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1株多重耐药大肠杆菌噬菌体BP32的分离鉴定及生物学特性分析
被引量：
1
1
作者
吴静楠
李占鸿
+3 位作者
李富祥
张振兴
张以芳
宋建领
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期3540-3551,共12页
[目的]拟分离1株可裂解多重耐药大肠杆菌的噬菌体,明确其生物学特性及基因组特征。[方法]本研究从病死山羊肺脏组织中分离大肠杆菌,并通过药敏试验分析其耐药性。以大肠杆菌ER2738菌株为宿主菌,从养殖场污水中进行噬菌体的初步增殖,通...
[目的]拟分离1株可裂解多重耐药大肠杆菌的噬菌体,明确其生物学特性及基因组特征。[方法]本研究从病死山羊肺脏组织中分离大肠杆菌,并通过药敏试验分析其耐药性。以大肠杆菌ER2738菌株为宿主菌,从养殖场污水中进行噬菌体的初步增殖,通过点滴法确定分离噬菌体的宿主谱,采用双层琼脂平板法分离纯化特异性裂解大肠杆菌的噬菌体,进一步对其形态、最佳感染复数(MOI)、生长曲线、酸碱度和温度耐受性等生物学特性进行研究;通过高通量测序平台测定其全基因组序列,并对其基因组及遗传进化特征进行分析。[结果]从病死山羊肺脏中分离到1株多重耐药性大肠杆菌,命名为YNEC001。从养殖场污水中分离到1株可特异性裂解YNEC001菌株的噬菌体BP32,电镜观察显示噬菌体BP32属于肌尾科噬菌体,最佳MOI为0.1,潜伏期约为30 min,爆发期持续约60 min,裂解量约为660 PFU/cell,在30~50℃和pH 4.0~10.0条件下可保持稳定的活性。噬菌体BP32基因组长度为166346 bp,GC含量偏低(35.42%),未发现耐药基因和毒力因子,基因组共包含261个开放阅读框(ORF),其中125个为已知功能基因,含有8个tRNA。在全基因组水平上,噬菌体BP32与肠杆菌噬菌体Escherichia phage BF15(MW822007)核苷酸序列相似性最高(98.25%),但基于末端酶大亚基序列的进化分析则表明BP32与大肠杆菌噬菌体Escherichia phage vB_EcoM_SP1(MT682709)的亲缘关系最近,而与Escherichia phage BF15(MW822007)的关系较远。[结论]本研究分离到1株多重耐药大肠杆菌YNEC001,并分离到可特异性裂解YNEC001菌株的噬菌体BP32,该噬菌体具有较强的裂解能力和良好的稳定性,具备开发为耐药性大肠杆菌治疗制剂的潜力。
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关键词
多重耐药大肠杆菌
噬菌体
生物学特征
全基因组分析
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职称材料
猪流行性腹泻病毒云南省流行毒株S1基因序列分析
被引量：
3
2
作者
王鑫文
吴静楠
+6 位作者
郭红瑞
张松梅
邓成松
鲁金强
邹丰才
张以芳
柴俊
《中国动物检疫》
CAS
2022年第9期18-25,共8页
为深入了解云南省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行现状及现有疫苗株的保护效果,从2017—2022年云南省PEDV感染临床阳性样品中扩增出9份样品的PEDV S1基因,利用生物信息学方法,对9份样品S1基因进行了遗传...
