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基于序列宏基因组学技术的芳香聚酮抗生素的发现 被引量:1
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作者 孟晓露 高凯 冯治洋 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期168-176,共9页
[目的]本文旨在筛选土壤微生物来源的芳香聚酮抗生素。[方法]通过宏基因组学技术,利用基于酮基合成酶基因(KSα)保守序列设计的简并引物筛选土壤宏基因组文库,获得含有芳香聚酮生物合成基因簇的阳性克隆。对阳性克隆质粒测序并通过BLAST... [目的]本文旨在筛选土壤微生物来源的芳香聚酮抗生素。[方法]通过宏基因组学技术,利用基于酮基合成酶基因(KSα)保守序列设计的简并引物筛选土壤宏基因组文库,获得含有芳香聚酮生物合成基因簇的阳性克隆。对阳性克隆质粒测序并通过BLASTx同源比对分析其所包含的芳香聚酮生物合成基因簇。通过接合转移方法将基因簇整合进异源表达宿主白色链霉菌基因组中,培养发酵接合子,利用高效液相色谱技术确定克隆特异性产物并对发酵产物进行抑菌活性检测。[结果]从珠穆朗玛峰土壤宏基因组文库第493号混合文库中扩增得到了1个KSα片段ZF493,蛋白序列分析显示其与酮基合成酶同源,文库筛选得到了含有其对应芳香聚酮生物合成基因簇的阳性克隆cos493。对cos493的测序分析显示其插入片段大小为34 kb,包括酮基合成酶基因(KSα,orf 21)、链长因子基因(KSβ,orf 20)、酰基载体蛋白基因(ACP,orf 19)、环化酶基因(CYC,orf 17和orf 18)、糖基转移酶基因(orf 12)、单加氧酶基因(orf 16)等芳香聚酮合成相关基因。ORF 21与化合物calixanthomycin A聚酮合酶的KSα有67%的相似性,ORF 20与化合物griseorhodin A的KSβ有49%的相似性。通过接合转移使含芳香聚酮合酶基因簇的cos493整合进白色链霉菌宿主基因组中。高效液相色谱分析发酵粗提物发现了2个克隆特异化合物峰,紫外光谱分析显示化合物1在223、296和420 nm处有特征吸收峰,化合物2在214、261和447 nm处有特征吸收峰,特异峰具备芳香聚酮化合物的紫外吸收特征。对发酵粗提物的抑菌活性检测发现,其对金黄色葡萄球菌有抑制作用。[结论]本研究运用基于序列的宏基因组学技术,在链霉菌宿主中表达了来源于土壤微生物的芳香聚酮合酶基因簇并产生了具有抗菌活性的化合物。 展开更多
关键词 宏基因组学 序列筛选 异源表达 芳香聚酮抗生素
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18S rDNA和ITS相结合鉴定一株盐生海芦笋内生真菌的研究 被引量:5
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作者 王惠 湛东锐 +5 位作者 李连强 曹娜 赵育卉 刘天行 孟晓露 辛志宏 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第21期173-176,共4页
对分离自盐生海芦笋的一株代号为Salicorn 8的真菌进行鉴定,提取基因组DNA后分别PCR扩增18S rDNA和ITS区域,基因测序并进行同源性分析,构建ITS基因系统发育树,结合形态学分析,将该菌鉴定为木贼镰刀菌(Fusarium equiseti)。
关键词 海芦笋 鉴定 18S RDNA基因 ITS基因 系统发育分析
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盐生海芦笋内生真菌Salicorn 35的分离鉴定与抗氧化发酵条件优化 被引量:4
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作者 湛东锐 孟晓露 +4 位作者 李连强 曹娜 王惠 刘天行 辛志宏 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第19期158-165,共8页
