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云南山茶(Camellia reticulata)nrDNA ITS序列多态性分析
被引量:
13
1
作者
周阿涛
岳亮亮
+2 位作者
李旻
刘迪秋
丁元明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期1-10,共10页
对云南山茶(Camellia reticulata)8个品种的核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)进行克隆测序,将获得的ITS序列进行GC含量、5.8S区二级结构的稳定性、替代模式、核苷酸多样性及系统发育关系的相关分析。实验结果显示,云南山茶8个品种的...
对云南山茶(Camellia reticulata)8个品种的核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)进行克隆测序,将获得的ITS序列进行GC含量、5.8S区二级结构的稳定性、替代模式、核苷酸多样性及系统发育关系的相关分析。实验结果显示,云南山茶8个品种的ITS序列存在丰富的基因组内多态性,同时包含中性进化的假基因,表明其ITS序列逃离了一致性进化。云南山茶ITS序列多态性的原因可能来自广泛的种间杂交,以及rDNA位点在基因组中有不确定的物理位置。ITS假基因为品种的物种形成研究提供了更全面的遗传证据,同时也提示了利用ITS假基因进行系统发育分析可能会对其真实的系统关系造成影响。
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关键词
云南山茶
NRDNA
ITS
多态性
假基因
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职称材料
果实表达PGIPs的基因克隆及功能研究进展
被引量:
1
2
作者
周阿涛
刘迪秋
+3 位作者
葛锋
陈朝银
饶健
丁为群
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期14-18,共5页
多聚半乳糖醛酸酶(PGs)是病原真菌早期侵染植物的一个重要致病因子。多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIPs)作为植物防御蛋白,能特异性抑制真菌分泌的多聚半乳糖醛酸酶,并通过延长寡聚半乳糖醛酸(OGs)的稳定期激活植物防御反应。综述PGIPs在...
多聚半乳糖醛酸酶(PGs)是病原真菌早期侵染植物的一个重要致病因子。多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIPs)作为植物防御蛋白,能特异性抑制真菌分泌的多聚半乳糖醛酸酶,并通过延长寡聚半乳糖醛酸(OGs)的稳定期激活植物防御反应。综述PGIPs在植物细胞中的定位,PGIPs与PGs之间的作用方式,PGIPs基因的分离与克隆,以及PGIPs对果实感病的影响,并对PGIPs的研究前景进行展望。
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关键词
果实
PGIPs
PGS
基因
克隆
抑制
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职称材料
鱼类对重金属胁迫的分子反应机理
被引量:
10
3
作者
丁为群
刘迪秋
+3 位作者
葛锋
陈朝银
饶健
周阿涛
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2012年第2期84-87,共4页
水体中浓度超标的重金属对鱼类的正常生命活动产生了严重影响,甚至导致鱼类的死亡。鱼体受重金属离子胁迫时体内会产生一系列相关基因的表达变化,并合成相关的蛋白和酶,如热激蛋白、金属硫蛋白、转运铁蛋白、谷胱甘肽转移酶、过氧化氢...
水体中浓度超标的重金属对鱼类的正常生命活动产生了严重影响,甚至导致鱼类的死亡。鱼体受重金属离子胁迫时体内会产生一系列相关基因的表达变化,并合成相关的蛋白和酶,如热激蛋白、金属硫蛋白、转运铁蛋白、谷胱甘肽转移酶、过氧化氢酶、超氧化物歧化酶等以应对重金属对机体产生的危害。这是生物体对环境的一种应激保护性反应,是生物体对周围环境中过量重金属的一种防御性机制。通过鱼类在重金属胁迫下组织中相关基因的表达可以从分子水平上来阐述有毒物质对鱼体产生的影响。综述了重金属离子胁迫下鱼类机体的分子反应机理。
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关键词
重金属
分子机理
热激蛋白
金属硫蛋白
转运铁蛋白
抗氧化防御系统
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职称材料
山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析
被引量:
8
4
作者
尤欢
周阿涛
+2 位作者
岳亮亮
寸东义
丁元明
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期403-408,共6页
以山茶属(Camellia)植物为实验材料,通过在PCR反应液中加入二甲基亚砜(DMSO)来改进ITS区的扩增效果,并对获得的序列进行了相关的比较分析以及系统发育分析。分析结果表明:(1)PCR反应液中添加4%的DMSO能明显提高ITS的扩增效率,并能有效防...
