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向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析
被引量:
1
1
作者
王茜
周家燕
+5 位作者
王倩
邓玉萍
张敏慧
陈静
杨军
邹建
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期199-211,共13页
【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因,有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制,为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据,使用生物信息学方法,分析向日葵YABBY基因家族成...
【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因,有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制,为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据,使用生物信息学方法,分析向日葵YABBY基因家族成员的染色体定位、系统进化关系、基因结构、保守基序、蛋白结构及理化性质、启动子顺式作用元件和组织表达模式等,并通过RT-qPCR分析HaYABBY基因在WT向日葵和花分生组织决定和花器官分化缺陷突变体cb1中st2-st8时期的表达差异。【结果】在向日葵基因组中鉴定到12个YABBY基因家族成员,分属于4个亚家族,分布在8条染色体上,并且同一亚家族中成员在基因结构和保守基序组成上高度相似。其中8个基因HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5b、HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb在向日葵花发育时期特异性高表达。在这8个基因中,HaYABBY3、HaYABBY5a和HaYABBY5d在突变体cb1花发育后期表达上调,且与WT花发育早期水平相当;而HaYABBY4b和HaCRABS CLAWa在cb1中的表达被强烈抑制。顺式作用元件分析显示,HaYABBY均含有多个启动子顺式作用元件,部分元件仅存在于特定基因中。其中,胚乳表达元件存在于HaCRABS CLAWa和HaYABBY4a中;生长素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb、HaYABBY4a、HaYABBY4b和HaYABBY5c中;分生组织表达元件存在于HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY4b、HaYABBY5a和HaYABBY5d中;赤霉素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaYABBY5b、HaYABBY5c和HaYABBY5d中;种子特异性调控元件存在于HaYABBY5a、HaYABBY5c和HaYABBY5d中。【结论】HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5d和HaCRABS CLAWa等5个HaYABBY基因在花分生组织的转变和花器官发生过程中可能发挥重要作用,它们在花分生组织转变和花器官发生调控中可能受到生长素响应因子ARF、赤霉素响应因子MYB以及MADS-box等关键因子调节。
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关键词
向日葵
YABBY基因家族
花发育
花分生组织转变
花器官发生
基因表达
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职称材料
病区内清点污单与空气污染的关系
2
作者
胡玲
周家燕
+1 位作者
佘婷婷
张炳新
《护理研究》
2003年第09A期1026-1026,共1页
关键词
空气污染
病区内
污染床单
清点
菌落数
监测
医院感染
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职称材料
植物多基因干扰载体体系构建与效用分析
3
作者
周家燕
邹建
+6 位作者
陈卫英
吴一超
陈奚潼
王倩
曾文静
胡楠
杨军
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期115-126,共12页
多数重要的功能基因属于多基因家族,这些家族成员间存在功能冗余,高效的多基因干扰体系对研究多基因家族成员的生物学功能及其分子调控机制具有重要意义。对pCAMBIA1301载体改造,构建了适用于植物的多基因干扰体系pCAMBIA1301m和pCAMBIA...
多数重要的功能基因属于多基因家族,这些家族成员间存在功能冗余,高效的多基因干扰体系对研究多基因家族成员的生物学功能及其分子调控机制具有重要意义。对pCAMBIA1301载体改造,构建了适用于植物的多基因干扰体系pCAMBIA1301m和pCAMBIA1301s。使用该多基因干扰体系构建了四基因的干扰载体pCAMBIA1301m:35S∷SlPP2C1-2-3-4,4个目标基因为来源于番茄PP2C家族A组的PP2C1、PP2C2、PP2C3和PP2C4,并通过遗传转化导入番茄,用GUS染色和PCR检测转基因阳性植株,再利用RT-qPCR技术检测T_(1)和T_(2)代转基因植株中目标基因的干扰效率,用T_(2)代种子分析转基因番茄对ABA敏感性。结果表明,应用该干扰体系成功获得了四基因干扰的转基因植株35S∷SlPP2C1-2-3-4。在转基因番茄中4个目标基因的表达量显著低于野生型,其干扰效率均高于70%,转基因番茄种子萌发具有强烈的ABA不敏感性。多基因干扰体系能高效地同时沉默多个目标基因。
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关键词
番茄
RNAI
多基因干扰体系
遗传转化
ABA敏感性
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职称材料
题名
向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析
被引量:
1
1
作者
王茜
周家燕
王倩
邓玉萍
张敏慧
陈静
杨军
邹建
机构