为深入了解云南省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行现状及现有疫苗株的保护效果,从2017—2022年云南省PEDV感染临床阳性样品中扩增出9份样品的PEDV S1基因,利用生物信息学方法,对9份样品S1基因进行了遗传进化树构建、同源性分析和氨基酸突变位点分析等。结果显示:2份样品位于G1基因群,其余7份位于G2基因群的G2b基因亚群。7份G2b基因亚群样品的核苷酸和推导氨基酸同源性较高,与G2基因群的AJ1102和L/W/L疫苗株处于不同基因亚群且同源性较低,并在第13、139、289和363位发生了不一致的突变位点;与现有疫苗株相比,在抗原中和位点COE区域以及其他区域,有明显的抗原性变化。结果表明:云南省存在G1基因群和G2b基因亚群PEDV同时流行,但以G2b基因亚群为主;流行株和疫苗株间存在较远的遗传和亲缘关系,以及氨基酸突变和抗原性差异,这很可能是导致目前PED控制不理想的原因,因此需要研发安全有效的疫苗。
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关键词
猪流行性腹泻病毒
S1基因
序列分析
疫苗株
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职称材料
昆明地区某鸡场禽霍乱病原的分离鉴定及药敏试验
3
作者
马真明
赵应龙
+5 位作者
吴静楠
李锦
蔡懿琳
杨莎莎
张以芳
柴俊
《云南畜牧兽医》
2022年第4期1-2,共2页
采集昆明地区某鸡场疑似禽霍乱症状发病鸡的脏器及血液样品,进行细菌的分离培养、生化试验、PCR扩增、测序及序列同源性分析,确诊分离菌为巴氏杆菌。药敏试验表明分离菌对14种抗菌素高敏、7种抗菌素中敏、8种抗菌素有耐药性。为该鸡场...
采集昆明地区某鸡场疑似禽霍乱症状发病鸡的脏器及血液样品,进行细菌的分离培养、生化试验、PCR扩增、测序及序列同源性分析,确诊分离菌为巴氏杆菌。药敏试验表明分离菌对14种抗菌素高敏、7种抗菌素中敏、8种抗菌素有耐药性。为该鸡场禽霍乱的防控提供了依据。
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关键词
禽霍乱
巴氏杆菌
药敏试验
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职称材料
题名
1株多重耐药大肠杆菌噬菌体BP32的分离鉴定及生物学特性分析
被引量：
1
1
作者
吴静楠
李占鸿
李富祥
张振兴
张以芳
宋建领
机构
云南农业大学动物医学院
云南省畜牧兽医科学院热带亚热带动物病毒病重点实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期3540-3551,共12页
基金
云南省重大科技专项(202102AE090039)
创新引导与科技型企业培育计划(202304BI090001)。
文摘
[目的]拟分离1株可裂解多重耐药大肠杆菌的噬菌体,明确其生物学特性及基因组特征。[方法]本研究从病死山羊肺脏组织中分离大肠杆菌,并通过药敏试验分析其耐药性。以大肠杆菌ER2738菌株为宿主菌,从养殖场污水中进行噬菌体的初步增殖,通过点滴法确定分离噬菌体的宿主谱,采用双层琼脂平板法分离纯化特异性裂解大肠杆菌的噬菌体,进一步对其形态、最佳感染复数(MOI)、生长曲线、酸碱度和温度耐受性等生物学特性进行研究;通过高通量测序平台测定其全基因组序列,并对其基因组及遗传进化特征进行分析。[结果]从病死山羊肺脏中分离到1株多重耐药性大肠杆菌,命名为YNEC001。从养殖场污水中分离到1株可特异性裂解YNEC001菌株的噬菌体BP32,电镜观察显示噬菌体BP32属于肌尾科噬菌体,最佳MOI为0.1,潜伏期约为30 min,爆发期持续约60 min,裂解量约为660 PFU/cell,在30~50℃和pH 4.0~10.0条件下可保持稳定的活性。噬菌体BP32基因组长度为166346 bp,GC含量偏低(35.42%),未发现耐药基因和毒力因子,基因组共包含261个开放阅读框(ORF),其中125个为已知功能基因,含有8个tRNA。在全基因组水平上,噬菌体BP32与肠杆菌噬菌体Escherichia phage BF15(MW822007)核苷酸序列相似性最高(98.25%),但基于末端酶大亚基序列的进化分析则表明BP32与大肠杆菌噬菌体Escherichia phage vB_EcoM_SP1(MT682709)的亲缘关系最近,而与Escherichia phage BF15(MW822007)的关系较远。[结论]本研究分离到1株多重耐药大肠杆菌YNEC001,并分离到可特异性裂解YNEC001菌株的噬菌体BP32,该噬菌体具有较强的裂解能力和良好的稳定性,具备开发为耐药性大肠杆菌治疗制剂的潜力。