以山茶属(Camellia)植物为实验材料,通过在PCR反应液中加入二甲基亚砜(DMSO)来改进ITS区的扩增效果,并对获得的序列进行了相关的比较分析以及系统发育分析。分析结果表明:(1)PCR反应液中添加4%的DMSO能明显提高ITS的扩增效率,并能有效防止ITS假基因的扩增;(2)与功能拷贝相比,ITS假基因序列的ITS1和ITS2区存在多处碱基缺失,GC含量明显偏低,5.8S区二级结构稳定性降低;(3)应用ITS假基因进行种水平的系统发育分析会对其真实的系统关系造成影响,提示进行系统进化研究时应警惕假基因的干扰。
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关键词
DMSO
ITS
山茶属
假基因
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职称材料
植物nrDNAITS假基因研究进展
被引量:
2
5
作者
尤欢
周阿涛
+3 位作者
岳亮亮
寸东义
李旻
丁元明
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期14-18,共5页
核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)被广泛应用于植物系统发育研究中。近年来,发现在很多植物类群中存在ITS假基因(pseudogenes),然而这些假基因在系统发育分析中的潜在价值往往被低估,甚至在部分研究中被忽略。主要介绍假基因的生成...
核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)被广泛应用于植物系统发育研究中。近年来,发现在很多植物类群中存在ITS假基因(pseudogenes),然而这些假基因在系统发育分析中的潜在价值往往被低估,甚至在部分研究中被忽略。主要介绍假基因的生成、特性以及ITS假基因在植物系统学中的应用,并对ITS假基因的研究前景进行展望。
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关键词
ITS
假基因
进化
系统分析
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职称材料
题名
云南山茶(Camellia reticulata)nrDNA ITS序列多态性分析
被引量:
13
1
作者
周阿涛
岳亮亮
李旻
刘迪秋
丁元明
机构
昆明理工大学生命科学与技术学院
云南出入境检验检疫局
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期1-10,共10页
基金
国家质检总局科技计划项目:云南出口花卉物种信息平台建立及分子生物学检测技术研究(2010IK273)
文摘
对云南山茶(Camellia reticulata)8个品种的核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)进行克隆测序,将获得的ITS序列进行GC含量、5.8S区二级结构的稳定性、替代模式、核苷酸多样性及系统发育关系的相关分析。实验结果显示,云南山茶8个品种的ITS序列存在丰富的基因组内多态性,同时包含中性进化的假基因,表明其ITS序列逃离了一致性进化。云南山茶ITS序列多态性的原因可能来自广泛的种间杂交,以及rDNA位点在基因组中有不确定的物理位置。ITS假基因为品种的物种形成研究提供了更全面的遗传证据,同时也提示了利用ITS假基因进行系统发育分析可能会对其真实的系统关系造成影响。
关键词
云南山茶
NRDNA
ITS
多态性
假基因
Keywords
Camellia reficulata
nrDNA ITS
Polymorphism
Pseudogenes
分类号
Q941.1 [生物学—植物学]
Q949.758.4 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
果实表达PGIPs的基因克隆及功能研究进展
被引量:
1
2
作者
周阿涛
刘迪秋
葛锋
陈朝银
饶健
丁为群
机构
昆明理工大学生命科学与技术学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期14-18,共5页
基金
云南省应用基础研究面上项目(2008ZC036M)
文摘
多聚半乳糖醛酸酶(PGs)是病原真菌早期侵染植物的一个重要致病因子。多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIPs)作为植物防御蛋白,能特异性抑制真菌分泌的多聚半乳糖醛酸酶,并通过延长寡聚半乳糖醛酸(OGs)的稳定期激活植物防御反应。综述PGIPs在植物细胞中的定位,PGIPs与PGs之间的作用方式,PGIPs基因的分离与克隆,以及PGIPs对果实感病的影响,并对PGIPs的研究前景进行展望。
关键词
果实
PGIPs
PGS
基因
克隆
抑制
Keywords
Fruit PGIPs PGs Gene Cloning Inhibit
分类号
S66 [农业科学—果树学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
鱼类对重金属胁迫的分子反应机理
被引量:
10
3
作者
丁为群
刘迪秋
葛锋
陈朝银
饶健
周阿涛
机构
昆明理工大学生命科学与技术学院
出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2012年第2期84-87,共4页
