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Aux/IAA基因家族鉴定及对大豆茎尖发育的调控作用分析
1
作者
刘婷婷
李艳燕
+3 位作者
宁晓霜
刘志华
姜振峰
李文滨
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期648-655,共8页
Aux/IAA基因家族在植物茎尖发育过程发挥重要作用。为了探究大豆Aux/IAA基因家族在大豆茎尖发育过程的调控作用,本文以拟南芥Aux/IAA基因家族蛋白序列为参照鉴定了大豆全基因组Aux/IAA家族基因,包括63个成员;然后以拟南芥、鹰嘴豆和大豆...
Aux/IAA基因家族在植物茎尖发育过程发挥重要作用。为了探究大豆Aux/IAA基因家族在大豆茎尖发育过程的调控作用,本文以拟南芥Aux/IAA基因家族蛋白序列为参照鉴定了大豆全基因组Aux/IAA家族基因,包括63个成员;然后以拟南芥、鹰嘴豆和大豆的Aux/IAA家族为研究对象,比对这些基因全长氨基酸序列并构建进化树,结果表明三种作物的Aux/IAA家族成员间亲缘关系差异明显,进化过程中同源重组频率不同;进而利用RNA-seq技术分析东农594(DN)、Charleston(CH)及二者杂交后代的RIL群体的高矮秆池(WH、WS)和F2群体的高矮秆池(JH、JS)的差异表达基因及其功能,共有17个Aux/IAA基因在3组材料中差异表达。CHvsDN组有15个差异表达基因,JHvsJS组有2个,WHvsWS组只有1个;其中,Glyma.10G180100在JHvsJS组和WHvsWS组均差异表达,这些结果为进一步研究大豆Aux/IAA基因家族的功能及调控茎尖发育提供理论依据。
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关键词
大豆
Aux/IAA基因家族
茎尖
发育调控
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职称材料
题名
Aux/IAA基因家族鉴定及对大豆茎尖发育的调控作用分析
1
作者
刘婷婷
李艳燕
宁晓霜
刘志华
姜振峰
李文滨
机构
东北农业大学大豆研究所
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期648-655,共8页
基金
国家自然科学基金(31571693)
东北农业大学骨干教师项目。
文摘
Aux/IAA基因家族在植物茎尖发育过程发挥重要作用。为了探究大豆Aux/IAA基因家族在大豆茎尖发育过程的调控作用,本文以拟南芥Aux/IAA基因家族蛋白序列为参照鉴定了大豆全基因组Aux/IAA家族基因,包括63个成员;然后以拟南芥、鹰嘴豆和大豆的Aux/IAA家族为研究对象,比对这些基因全长氨基酸序列并构建进化树,结果表明三种作物的Aux/IAA家族成员间亲缘关系差异明显,进化过程中同源重组频率不同;进而利用RNA-seq技术分析东农594(DN)、Charleston(CH)及二者杂交后代的RIL群体的高矮秆池(WH、WS)和F2群体的高矮秆池(JH、JS)的差异表达基因及其功能,共有17个Aux/IAA基因在3组材料中差异表达。CHvsDN组有15个差异表达基因,JHvsJS组有2个,WHvsWS组只有1个;其中,Glyma.10G180100在JHvsJS组和WHvsWS组均差异表达,这些结果为进一步研究大豆Aux/IAA基因家族的功能及调控茎尖发育提供理论依据。
关键词
大豆
Aux/IAA基因家族
茎尖
发育调控
Keywords
soybean
Aux/IAA gene family
shoot tips
development and regulation
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Aux/IAA基因家族鉴定及对大豆茎尖发育的调控作用分析
刘婷婷
李艳燕
宁晓霜
刘志华
姜振峰
李文滨
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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