关键词
多重耐药大肠杆菌
噬菌体
生物学特征
全基因组分析
Keywords
multidrug-resistant Escherichia coli
phage
biological characteristics
whole genome analysis
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
猪流行性腹泻病毒云南省流行毒株S1基因序列分析
被引量：
3
2
作者
王鑫文
吴静楠
郭红瑞
张松梅
邓成松
鲁金强
邹丰才
张以芳
柴俊
机构
云南农业大学动物医学院
德宏州尚善品味农业有限公司
出处
《中国动物检疫》
CAS
2022年第9期18-25,共8页
基金
兽医公共卫生省创新团队项目(202105AE160014)
国家重点研发计划专项(2017YFD0500105)
云南农业大学德宏养瑞牛科技小院项目。
文摘
为深入了解云南省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行现状及现有疫苗株的保护效果,从2017—2022年云南省PEDV感染临床阳性样品中扩增出9份样品的PEDV S1基因,利用生物信息学方法,对9份样品S1基因进行了遗传进化树构建、同源性分析和氨基酸突变位点分析等。结果显示:2份样品位于G1基因群,其余7份位于G2基因群的G2b基因亚群。7份G2b基因亚群样品的核苷酸和推导氨基酸同源性较高,与G2基因群的AJ1102和L/W/L疫苗株处于不同基因亚群且同源性较低,并在第13、139、289和363位发生了不一致的突变位点;与现有疫苗株相比,在抗原中和位点COE区域以及其他区域,有明显的抗原性变化。结果表明:云南省存在G1基因群和G2b基因亚群PEDV同时流行,但以G2b基因亚群为主;流行株和疫苗株间存在较远的遗传和亲缘关系,以及氨基酸突变和抗原性差异,这很可能是导致目前PED控制不理想的原因,因此需要研发安全有效的疫苗。
关键词
猪流行性腹泻病毒
S1基因
序列分析
疫苗株
Keywords
PEDV
S1 gene
sequence analysis
vaccine strain
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
昆明地区某鸡场禽霍乱病原的分离鉴定及药敏试验
3
作者
马真明
赵应龙
吴静楠
李锦
蔡懿琳
杨莎莎
张以芳
柴俊
机构
寻甸县塘子街道办事处农业综合服务中心畜牧科
永平县杉阳镇农业综合服务中心畜牧兽医组
云南农业大学动物医学院
出处
《云南畜牧兽医》
2022年第4期1-2,共2页
文摘
采集昆明地区某鸡场疑似禽霍乱症状发病鸡的脏器及血液样品,进行细菌的分离培养、生化试验、PCR扩增、测序及序列同源性分析,确诊分离菌为巴氏杆菌。药敏试验表明分离菌对14种抗菌素高敏、7种抗菌素中敏、8种抗菌素有耐药性。为该鸡场禽霍乱的防控提供了依据。
关键词
禽霍乱
巴氏杆菌
药敏试验
分类号
S852.612 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
1株多重耐药大肠杆菌噬菌体BP32的分离鉴定及生物学特性分析
吴静楠
李占鸿
李富祥
张振兴
张以芳
宋建领
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
猪流行性腹泻病毒云南省流行毒株S1基因序列分析
王鑫文
吴静楠
郭红瑞
张松梅
邓成松
鲁金强
邹丰才
张以芳
柴俊
《中国动物检疫》
CAS
2022
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
昆明地区某鸡场禽霍乱病原的分离鉴定及药敏试验
马真明
赵应龙
吴静楠
李锦
蔡懿琳
杨莎莎
张以芳
柴俊
《云南畜牧兽医》
2022
0
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