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人肿瘤关联钙信号转导因子2的生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
张玉洁
孙怡琳
+1 位作者
朱苹
马晓丽
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2020年第6期570-576,共7页
目的人肿瘤关联钙信号转导因子2(TACSTD2)在肿瘤形成过程中的促癌作用越来越受到重视。文中旨在采用生物信息学方法预测TACSTD2的分子结构和生物学功能,为进一步研究TACSTD2的功能提供借鉴。方法获取人源性TACSTD2基因mRNA和蛋白氨基酸...
目的人肿瘤关联钙信号转导因子2(TACSTD2)在肿瘤形成过程中的促癌作用越来越受到重视。文中旨在采用生物信息学方法预测TACSTD2的分子结构和生物学功能,为进一步研究TACSTD2的功能提供借鉴。方法获取人源性TACSTD2基因mRNA和蛋白氨基酸序列,利用生物信息学方法分析TACSTD2蛋白开放阅读框(ORF)、理化性质、信号肽、亚细胞定位,预测TACSTD2蛋白的跨膜结构、二级结构、三级结构、结构域、蛋白修饰位点,最后预测TACSTD2蛋白的互作蛋白并进行相关的通路分析,及TACSTD2在人不同正常组织和肿瘤组织中的mRNA和蛋白表达水平。结果TACSTD2的mR⁃NA序列得到的ORF有12个,最长的ORF是ORF1,共972bp,可编码323个氨基酸。TACSTD2蛋白亲水性的氨基酸要多于疏水性的氨基酸,表明TACSTD2蛋白属于亲水性蛋白。TACSTD2是一种高度保守的碱性分泌蛋白,在胞质内外均有跨膜区。TACSTD2氨基酸序列存在核定位信号(nuclear localization signal,NLS),提示TACSTD2可定位于细胞核。TACSTD2蛋白主要分布在细胞质膜、细胞外、细胞核以及细胞质。二级结构预测结果表明,TACSTD2蛋白主要为环状结构,其次为螺旋结构。TACSTD2蛋白有15个丝氨酸修饰位点,17个苏氨酸修饰位点,8个酪氨酸修饰位点。TACSTD2与Claudin(CLDN)家族蛋白存在蛋白互作。TACSTD2参与以下信号通路:细胞表面受体信号通路、视觉感知细胞增殖、上皮细胞迁移的负调控、上皮细胞增殖的调节、对刺激的反应等。与正常组织比较,TACSTD2的mRNA在宫颈癌、肺癌、甲状腺癌、子宫癌、肝癌、结直肠癌中等肿瘤组织高表达。结论TACSTD2在多种恶性肿瘤中高表达,可通过细胞表面受体信号参与恶性肿瘤细胞的增殖、迁移、粘附等过程,为进一步研究TACSTD2的功能提供借鉴。
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关键词
人肿瘤关联钙信号转导因子2
开放阅读框
蛋白结构
细胞增殖
生物信息学
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职称材料
基于Oncomine和TCGA数据库分析CHRNA5在肺鳞癌中的表达及临床意义
2
作者
张玉洁
朱苹
+2 位作者
孙怡琳
郏雁飞
马晓丽
《陕西科技大学学报》
CAS
2020年第2期67-71,76,共6页
为了分析烟碱型胆碱能受体5(cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit,CHRNA5)在肺鳞癌中的表达及其临床意义,利用Oncomine数据库信息分析CHRNA5基因在肿瘤及肺鳞癌组织中的表达情况;利用TCGA数据库信息分析CHRNA5基因在肺鳞癌...
