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荷斯坦牛肌肉组织中与妊娠末期、泌乳期及繁殖力相关的基因共表达网络构建
1
作者 唐雪颖 张志飞 +4 位作者 童雄 陈卫东 闵力 巨向红 李大刚 《广东农业科学》 CAS 2024年第2期101-111,共11页
【目的】筛选荷斯坦牛肌肉组织中与妊娠末期、泌乳期及繁殖力相关的关键目标基因,为进一步开展基因功能研究提供理论依据。【方法】选择GEO数据库中有关荷斯坦牛在妊娠末期、泌乳早期和泌乳中期肌肉基因表达及生育能力的数据集GSE62159... 【目的】筛选荷斯坦牛肌肉组织中与妊娠末期、泌乳期及繁殖力相关的关键目标基因,为进一步开展基因功能研究提供理论依据。【方法】选择GEO数据库中有关荷斯坦牛在妊娠末期、泌乳早期和泌乳中期肌肉基因表达及生育能力的数据集GSE62159,采用加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法进行基因共表达分析,将获得的模块与妊娠末期、泌乳中期及繁殖力性状相关联,选择各模块中连接度处于前30的基因作为枢纽基因(Hub基因),使用String网站对模块进行蛋白互作(Protein-protein interaction,PPI)网络分析,选择PPI网络中节点连接度值排名前30的基因作为核心基因,与Hub基因交集得到在肌肉中与不同生理时期及繁殖力相关的关键目标基因。【结果】研究共分析得到13个模块,其中Green、Blue两个模块分别与妊娠末期、泌乳中期相关,Magenta模块与繁殖力相关。对各目标模块内基因进行功能富集分析,富集结果显示肌肉组织中与妊娠末期相关的基因功能主要有物质代谢、能量代谢、蛋白质合成与分泌、机体对氧化应激的反应及神经退行性变等;与泌乳中期相关的基因功能有干细胞群维持、蛋白质合成与分泌、抗原加工与呈递及多种疾病发生等;与繁殖力相关的基因功能有血管形成、子宫内胚胎发育与肌动蛋白丝结合等。筛选到荷斯坦牛肌肉中与妊娠末期相关的关键基因有3个、与泌乳中期相关的关键基因有1个、与繁殖力相关的关键基因有8个。【结论】鉴定到荷斯坦牛肌肉组织中与妊娠末期相关的基因为EIF5A、ACO2和EEF1G,与泌乳中期相关的基因为EIF4A2,与繁殖力相关的基因为ITGB1、MYH9、TLN1、CAV1、COL4A1、COL4A2、FLNA和HSPG2。 展开更多
关键词 荷斯坦牛 肌肉组织 基因表达 泌乳期 繁殖力 加权基因共表达网络分析(WGCNA)
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准噶尔盆地南缘中段喀拉扎组成岩相类型及优质储层主控因素
2
作者 司振宇 朱锐 +3 位作者 袁波 冀冬生 唐雪颖 赵格尔 《东北石油大学学报》 北大核心 2024年第6期1-16,I0001,I0002,共18页
准噶尔盆地南缘中段储层获得高产油气流,油气勘探潜力巨大,但优质储层主控因素不明确。采用薄片鉴定、扫描电镜和物性测试等方法,结合测、录井等钻井资料,分析盆地南缘中段喀拉扎组储层成岩作用类型、强度及其演化特征,明确优质储层的... 准噶尔盆地南缘中段储层获得高产油气流,油气勘探潜力巨大,但优质储层主控因素不明确。采用薄片鉴定、扫描电镜和物性测试等方法,结合测、录井等钻井资料,分析盆地南缘中段喀拉扎组储层成岩作用类型、强度及其演化特征,明确优质储层的主控因素。结果表明:喀拉扎组储层主要发育岩屑砂岩,成分成熟度低,结构成熟度中等,储集空间以残余粒间孔为主。喀拉扎组储层受沉积因素、成岩相及地层温压条件控制,沉积作用是优质储层发育的基础,成岩作用是储层改造的关键因素。储层可划分为中压实—弱胶结相、中压实—中胶结相、中压实—强胶结相和强压实致密相4种成岩相,其中中压实—弱胶结相物性最好,为最有利储层,主要发育于水下分流河道微相;中压实—中胶结相物性次之,主要发育于河口坝微相;中压实—强胶结相和强压实致密相物性最差,为非储层。异常高压和持续降低的地温梯度有效降低压实作用的影响,也是储层物性保存的重要因素。该结果为研究区下一步的勘探开发提供指导。 展开更多
