈明显上升趋势,在P60时期CIN的表达量约是P0时期CIN表达量的2.88倍(n=3),P14时期SSH3的表达量约是P0时期的26.5倍(n=3)。其中LIMK2、TESK1、TESK2、SSH1和SSH2在这个过程中的表达量变化不明显。以上结果表明在小鼠海马发育过程中机体主要是通过调节丝切蛋白活性以满足不同发育时期对其活性的需求,其中LIMK1、CIN和SSH3是主要的丝切蛋白活性调节因子。 展开更多
关键词 海马发育 丝切蛋白 磷酸化 表达差异
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小鼠cofilin-1基因及其真核表达载体的构建与体内外表达
4
作者 李玲玲 张伟 +5 位作者 杜蕊 宋玲珍 柴学军 胡新德 陈树林 赵善廷 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2014年第9期1-10,共10页
【目的】构建能够在神经系统中高效表达的小鼠cofilin-1野生型(Cfl1-wt)、活化型(Cfl1-S3A)、失活型(Cfl1-S3D)3种真核表达载体,并研究其在鸡胚脊髓神经元中的表达情况,为进一步探讨cofilin-1在大脑发育过程中对神经元迁移的影响奠定基... 【目的】构建能够在神经系统中高效表达的小鼠cofilin-1野生型(Cfl1-wt)、活化型(Cfl1-S3A)、失活型(Cfl1-S3D)3种真核表达载体,并研究其在鸡胚脊髓神经元中的表达情况,为进一步探讨cofilin-1在大脑发育过程中对神经元迁移的影响奠定基础。【方法】从成年小鼠大脑组织中提取RNA,经反转录获得cDNA样本,RT-PCR扩增小鼠cofilin-1基因的CDS区,经引物设计引入点突变,扩增了野生型、活化型及失活型的cofilin-1基因片段,克隆入pCAG-MCS-myc真核表达载体中。经双酶切和测序鉴定后,转染CHO细胞,通过半定量RT-PCR和免疫荧光染色检测其在细胞中的表达情况。利用鸡胚活体原位电转的方法,将重组质粒转染胚胎发育第3天(E3)的鸡胚脊髓,在胚胎发育第6天(E6)取材,切片后经免疫荧光染色观察并统计分析重组质粒在脊髓中的表达情况。【结果】克隆并模拟了小鼠cofilin-1野生型、活化型和失活型的cDNA片段,成功构建了pCAG-cfl1-wt、pCAG-cfl1-S3A和pCAGcfl1-S3D3种真核表达载体。体外转染CHO细胞,半定量RT-PCR检测及统计学分析表明,转染重组质粒的CHO细胞中,Cofilin-1mRNA相对表达量与对照组(未转染质粒的正常CHO细胞)存在显著性差异;免疫荧光染色后观察到了Cofilin-1融合蛋白的表达。对经活体原位电转转染重组质粒的鸡胚脊髓切片进行免疫荧光染色,检测到Cofilin-1融合蛋白的表达,且重组质粒转染效果与pCAG-EGFP转染效果无明显差异。【结论】pCAG-cfl1-wt、pCAGcfl1-S3A和pCAG-cfl1-S3D3种真核表达载体的成功构建及其在体内外的高效表达,为进一步研究cofilin-1及其Ser3位点的磷酸化在神经元迁移中的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 cofilin-1 SER 3 磷酸化 去磷酸化 质粒构建 活体原位电转
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中国仓鼠卵巢细胞和人胚肾T细胞骨架及其迁移特性的比较
5
作者 张伟 胡新德 +4 位作者 王久涛 宋玲珍 李玲玲 陈树林 赵善廷 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2014年第8期1-7,共7页