基金
云南省应用基础研究面上项目(2008ZC036M)
文摘
水体中浓度超标的重金属对鱼类的正常生命活动产生了严重影响,甚至导致鱼类的死亡。鱼体受重金属离子胁迫时体内会产生一系列相关基因的表达变化,并合成相关的蛋白和酶,如热激蛋白、金属硫蛋白、转运铁蛋白、谷胱甘肽转移酶、过氧化氢酶、超氧化物歧化酶等以应对重金属对机体产生的危害。这是生物体对环境的一种应激保护性反应,是生物体对周围环境中过量重金属的一种防御性机制。通过鱼类在重金属胁迫下组织中相关基因的表达可以从分子水平上来阐述有毒物质对鱼体产生的影响。综述了重金属离子胁迫下鱼类机体的分子反应机理。
关键词
重金属
分子机理
热激蛋白
金属硫蛋白
转运铁蛋白
抗氧化防御系统
Keywords
heavy metal
molecular mechanism
heat shock protein
metallothionein
transferrin
antioxidant defense system
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析
被引量:
8
4
作者
尤欢
周阿涛
岳亮亮
寸东义
丁元明
机构
云南农业大学植物保护学院
云南出入境检验检疫局
昆明理工大学生命科学与技术学院
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期403-408,共6页
基金
国家质检总局科技计划项目
云南出口花卉物种信息平台建立及分子生物学检测技术研究(2010IK273)
文摘
以山茶属(Camellia)植物为实验材料,通过在PCR反应液中加入二甲基亚砜(DMSO)来改进ITS区的扩增效果,并对获得的序列进行了相关的比较分析以及系统发育分析。分析结果表明:(1)PCR反应液中添加4%的DMSO能明显提高ITS的扩增效率,并能有效防止ITS假基因的扩增;(2)与功能拷贝相比,ITS假基因序列的ITS1和ITS2区存在多处碱基缺失,GC含量明显偏低,5.8S区二级结构稳定性降低;(3)应用ITS假基因进行种水平的系统发育分析会对其真实的系统关系造成影响,提示进行系统进化研究时应警惕假基因的干扰。
关键词
DMSO
ITS
山茶属
假基因
Keywords
DMSO
ITS
Camellia
pseudogene
分类号
S685.14 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
植物nrDNAITS假基因研究进展
被引量:
2
5
作者
尤欢
周阿涛
岳亮亮
寸东义
李旻
丁元明
机构
云南农业大学植物保护学院
云南出入境检验检疫局
昆明理工大学生命科学与技术学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期14-18,共5页
基金
国家质检总局科技计划项目(2010IK273)
文摘
核核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)被广泛应用于植物系统发育研究中。近年来,发现在很多植物类群中存在ITS假基因(pseudogenes),然而这些假基因在系统发育分析中的潜在价值往往被低估,甚至在部分研究中被忽略。主要介绍假基因的生成、特性以及ITS假基因在植物系统学中的应用,并对ITS假基因的研究前景进行展望。
关键词
ITS
假基因
进化
系统分析
Keywords
ITS Pseudogenes Evolution Phylogenetic analysis
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南山茶(Camellia reticulata)nrDNA ITS序列多态性分析
周阿涛
岳亮亮
李旻
刘迪秋
丁元明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
13
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职称材料
2
果实表达PGIPs的基因克隆及功能研究进展
周阿涛
刘迪秋
葛锋
陈朝银
饶健
丁为群
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
在线阅读
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职称材料
3
鱼类对重金属胁迫的分子反应机理
丁为群
刘迪秋
葛锋
陈朝银
饶健
周阿涛
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2012
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析
尤欢
周阿涛
岳亮亮
寸东义
丁元明
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2014
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
5
植物nrDNAITS假基因研究进展
尤欢
周阿涛
岳亮亮
寸东义
李旻
丁元明
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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职称材料
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