关键词 成岩相 成岩作用 储层控制因素 喀拉扎组 准噶尔盆地南缘
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荷斯坦奶牛肝脏组织中与泌乳时期及繁殖力相关的基因共表达网络构建
3
作者 张志飞 唐雪颖 +4 位作者 闵力 童雄 陈卫东 巨向红 李大刚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期528-539,共12页
旨在运用加权基因共表达网络分析技术(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选出荷斯坦奶牛(Bos taurus)肝脏组织中与泌乳时期及繁殖力相关的基因。本研究采用GEO数据库中的GSE62159数据集,该数据集分别包含高繁殖力... 旨在运用加权基因共表达网络分析技术(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选出荷斯坦奶牛(Bos taurus)肝脏组织中与泌乳时期及繁殖力相关的基因。本研究采用GEO数据库中的GSE62159数据集,该数据集分别包含高繁殖力(分泌到配种的平均时间间隔为85.6 d,n=24)和低繁殖力(分泌到配种的平均时间间隔为113.8 d,n=24)健康荷斯坦母牛在妊娠后期、泌乳初期和泌乳中期的肝脏组织转录组数据,使用R语言中的WGCNA包对该数据集进行共表达分析。将所得到的模块与不同泌乳时期以及不同繁殖力进行关联分析,得到目标模块,再依据连接度选择出排名前30的基因作为枢纽基因(Hub基因),对Hub基因进行功能富集分析,使用String网站构建出模块的蛋白互作网络(PPI),并使用Cytoscape软件筛选出Hub基因与蛋白互作分析(PPI)网络核心基因的交集,最终得到肝脏中与泌乳时期及繁殖力相关的目标基因。研究共得到14个模块,其中tan、greenyellow两个模块与泌乳时期相关,black模块与繁殖力相关。对hub基因进行富集分析后,发现肝脏中与泌乳早期相关基因功能主要包括:有物质的合成代谢途径、脂质脂蛋白的基因表达、蛋白质的合成到分泌等;与泌乳中期相关基因功能主要包括:疾病、机体的炎症反应、免疫反应以及急性期等;与繁殖力相关基因功能主要包括:胰岛素抵抗、子宫内膜癌以及癌症等。筛选到的12个肝脏中与泌乳早期相关的目标基因有RPN1、SEC 61A1、SEC 61B、SEC 61G、SSR1、SSR3、STT 3A、DAD1、DDOST、ERLEC1、HM 13和OSTC;6个与泌乳中期相关的目标基因有ITGAL、ITGB2、LAPTM5、PTPRC、C 3AR1和CTSS;4个与繁殖力相关的目标基因有:PDS 5A、ROCK1、AQR和LTN 1。本研究使用WGCNA、PPI、基因功能富集等生物信息学方法,鉴定得到荷斯坦奶牛肝脏中与泌乳时期、繁殖力相关的目标基因,并对目标基因进行了功能富集分析,为高繁殖力及高产奶牛培育方向的科研工作积累了理论资料。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 肝脏 泌乳 繁殖性能 加权基因共表达网络分析
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霍尔果斯背斜紫泥泉子组油气藏气侵作用及主控因素 被引量：3
4
作者 唐雪颖 杨强 +2 位作者 袁波 阎桂华 魏凌云 《新疆石油地质》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期550-554,共5页