为了分析烟碱型胆碱能受体5(cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit,CHRNA5)在肺鳞癌中的表达及其临床意义,利用Oncomine数据库信息分析CHRNA5基因在肿瘤及肺鳞癌组织中的表达情况;利用TCGA数据库信息分析CHRNA5基因在肺鳞癌患者中的表达及与临床参数的相关性;利用免疫组化方法检测52例临床肺鳞癌组织样本和52例癌旁组织样本中CHRNA5编码蛋白α5-nAchR的表达情况,探讨α5-nAchR表达与患者临床病理特征的关系。结果表明:Oncomine数据库中共有402项关于CHRNA5在不同肿瘤表达水平的相关研究,CHRNA5表达存在统计学差异有27项,其中有4项研究显示,CHRNA5在肺癌组织与正常组织中的表达有显著差异,且2项表明CHRNA5在肺鳞癌中的表达量显著高于正常组织.TCGA数据库结果显示,α5-nAchR表达水平与肺鳞癌患者的年龄、性别、吸烟史以及吸烟量密切相关.52例肺鳞癌组织样本免疫组织化学结果显示,α5-nAchR蛋白在肺鳞癌组织中的表达明显高于癌旁组织,且在肺鳞癌样本中α5-nAchR的表达和患者吸烟史密切相关.本研究表明CHRNA5基因在吸烟相关性肺鳞癌发生发展中可能发挥重要作用,CHRNA5有望成为肺癌治疗的靶点之一,为进一步阐明其在吸烟相关性肿瘤发生中的作用提供理论基础.
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关键词
CHRNA5
α5-nAchR
数据库
吸烟史
肺鳞癌
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职称材料
争拉存款弊端多 结算管理需加强──对富阳县金融机构争揽存款的调查
3
作者
王健敏
孙怡琳
《浙江金融》
北大核心
1994年第3期34-35,共2页
争拉存款弊端多结算管理需加强──对富阳县金融机构争揽存款的调查王健敏，孙怡琳随着金融体制改革的深化，专业银行正在逐步向商业银行转化，存款是银行的生命，没有存款就没有银行的道理，越来越被金融机构的领导和职工所认识。狠抓...
争拉存款弊端多结算管理需加强──对富阳县金融机构争揽存款的调查王健敏，孙怡琳随着金融体制改革的深化，专业银行正在逐步向商业银行转化，存款是银行的生命，没有存款就没有银行的道理，越来越被金融机构的领导和职工所认识。狠抓存款，发放贷款，支持经济建设，无疑...
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关键词
金融机构
富阳县
结算管理
信贷监督
结算纪律
上门收款
现金管理
多头开户
结算工作
转帐支票
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职称材料
题名
人肿瘤关联钙信号转导因子2的生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
张玉洁
孙怡琳
朱苹
马晓丽
机构
潍坊医学院医学检验学系
西北农林科技大学理学院
山东大学附属济南市中心医院中心实验室
出处
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2020年第6期570-576,共7页
基金
国家自然科学基金(81602593)
山东省自然科学基金(ZR2018MH021)。
文摘
目的人肿瘤关联钙信号转导因子2(TACSTD2)在肿瘤形成过程中的促癌作用越来越受到重视。文中旨在采用生物信息学方法预测TACSTD2的分子结构和生物学功能,为进一步研究TACSTD2的功能提供借鉴。方法获取人源性TACSTD2基因mRNA和蛋白氨基酸序列,利用生物信息学方法分析TACSTD2蛋白开放阅读框(ORF)、理化性质、信号肽、亚细胞定位,预测TACSTD2蛋白的跨膜结构、二级结构、三级结构、结构域、蛋白修饰位点,最后预测TACSTD2蛋白的互作蛋白并进行相关的通路分析,及TACSTD2在人不同正常组织和肿瘤组织中的mRNA和蛋白表达水平。结果TACSTD2的mR⁃NA序列得到的ORF有12个,最长的ORF是ORF1,共972bp,可编码323个氨基酸。TACSTD2蛋白亲水性的氨基酸要多于疏水性的氨基酸,表明TACSTD2蛋白属于亲水性蛋白。TACSTD2是一种高度保守的碱性分泌蛋白,在胞质内外均有跨膜区。TACSTD2氨基酸序列存在核定位信号(nuclear localization signal,NLS),提示TACSTD2可定位于细胞核。TACSTD2蛋白主要分布在细胞质膜、细胞外、细胞核以及细胞质。二级结构预测结果表明,TACSTD2蛋白主要为环状结构,其次为螺旋结构。TACSTD2蛋白有15个丝氨酸修饰位点,17个苏氨酸修饰位点,8个酪氨酸修饰位点。TACSTD2与Claudin(CLDN)家族蛋白存在蛋白互作。TACSTD2参与以下信号通路:细胞表面受体信号通路、视觉感知细胞增殖、上皮细胞迁移的负调控、上皮细胞增殖的调节、对刺激的反应等。与正常组织比较,TACSTD2的mRNA在宫颈癌、肺癌、甲状腺癌、子宫癌、肝癌、结直肠癌中等肿瘤组织高表达。结论TACSTD2在多种恶性肿瘤中高表达,可通过细胞表面受体信号参与恶性肿瘤细胞的增殖、迁移、粘附等过程,为进一步研究TACSTD2的功能提供借鉴。