【目的】比较中国仓鼠卵巢(CHO)细胞和人胚肾T(HEK293T)细胞的迁移能力,筛选适用于细胞骨架形态和外源基因对细胞迁移影响研究的细胞系。【方法】通过免疫荧光组织化学比较CHO和HEK293T细胞骨架的形态差异,通过延时成像和划痕试验比较... 【目的】比较中国仓鼠卵巢(CHO)细胞和人胚肾T(HEK293T)细胞的迁移能力,筛选适用于细胞骨架形态和外源基因对细胞迁移影响研究的细胞系。【方法】通过免疫荧光组织化学比较CHO和HEK293T细胞骨架的形态差异,通过延时成像和划痕试验比较细胞迁移能力,通过免疫印迹比较2株细胞系细胞骨架基因的相对表达,并从细胞骨架差异和结构基因的选择性表达方面解释细胞迁移能力的差异。【结果】CHO和HEK293T细胞系的细胞骨架在形态上存在较大差异,HEK293T细胞系的核质比是CHO细胞的2.25倍;CHO细胞比HEK293T细胞的迁移能力强,是HEK293T细胞的2.9倍;2种细胞内α-Tubulin/β-Actin的比率存在较大差异,CHO是HEK293T的1.2倍。【结论】细胞中微管微丝的差异性分布及结构基因Tubulin和Actin的选择性表达是细胞迁移特性不同的关键因素。CHO细胞适用于涉及细胞骨架形态和外源基因对细胞迁移影响的研究,HEK293T细胞不适用于此类研究。 展开更多
关键词 中国仓鼠卵巢细胞 人胚肾T细胞 细胞骨架 迁移
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摇晃蛋白(Reelin)的剪切蛋白预测
6
作者 张伟 李玲玲 +6 位作者 宋玲珍 胡新德 张亚妹 段明慧 颜润川 陈树林 赵善廷 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2014年第2期155-161,共7页
【目的】探索生物信息学方法在Reelin剪切蛋白查找中的应用,并筛选大脑皮质中可能对Reelin有剪切作用的蛋白。【方法】以ADAMTS-4蛋白为基准,利用生物信息学方法,以功能域查找相似功能蛋白,并结合同源性比对方法从中筛选出剪切Reelin的... 【目的】探索生物信息学方法在Reelin剪切蛋白查找中的应用,并筛选大脑皮质中可能对Reelin有剪切作用的蛋白。【方法】以ADAMTS-4蛋白为基准,利用生物信息学方法,以功能域查找相似功能蛋白,并结合同源性比对方法从中筛选出剪切Reelin的候选蛋白,并对候选蛋白的理化性质、亚细胞定位、功能域、二级结构和组织定位进行分析。【结果】ADAMTS-2、ADAMTS-3、ADAMTS-10、ADAMTS-16与ADAMTS-4有相似的理化性质,且均属于分泌蛋白,在大脑皮质中可能有分布。ADAMTS-2、ADAMTS-3、ADAMTS-10、ADAMTS-16包含ADAMTS-4的功能域,且功能域内的二级结构相似。【结论】筛选到了可能对Reelin有剪切作用的蛋白ADAMTS-2、ADAMTS-3、ADAMTS-10和ADAMTS-16。 展开更多
关键词 摇晃蛋白 生物信息学 剪切蛋白 ADAMTS-4
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丙烯酰胺对小鼠成体神经发生及GSK3β表达的影响 被引量：2
7
作者 李凯凯 谢炅芳 +4 位作者 王久涛 宋玲珍 张伟 陈树林 赵善廷 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期163-168,共6页
目的:探讨和研究丙烯酰胺对成年小鼠海马成体神经发生及GSK3β表达的影响。方法:雄性成年昆明小鼠分为丙烯酰胺处理组和生理盐水对照组,通过腹腔注射(i.p.)进行丙烯酰胺染毒,用Brd U标记和免疫组织化学方法研究齿状回神经干细胞的增殖,B... 目的:探讨和研究丙烯酰胺对成年小鼠海马成体神经发生及GSK3β表达的影响。方法:雄性成年昆明小鼠分为丙烯酰胺处理组和生理盐水对照组,通过腹腔注射(i.p.)进行丙烯酰胺染毒,用Brd U标记和免疫组织化学方法研究齿状回神经干细胞的增殖,Brd U/Neu N/GFAP三标的方法研究齿状回神经干细胞的存活和分化,Neuro-2a细胞中观察GSK3β表达与分布,用Western blot方法检测小鼠海马中GSK3β的表达。结果:丙烯酰胺处理组小鼠齿状回亚颗粒细胞层(SGZ)中的Brd U阳性细胞数量显著低于对照组,并且新生细胞向神经元分化的数量显著降低。丙烯酰胺处理小鼠SGZ区新生干细胞的存活率显著低于对照小鼠,另外,丙烯酰胺组新生干细胞向胶质细胞分化的比例显著升高。在Neuro-2a细胞中磷酸化的GSK3β表达量极显著升高,但在丙烯酰胺处理组小鼠的海马中磷酸化的GSK3β显著降低。结论:结果表明,丙烯酰胺能显著抑制小鼠齿状回成体神经干细胞增殖,降低新生干细胞的存活率并影响其分化,丙烯酰胺抑制小鼠成体神经发生可能与GSK3β有一定的关系。 展开更多