为确定霍尔果斯背斜紫泥泉子组油气藏气侵作用及其主控因素,利用油气地球化学性质分析、包裹体测试、地震等方法,对该区块发生气侵分馏作用的油气藏进行研究,分析了气侵分馏作用对油气藏的影响。研究表明,研究区有机质丰度高,具有持续... 为确定霍尔果斯背斜紫泥泉子组油气藏气侵作用及其主控因素,利用油气地球化学性质分析、包裹体测试、地震等方法,对该区块发生气侵分馏作用的油气藏进行研究,分析了气侵分馏作用对油气藏的影响。研究表明,研究区有机质丰度高,具有持续生气的能力;数量众多的断裂以及油气充注时间等地质条件匹配良好,使油气藏发生大规模气侵分馏作用;地层压力和垂向深度是控制气侵分馏作用强度的主要因素;气侵分馏作用是导致该油气藏形成稠油、低蜡质凝析油和高蜡质油等复杂原油类型的直接原因。 展开更多
关键词 准噶尔盆地 霍尔果斯背斜 紫泥泉子组 气侵分馏作用 主控因素
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准噶尔盆地南缘冲断带侏罗系喀拉扎组沉积特征 被引量：9
5
作者 司学强 袁波 +5 位作者 彭博 冀冬生 郭华军 唐雪颖 窦洋 李亚哲 《新疆石油地质》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期389-398,共10页
为明确准噶尔盆地南缘冲断带深层储集层特征,在露头剖面观测基础上,结合录井、微量元素及重矿物资料,对准噶尔盆地南缘侏罗系喀拉扎组沉积相标志、沉积相类型、物源方向、沉积相展布及沉积模式开展研究。研究区喀拉扎组主要发育冲积扇... 为明确准噶尔盆地南缘冲断带深层储集层特征,在露头剖面观测基础上,结合录井、微量元素及重矿物资料,对准噶尔盆地南缘侏罗系喀拉扎组沉积相标志、沉积相类型、物源方向、沉积相展布及沉积模式开展研究。研究区喀拉扎组主要发育冲积扇和辫状河三角洲2种沉积相,平面上发育3个大型沉积体系,自西至东分别是齐古断褶带中段的冲积扇—辫状河三角洲沉积体系、齐古断褶带东段头屯河地区的辫状河三角洲沉积体系和阜康断裂带的辫状河三角洲沉积体系;纵向上,喀拉扎组表现为进积沉积序列,自下而上发育4个沉积旋回。喀拉扎组沉积相类型及平面展布主要受侏罗纪晚期天山造山带活动的控制,3个大型沉积体系在盆地内部形成了厚度超过200m的砂岩储集层,特别是辫状河三角洲前缘砂体分选好,厚度大,分布面积广,可与深层大型背斜构造相匹配,成为有利的勘探目标区。 展开更多
关键词 准噶尔盆地 南缘冲断带 侏罗系 喀拉扎组 冲积扇 辫状河三角洲 沉积相 沉积模式
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皱纹盘鲍糖原合成酶基因多态性与糖原含量的相关性分析 被引量：1
6
作者 唐雪颖 徐欣悦 +2 位作者 田芝林 陈燕 林思恒 《中国食品工业》 2023年第24期83-85,88,共4页
糖原是皱纹盘鲍重要的营养性状,是高品质鲍鱼选育的重要指标。糖原合成酶(GS)是糖原合成代谢过程中的关键酶。本研究证实了糖原合成酶基因的表达量与糖原含量呈显著正相关。为了探讨糖原合成酶多态性与糖原含量的相关性,利用直接测序法... 糖原是皱纹盘鲍重要的营养性状,是高品质鲍鱼选育的重要指标。糖原合成酶(GS)是糖原合成代谢过程中的关键酶。本研究证实了糖原合成酶基因的表达量与糖原含量呈显著正相关。为了探讨糖原合成酶多态性与糖原含量的相关性,利用直接测序法在264个皱纹盘鲍中筛选并鉴定了3个位于GS基因外显子区的SNP位点。遗传多态性及相关性分析结果显示GS基因SNP1的GG基因型与高糖原含量显著相关,可作为高糖原含量选育的优势位点。这些结果揭示了糖原合成酶基因多态性对糖原含量的潜在影响,为糖原性状的选育提供分子标记。 展开更多
关键词 皱纹盘鲍 糖原合成酶 单核苷酸多态性
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准噶尔盆地南缘中西段油气成藏研究进展及下组合勘探方向 被引量：2
7
作者 赵进雍 唐雪颖 +2 位作者 丁玉才 康永尚 袁春林 《科技通报》 2023年第5期7-16,共10页
