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基于Vgg16-Unet模型的MRI图像下前列腺分区智能分割研究
被引量:
5
1
作者
呼延若曦
吴哲
+5 位作者
许杉杉
崔慧林
曹锡梅
马晋锋
吴毅
顾玮
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第13期1441-1449,共9页
目的基于前列腺核磁共振图像(MRI),构建深度学习智能分割模型,展开MRI图像下前列腺分区的智能分割研究。方法收集山西省肿瘤医院2018年1月至2020年10月33例经MRI扫描的前列腺癌患者T2WI本地数据,包括T1期6例,T2期15例,T3期9例,T4期3例...
目的基于前列腺核磁共振图像(MRI),构建深度学习智能分割模型,展开MRI图像下前列腺分区的智能分割研究。方法收集山西省肿瘤医院2018年1月至2020年10月33例经MRI扫描的前列腺癌患者T2WI本地数据,包括T1期6例,T2期15例,T3期9例,T4期3例。选取荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心提供的前列腺MRI公开数据集中前列腺癌患者的T2WI序列数据,共379例数据,所有数据按照7∶1∶2的比例随机划分为训练集265例、验证集38例和测试集76例。在Unet模型基础上以Vgg16模型为编码器,使用多层卷积层的同时利用迁移学习策略,构建Vgg16-Unet模型,以医师手工勾画和标注的前列腺分区(前纤维基质带、中央带、外周带、移形带)为金标准,在测试集上,采用Dice相似系数(Dice similarity coefficient,DSC)、95%豪斯多夫距离(95%Hausdorff surface Distance,HD95)评估模型对前列腺分区的分割精度。结果模型在测试集上对前纤维基质带、中央带、外周带、移形带实现了较为准确的分割,其平均DSC分别为56.95%、47.28%、80.78%、90.63%,平均HD95分别为20.84、20.02、15.39、11.20 mm。模型智能分割与手工标注测量的体积一致性较好,其差值均位于95%一致性区间内。结论构建的Vgg16-Unet模型分割精度优于Unet、Unet++、ResUnet++3个Unet经典变种网络,能够显著提高前列腺癌MRI图像分割效率,减轻医师工作量。
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关键词
深度学习
前列腺肿瘤
智能分割
核磁共振成像
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职称材料
基于深度学习的MRI图像下前列腺癌T分期诊断研究
被引量:
3
2
作者
许杉杉
呼延若曦
+6 位作者
吴哲
刘小兵
姚洁
崔慧林
马晋峰
吴毅
曹锡梅
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1229-1236,共8页
目的通过与Dense-Net、Res-Net和Vision-Transformer(ViT)网络比较,探讨Swin-Transformer(SwinT)网络在前列腺癌MRI图像T分期诊断中的优势。方法收集2018年4月至2022年1月期间山西省肿瘤医院和陆军军医大学第二附属医院共152例经病理活...
目的通过与Dense-Net、Res-Net和Vision-Transformer(ViT)网络比较,探讨Swin-Transformer(SwinT)网络在前列腺癌MRI图像T分期诊断中的优势。方法收集2018年4月至2022年1月期间山西省肿瘤医院和陆军军医大学第二附属医院共152例经病理活检证实的前列腺癌患者的MRI图像,包括T2WI和fT2WI两种序列共计3017幅。依据临床T分期报告,将患者图像分为2类:低中危组(T≤T2c)和高危组(T≥T3a),并将所有患者按照7∶1∶2的比例简单随机划分为训练集(n=107)、验证集(n=15)和测试集(n=30)用于训练智能T分期诊断模型。采用准确度、精确度、混淆矩阵、受试者工作特征曲线(ROC)以及ROC曲线下面积(AUC)等参数评估各网络的诊断效能。结果在低中危组和高危组的二分类中,Dense-Net、Res-Net、ViT以及SwinT网络模型训练集中精确率分别为0.587、0.410、0.600、0.680,以及AUC分别为0.630、0.477、0.648、0.708。SwinT网络模型热力图的注意力主要集中在前列腺区域,特征提取效果最好。结论相比Dense-Net、Res-Net及ViT网络,SwinT网络在前列腺癌MRI图像分类任务中取得了最优的预测性能,可用于前列腺癌T分期的智能诊断,提高诊疗效率。
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关键词
深度学习
前列腺癌
T分期诊断
分类
磁共振成像
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职称材料
题名
基于Vgg16-Unet模型的MRI图像下前列腺分区智能分割研究
被引量:
5
1
作者
呼延若曦
吴哲
许杉杉
崔慧林
曹锡梅
马晋锋
吴毅
顾玮
机构
重庆大学医学院
重庆大学生物工程学院
陆军军医大学(第三军医大学)生物医学工程与影像医学系数字医学教研室
山西医科大学组织胚胎学教研室
山西省肿瘤医院普外科
出处
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第13期1441-1449,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(31971113)