关键词
人肿瘤关联钙信号转导因子2
开放阅读框
蛋白结构
细胞增殖
生物信息学
Keywords
human tumor⁃associated calcium signal transducer 2
open reading frame
protein structure
cell proliferation
bioinformatics
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
基于Oncomine和TCGA数据库分析CHRNA5在肺鳞癌中的表达及临床意义
2
作者
张玉洁
朱苹
孙怡琳
郏雁飞
马晓丽
机构
潍坊医学院临床检验诊断学系
西北农林科技大学理学院
山东第一医科大学附属中心医院基础医学研究中心
出处
《陕西科技大学学报》
CAS
2020年第2期67-71,76,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81602593)
山东省自然科学基金项目(ZR2018MH021)。
文摘
为了分析烟碱型胆碱能受体5(cholinergic receptor nicotinic alpha 5 subunit,CHRNA5)在肺鳞癌中的表达及其临床意义,利用Oncomine数据库信息分析CHRNA5基因在肿瘤及肺鳞癌组织中的表达情况;利用TCGA数据库信息分析CHRNA5基因在肺鳞癌患者中的表达及与临床参数的相关性;利用免疫组化方法检测52例临床肺鳞癌组织样本和52例癌旁组织样本中CHRNA5编码蛋白α5-nAchR的表达情况,探讨α5-nAchR表达与患者临床病理特征的关系。结果表明:Oncomine数据库中共有402项关于CHRNA5在不同肿瘤表达水平的相关研究,CHRNA5表达存在统计学差异有27项,其中有4项研究显示,CHRNA5在肺癌组织与正常组织中的表达有显著差异,且2项表明CHRNA5在肺鳞癌中的表达量显著高于正常组织.TCGA数据库结果显示,α5-nAchR表达水平与肺鳞癌患者的年龄、性别、吸烟史以及吸烟量密切相关.52例肺鳞癌组织样本免疫组织化学结果显示,α5-nAchR蛋白在肺鳞癌组织中的表达明显高于癌旁组织,且在肺鳞癌样本中α5-nAchR的表达和患者吸烟史密切相关.本研究表明CHRNA5基因在吸烟相关性肺鳞癌发生发展中可能发挥重要作用,CHRNA5有望成为肺癌治疗的靶点之一,为进一步阐明其在吸烟相关性肿瘤发生中的作用提供理论基础.
关键词
CHRNA5
α5-nAchR
数据库
吸烟史
肺鳞癌
Keywords
CHRNA5
α5-nAchR
database
smoking history
lung squamous cell carcinoma
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
争拉存款弊端多 结算管理需加强──对富阳县金融机构争揽存款的调查
3
作者
王健敏
孙怡琳
机构
人民银行富阳县支行
出处
《浙江金融》
北大核心
1994年第3期34-35,共2页
文摘
争拉存款弊端多结算管理需加强──对富阳县金融机构争揽存款的调查王健敏，孙怡琳随着金融体制改革的深化，专业银行正在逐步向商业银行转化，存款是银行的生命，没有存款就没有银行的道理，越来越被金融机构的领导和职工所认识。狠抓存款，发放贷款，支持经济建设，无疑...
关键词
金融机构
富阳县
结算管理
信贷监督
结算纪律
上门收款
现金管理
多头开户
结算工作
转帐支票
分类号
F832.7 [经济管理—金融学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人肿瘤关联钙信号转导因子2的生物信息学分析
张玉洁
孙怡琳
朱苹
马晓丽
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于Oncomine和TCGA数据库分析CHRNA5在肺鳞癌中的表达及临床意义
张玉洁
朱苹
孙怡琳
郏雁飞
马晓丽
《陕西科技大学学报》
CAS
2020
0
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职称材料
3
争拉存款弊端多 结算管理需加强──对富阳县金融机构争揽存款的调查
王健敏
孙怡琳
《浙江金融》
北大核心
1994
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