准噶尔盆地南缘自南向北发育三排构造带,垂向上划分3个油气成藏组合,随高探1井勘探重大突破,下组合成藏问题受到关注。本文在综合前人研究成果的基础上,通过对南缘燕山期古构造分析、各类型原油在不同构造带和不同成藏组合的分布以及燕... 准噶尔盆地南缘自南向北发育三排构造带,垂向上划分3个油气成藏组合,随高探1井勘探重大突破,下组合成藏问题受到关注。本文在综合前人研究成果的基础上,通过对南缘燕山期古构造分析、各类型原油在不同构造带和不同成藏组合的分布以及燕山期古构造与烃源岩生油时间的匹配分析,预测下组合勘探方向。(1)燕山期形成了三排构造带下组合的构造雏形,喜山构造运动对燕山古构造进行了加强,喜山期构造运动强化了燕山期古构造并形成了中、上组合构造体。(2)准南发育4套有效烃源岩,其中二叠系烃源岩、中下侏罗统烃源岩以及白垩系烃源岩发育于准南中-西段,古近系烃源岩发育于准南西段。(3)南缘中-西段烃源岩生烃时间与古构造演化过程匹配程度高,南缘西段中下侏罗统烃源岩生油时间与燕山期古构造活动时间一致,有利于在下组合形成油气藏。(4)南缘中段二叠系和中下侏罗统烃源岩生油时间与第一排构造带燕山期古构造匹配较好,有利于在下组合形成油气藏,上盘地层油气较为富集。根据烃源岩展布规律及古构造演化,第二排构造带下组合可作为油气勘探的重点领域,准南西段第二排构造带下组合最具勘探潜力。 展开更多
关键词 燕山期古构造 有效烃源岩 生油时间 原油类型 下组合
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齐古断褶带中-下侏罗统储集层成岩特征及评价 被引量：7
8
作者 郭华军 司学强 +2 位作者 唐雪颖 徐洋 彭博 《新疆石油地质》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期46-54,共9页
准噶尔盆地南缘齐古断褶带中-下侏罗统发育多套砂岩储集层。基于齐古断褶带露头剖面和钻井资料分析,利用偏光显微镜、孔渗分析仪、扫描电镜等实验仪器对中-下侏罗统砂岩样品开展了岩矿特征、成岩作用、成岩相、物性特征等方面的分析,并... 准噶尔盆地南缘齐古断褶带中-下侏罗统发育多套砂岩储集层。基于齐古断褶带露头剖面和钻井资料分析,利用偏光显微镜、孔渗分析仪、扫描电镜等实验仪器对中-下侏罗统砂岩样品开展了岩矿特征、成岩作用、成岩相、物性特征等方面的分析,并对储集层进行了分类和评价。结果表明,齐古断褶带中-下侏罗统砂岩主要为长石岩屑砂岩和岩屑砂岩,结构成熟度中等,成分成熟度低;成岩作用主要有压实作用、胶结作用和溶蚀作用,可分为少杂基弱胶结成岩相、不稳定矿物溶蚀成岩相、碳酸盐矿物胶结成岩相和杂基充填-压实成岩相4种成岩相类型,成岩相直接影响了储集层物性,中-下侏罗统储集层可分为2大类6小类,部分含油气层为致密砂岩储集层。 展开更多
关键词 准噶尔盆地 齐古断褶带 中—下侏罗统 致密砂岩 储集层分类 成岩特征 成岩阶段 成岩相
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牡蛎副溶血性弧菌原位LAMP方法的建立
9
作者 邱洁瑜 许乐儿 +3 位作者 张晴雅 金依风 林聪艳 唐雪颖 《中国食品工业》 2023年第23期57-59,共3页
副溶血性弧菌是造成海产品食源性疾病的重要病原菌之一。为精确定位副溶血性弧菌在牡蛎鳃、外套膜、内脏团、闭壳肌中的分布,明确副溶血性弧菌的组织亲嗜性和侵染进程,研究基于环介导等温扩增技术(LAMP)和原位杂交技术,建立牡蛎副溶血... 副溶血性弧菌是造成海产品食源性疾病的重要病原菌之一。为精确定位副溶血性弧菌在牡蛎鳃、外套膜、内脏团、闭壳肌中的分布,明确副溶血性弧菌的组织亲嗜性和侵染进程,研究基于环介导等温扩增技术(LAMP)和原位杂交技术,建立牡蛎副溶血性弧菌原位LAMP检测方法。利用该方法发现副溶血性弧菌经鳃组织过滤,在内脏团消化道快速扩增并蔓延至闭壳肌和外套膜等外围组织,属于Ⅳ型发病机制。该方法同步实现对副溶血性弧菌的高灵敏度和精确定位检测,为进一步研究牡蛎应对副溶血性弧菌的免疫反应奠定了基础。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 原位LAMP 病原检测
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