重庆市科技英才项目(CQYC201905037)。
文摘
目的基于前列腺核磁共振图像(MRI),构建深度学习智能分割模型,展开MRI图像下前列腺分区的智能分割研究。方法收集山西省肿瘤医院2018年1月至2020年10月33例经MRI扫描的前列腺癌患者T2WI本地数据,包括T1期6例,T2期15例,T3期9例,T4期3例。选取荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心提供的前列腺MRI公开数据集中前列腺癌患者的T2WI序列数据,共379例数据,所有数据按照7∶1∶2的比例随机划分为训练集265例、验证集38例和测试集76例。在Unet模型基础上以Vgg16模型为编码器,使用多层卷积层的同时利用迁移学习策略,构建Vgg16-Unet模型,以医师手工勾画和标注的前列腺分区(前纤维基质带、中央带、外周带、移形带)为金标准,在测试集上,采用Dice相似系数(Dice similarity coefficient,DSC)、95%豪斯多夫距离(95%Hausdorff surface Distance,HD95)评估模型对前列腺分区的分割精度。结果模型在测试集上对前纤维基质带、中央带、外周带、移形带实现了较为准确的分割,其平均DSC分别为56.95%、47.28%、80.78%、90.63%,平均HD95分别为20.84、20.02、15.39、11.20 mm。模型智能分割与手工标注测量的体积一致性较好,其差值均位于95%一致性区间内。结论构建的Vgg16-Unet模型分割精度优于Unet、Unet++、ResUnet++3个Unet经典变种网络,能够显著提高前列腺癌MRI图像分割效率,减轻医师工作量。
关键词
深度学习
前列腺肿瘤
智能分割
核磁共振成像
Keywords
deep learning
prostate tumor
intelligent segmentation
magnetic resonance image
分类号
R312 [医药卫生—基础医学]
R445.2 [医药卫生—影像医学与核医学]
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于深度学习的MRI图像下前列腺癌T分期诊断研究
被引量:
3
2
作者
许杉杉
呼延若曦
吴哲
刘小兵
姚洁
崔慧林
马晋峰
吴毅
曹锡梅
机构
山西医科大学组织胚胎学教研室
陆军军医大学(第三军医大学)生物医学工程与影像医学系数字医学教研室
陆军军医大学(第三军医大学)第二附属医院泌尿外科
山西省肿瘤医院普外科
出处
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1229-1236,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31971113)
重庆市科技英才项目(CQYC201905037)
+1 种基金
陆军科技人才工程项目(91003201901973)
陆军军医大学第二附属医院青博项目(2022YQB043)。
文摘
目的通过与Dense-Net、Res-Net和Vision-Transformer(ViT)网络比较,探讨Swin-Transformer(SwinT)网络在前列腺癌MRI图像T分期诊断中的优势。方法收集2018年4月至2022年1月期间山西省肿瘤医院和陆军军医大学第二附属医院共152例经病理活检证实的前列腺癌患者的MRI图像,包括T2WI和fT2WI两种序列共计3017幅。依据临床T分期报告,将患者图像分为2类:低中危组(T≤T2c)和高危组(T≥T3a),并将所有患者按照7∶1∶2的比例简单随机划分为训练集(n=107)、验证集(n=15)和测试集(n=30)用于训练智能T分期诊断模型。采用准确度、精确度、混淆矩阵、受试者工作特征曲线(ROC)以及ROC曲线下面积(AUC)等参数评估各网络的诊断效能。结果在低中危组和高危组的二分类中,Dense-Net、Res-Net、ViT以及SwinT网络模型训练集中精确率分别为0.587、0.410、0.600、0.680,以及AUC分别为0.630、0.477、0.648、0.708。SwinT网络模型热力图的注意力主要集中在前列腺区域,特征提取效果最好。结论相比Dense-Net、Res-Net及ViT网络,SwinT网络在前列腺癌MRI图像分类任务中取得了最优的预测性能,可用于前列腺癌T分期的智能诊断,提高诊疗效率。
关键词
深度学习
前列腺癌
T分期诊断
分类
磁共振成像
Keywords
deep learning
prostate cancer
T stage diagnosis
classification
MRI
分类号
R319 [医药卫生—基础医学]
R730.42 [医药卫生—肿瘤]
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Vgg16-Unet模型的MRI图像下前列腺分区智能分割研究
呼延若曦
吴哲
许杉杉
崔慧林
曹锡梅
马晋锋
吴毅
顾玮
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于深度学习的MRI图像下前列腺癌T分期诊断研究
许杉杉
呼延若曦
吴哲
刘小兵
姚洁
崔慧林
马晋峰
吴毅
曹锡梅
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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