采用分子生物学与形态学观察相结合的方法,鉴定分离自盐生海芦笋中的内生真菌Salicorn 35。提取基因组DNA后分别对其18S rDNA和ITS1-5.8S-ITS4区域进行PCR扩增并进行单克隆测序分析。将序列提交NCBI进行核酸序列同源性比较,利用MEGA5.0... 采用分子生物学与形态学观察相结合的方法,鉴定分离自盐生海芦笋中的内生真菌Salicorn 35。提取基因组DNA后分别对其18S rDNA和ITS1-5.8S-ITS4区域进行PCR扩增并进行单克隆测序分析。将序列提交NCBI进行核酸序列同源性比较,利用MEGA5.0软件对序列进行分析,构建系统发育树。结合形态学与显微镜观察将该菌鉴定为茄病镰刀菌(Fusarium solani)。在此基础上,以抗氧化活性为指标,采用Plackett-Burman试验、最陡爬坡试验和响应曲面法对Salicorn 35菌株的发酵条件进行优化,最大限度地提高其抗氧化活性。优化后的最佳培养基配方为(质量分数):酵母膏1.5%、蛋白胨2.7%、土豆40%、麦芽糖3%、甘露醇1%、葡萄糖1.5%、味精1.0%、氯化钠6.0%,pH5;采用此培养基所得发酵产物对DPPH自由基的清除率为76.75%,比优化前(清除率57.77%)有显著提高。 展开更多
关键词 内生真菌 分子鉴定 系统发育分析 抗氧化活性 响应曲面法
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产油脂耐盐真菌Salicorn 5的分离鉴定与发酵产物表征
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作者 王惠 孟晓露 +2 位作者 赵育卉 刘天行 辛志宏 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期99-107,共9页
对分离自盐生海芦笋的1株代号为Salicorn 5的耐盐真菌进行鉴定,提取总DNA后分别PCR扩增18S rDNA和ITS1-5.8S-ITS2区域,测序并进行同源性分析,构建ITS基因系统发育树,同时结合形态学分析,将该菌鉴定为小克银汉霉属(Cunninghamella sp.)... 对分离自盐生海芦笋的1株代号为Salicorn 5的耐盐真菌进行鉴定,提取总DNA后分别PCR扩增18S rDNA和ITS1-5.8S-ITS2区域,测序并进行同源性分析,构建ITS基因系统发育树,同时结合形态学分析,将该菌鉴定为小克银汉霉属(Cunninghamella sp.)。该菌经静置发酵后,用环己烷提取发酵产物,并用硅胶柱层析分离得到3个油脂单体化合物,化合物经核磁共振(NMR)和质谱(MS)解析为油酸、亚油酸和1,3油酸双甘油酯。该研究结果说明,小克银汉霉属Salicorn 5菌株能够高产不饱和油脂,具有潜在的工业化应用价值。 展开更多
关键词 海芦笋 内生真菌 分离鉴定 不饱和油脂 结构解析
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祛痰口服液的主要药效学实验研究
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作者 秦艳红 孟晓露 李俊莲 《中医药学刊》 CAS 2003年第11期1898-1898,1925,共2页
关键词 呼吸道感染/中医药疗法 祛痰口服液/治疗应用 祛痰口服液/药理学 小鼠
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盐生海芦笋来源真菌Penicillium stoloniferum发酵产物抗肿瘤活性成分研究 被引量:3
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作者 沈可慧 孟晓露 +1 位作者 刘天行 辛志宏 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第23期278-282,共5页
采用活性追踪的方法,对一株盐生海芦笋来源真菌Penicillium stoloniferum发酵产物中的抗肿瘤活性成分进行分离和鉴定。利用常压硅胶柱层析、Sephedex LH-20、半制备HPLC等分离方法从中分离得到8个单体化合物,通过理化性质分析及波谱学... 采用活性追踪的方法,对一株盐生海芦笋来源真菌Penicillium stoloniferum发酵产物中的抗肿瘤活性成分进行分离和鉴定。利用常压硅胶柱层析、Sephedex LH-20、半制备HPLC等分离方法从中分离得到8个单体化合物,通过理化性质分析及波谱学方法鉴定其化学结构分别为:麦角甾-7,9(11),22-三烯-3-醇、麦角固醇、菠菜甾醇、5α,8α-环二氧-(22E,24R)-23-甲基麦角甾-6,22-二烯-3β-醇、色氨酸-苯丙氨酸-环二肽、苯丙氨酸、邻苯二甲酸正丁酯、邻苯二甲酸异丁酯;以SRB法评价化合物的抗肿瘤活性,5α,8α-环二氧-(22E、24R)-23-甲基麦角甾-6,22-二烯-3β-醇、邻苯二甲酸正丁酯、邻苯二甲酸异丁酯对小鼠乳腺癌P388细胞具有强的细胞毒活性,IC50值分别为14、34、46μg/mL,其他化合物没有活性。 展开更多
关键词 盐生海芦笋真菌 发酵产物 结构鉴定 抗肿瘤活性
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