西南野生动植物资源保护教育部重点实验室西华师范大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期199-211,共13页
基金
四川省自然科学基金项目(2023NSFSC0226,2022NSFSC0163)
作物发育与优良种质资源选育团队(KCXTD2023-7)。
文摘
【目的】鉴定向日葵中花发育相关的HaYABBY基因,有助于探究其在向日葵花发育过程中的生物学功能和调控机制,为向日葵品种选育提供重要的分子线索。【方法】基于向日葵基因组和转录组数据,使用生物信息学方法,分析向日葵YABBY基因家族成员的染色体定位、系统进化关系、基因结构、保守基序、蛋白结构及理化性质、启动子顺式作用元件和组织表达模式等,并通过RT-qPCR分析HaYABBY基因在WT向日葵和花分生组织决定和花器官分化缺陷突变体cb1中st2-st8时期的表达差异。【结果】在向日葵基因组中鉴定到12个YABBY基因家族成员,分属于4个亚家族,分布在8条染色体上,并且同一亚家族中成员在基因结构和保守基序组成上高度相似。其中8个基因HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5b、HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb在向日葵花发育时期特异性高表达。在这8个基因中,HaYABBY3、HaYABBY5a和HaYABBY5d在突变体cb1花发育后期表达上调,且与WT花发育早期水平相当;而HaYABBY4b和HaCRABS CLAWa在cb1中的表达被强烈抑制。顺式作用元件分析显示,HaYABBY均含有多个启动子顺式作用元件,部分元件仅存在于特定基因中。其中,胚乳表达元件存在于HaCRABS CLAWa和HaYABBY4a中;生长素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaCRABS CLAWb、HaYABBY4a、HaYABBY4b和HaYABBY5c中;分生组织表达元件存在于HaYABBY1a、HaYABBY1c、HaYABBY4b、HaYABBY5a和HaYABBY5d中;赤霉素响应元件存在于HaCRABS CLAWa、HaYABBY5b、HaYABBY5c和HaYABBY5d中;种子特异性调控元件存在于HaYABBY5a、HaYABBY5c和HaYABBY5d中。【结论】HaYABBY3、HaYABBY4b、HaYABBY5a、HaYABBY5d和HaCRABS CLAWa等5个HaYABBY基因在花分生组织的转变和花器官发生过程中可能发挥重要作用,它们在花分生组织转变和花器官发生调控中可能受到生长素响应因子ARF、赤霉素响应因子MYB以及MADS-box等关键因子调节。
关键词
向日葵
YABBY基因家族
花发育
花分生组织转变
花器官发生
基因表达
Keywords
sunflower
YABBY gene family
flower development
floral meristem transformation
floral organogenesis
gene expression
分类号
S565.5 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
病区内清点污单与空气污染的关系
2
作者
胡玲
周家燕
佘婷婷
张炳新
机构
安徽省立医院
出处
《护理研究》
2003年第09A期1026-1026,共1页
关键词
空气污染
病区内
污染床单
清点
菌落数
监测
医院感染
分类号
X831 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
植物多基因干扰载体体系构建与效用分析
3
作者
周家燕
邹建
陈卫英
吴一超
陈奚潼
王倩
曾文静
胡楠
杨军
机构
西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室
安阳工学院生物与食品工程学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期115-126,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31171587)
西华师范大学2018年博士科研启动专项(18Q039)
西华师范大学英才基金(17YC354)。
文摘
多数重要的功能基因属于多基因家族,这些家族成员间存在功能冗余,高效的多基因干扰体系对研究多基因家族成员的生物学功能及其分子调控机制具有重要意义。对pCAMBIA1301载体改造,构建了适用于植物的多基因干扰体系pCAMBIA1301m和pCAMBIA1301s。使用该多基因干扰体系构建了四基因的干扰载体pCAMBIA1301m:35S∷SlPP2C1-2-3-4,4个目标基因为来源于番茄PP2C家族A组的PP2C1、PP2C2、PP2C3和PP2C4,并通过遗传转化导入番茄,用GUS染色和PCR检测转基因阳性植株,再利用RT-qPCR技术检测T_(1)和T_(2)代转基因植株中目标基因的干扰效率,用T_(2)代种子分析转基因番茄对ABA敏感性。结果表明,应用该干扰体系成功获得了四基因干扰的转基因植株35S∷SlPP2C1-2-3-4。在转基因番茄中4个目标基因的表达量显著低于野生型,其干扰效率均高于70%,转基因番茄种子萌发具有强烈的ABA不敏感性。多基因干扰体系能高效地同时沉默多个目标基因。
关键词
番茄
RNAI
多基因干扰体系
遗传转化
ABA敏感性
Keywords
Solanum lycopersicum
RNAi
multi-gene interference system
genetic transformation
ABA sensitivity
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析
王茜
周家燕
王倩
邓玉萍
张敏慧
陈静
杨军
邹建
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
病区内清点污单与空气污染的关系
胡玲
周家燕
佘婷婷
张炳新
《护理研究》
2003
0
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职称材料
3
植物多基因干扰载体体系构建与效用分析
周家燕
邹建
陈卫英
吴一超
陈奚潼
王倩
曾文静
胡楠
杨军
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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