关键词 丙烯酰胺 成体神经发生 免疫组织化学 GSK3Β
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丙烯酰胺对小鼠成体神经发生及增殖相关基因的影响
8
作者 张亚妹 王久涛 +5 位作者 宋玲珍 张伟 李玲玲 颜润川 胡新德 赵善廷 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第7期39-44,共6页
【目的】探讨丙烯酰胺对成年小鼠海马成体神经发生及增殖相关基因的影响,为了解丙烯酰胺的毒性机理提供参考。【方法】将20只10周龄雄性成年昆白小鼠(体质量(30±2)g/只),随机均分为丙烯酰胺染毒组和生理盐水对照组,丙烯酰胺染毒组... 【目的】探讨丙烯酰胺对成年小鼠海马成体神经发生及增殖相关基因的影响,为了解丙烯酰胺的毒性机理提供参考。【方法】将20只10周龄雄性成年昆白小鼠(体质量(30±2)g/只),随机均分为丙烯酰胺染毒组和生理盐水对照组,丙烯酰胺染毒组通过腹腔注射丙烯酰胺进行染毒,注射剂量为50mg/kg,连续注射14d,第15天注射5-溴脱氧尿嘧啶核苷(BrdU,50mg/kg,2次/d,共3d),观察2组小鼠体质量及行为活动的变化。用BrdU标记和免疫组织化学染色方法分析丙烯酰胺染毒对小鼠齿状回神经干细胞数量的影响,用RT-PCR法研究丙烯酰胺对小鼠海马增殖相关基因JNK3、Akt1、Gsk-3β、RhoA和Rac1mRNA表达的影响。【结果】丙烯酰胺染毒组小鼠体质量极显著低于对照组,精神萎靡、后肢无力,走路时后肢偶成劈叉姿势;与对照组相比,丙烯酰胺染毒组小鼠齿状回亚颗粒细胞层中的BrdU阳性细胞数量极显著降低(P<0.01),海马组织中JNK3和Rac1的mRNA表达量显著升高(P<0.05),Akt1、Gsk-3β和RhoA的mRNA表达量极显著升高(P<0.01)。【结论】丙烯酰胺中毒能显著抑制小鼠齿状回中成体神经干细胞增殖,可使海马组织中增殖相关基因JNK3、Akt1、Gsk-3β、Rac1和RhoA的表达量发生明显变化。 展开更多
关键词 丙烯酰胺中毒 成体神经发生 免疫组织化学 增殖相关基因
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小鼠RSP3基因序列分析及其亚细胞定位
9
作者 成欣然 颜润川 +5 位作者 胡新德 宋玲珍 张伟 张亚妹 陈树林 赵善廷 《动物医学进展》 北大核心 2015年第2期1-7,共7页
衣藻RSP3是一个鞭毛结构蛋白,目前有关RSP3相关研究主要集中在衣藻上,而对其在哺乳动物中的同源基因的蛋白定位及功能研究甚少。本研究对各个物种的RSP3氨基酸序列进行比对分析,在用SMART软件预测小鼠RSP3结构域的基础上构建了小鼠RSP3... 衣藻RSP3是一个鞭毛结构蛋白,目前有关RSP3相关研究主要集中在衣藻上,而对其在哺乳动物中的同源基因的蛋白定位及功能研究甚少。本研究对各个物种的RSP3氨基酸序列进行比对分析,在用SMART软件预测小鼠RSP3结构域的基础上构建了小鼠RSP3真核表达载体,并在CHO细胞中成功表达,应用荧光共定位技术研究小鼠RSP3与微管、内质网及高尔基体的关系。结果表明,小鼠RSP3比衣藻RSP3在N端多出127个氨基酸,两者都含有一个RSP3结构域,RSP3结构域是一个微管结合结构域,而且在进化中高度保守。在CHO细胞中表达的小鼠RSP3并不直接与微管结合,也不定位在内质网或高尔基体,进一步研究发现其聚集分布于细胞质基质中,而且主要分布在细胞核的周围。说明RSP3在进化中较为保守,但在哺乳动物中的分布和功能可能与在衣藻中有所不同。 展开更多
关键词 RSP3 序列分析 亚细胞定位 内质网 高尔基体
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