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2011—2016年浙江省猪流行性腹泻病毒S基因与ORF3基因遗传进化分析
被引量:
13
1
作者
吴旺霞
王一成
+4 位作者
吴润
袁秀芳
徐丽华
李军星
苏菲
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第3期380-388,共9页
为调查近年来浙江省猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗株的S基因和ORF3基因遗传变异情况,2011—2016年,从浙江省各地区采集疑似猪流行性腹泻病料并提取其RNA,用3对特异性引物对S基因和ORF3基因进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化...
为调查近年来浙江省猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗株的S基因和ORF3基因遗传变异情况,2011—2016年,从浙江省各地区采集疑似猪流行性腹泻病料并提取其RNA,用3对特异性引物对S基因和ORF3基因进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化、遗传进化情况和抗原位点进行分析。结果表明:与国内疫苗株CV777相比,12个样品株的S基因存在15个核苷酸插入和6个核苷酸缺失,导致氨基酸序列存在5个氨基酸插入(^(58)QGVN^(61)和^(140)N)和2个氨基酸缺失(^(163)DI^(164)),且在主要突变区S1区的2个中和表位(499-638和764-771 aa)有8处氨基酸突变;样品株的ORF3基因有7处氨基酸变异。遗传进化分析结果显示,12株分离株的S基因与亚洲主要疫苗株(国内疫苗株CV777和韩国弱毒疫苗株DR13)的同源性仅为93.3%~94.9%,而与2011—2016年中国流行株(BJ-2011和Hu N)的同源性高达97.8%~99.9%,表明近年来猪流行性腹泻病毒呈现较大程度的变异,可为研制更加有效的疫苗奠定基础。
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关键词
猪流行性腹泻病毒
S基因
ORF3基因
序列特点
基因进化分析
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职称材料
iscR基因缺失对副猪嗜血杆菌荚膜多糖合成基因簇中部分相关基因表达的影响
被引量:
1
2
作者
江军
王一成
+4 位作者
姜平
李军星
袁秀芳
徐丽华
吴旺霞
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期771-775,共5页
为研究iscR基因对副猪嗜血杆菌(HPs)荚膜多糖(CPS)合成相关基因表达的影响,本研究利用荧光定量PCR方法检测野毒株(290A1-WT)和iscR基因缺失株(290A1-△iscR)内构成CPS基因簇相关基因funA、wbgY、capD、wza和funK的表达量变化;并利用透...
为研究iscR基因对副猪嗜血杆菌(HPs)荚膜多糖(CPS)合成相关基因表达的影响,本研究利用荧光定量PCR方法检测野毒株(290A1-WT)和iscR基因缺失株(290A1-△iscR)内构成CPS基因簇相关基因funA、wbgY、capD、wza和funK的表达量变化;并利用透射电镜观察两菌株体外培养和与猪血清作用后菌体表面荚膜的差异。结果显示:体外培养时,iscR基因缺失株wza的表达量一直高于野毒株的表达量,在OD_(600nm)值为0.2时差异显著(p<0.05),而capD在OD_(600nm)值为0.2时表达量显著降低(p<0.05);其他基因表达量无明显差异。当菌株与猪血清作用后,iscR基因缺失株中的capD、wza和funK的表达量均显著高于野毒株(p<0.05);在血清作用10 min时,funA的表达量显著低于野毒株(p<0.05);在血清作用20 min后,wbgY的表达量显著高于野毒株(p<0.05)。透射电镜结果显示,与血清作用前两菌株均无明显荚膜生成,与猪血清作用10 min后野毒株荚膜厚度达到100 nm,而iscR基因缺失株仍无明显荚膜生成,该结果说明iscR基因可能在一定程度上会促进HPs表面荚膜的生成。本研究结果为HPs CPS合成相关基因功能及其表达调控研究提供一些新的依据。
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关键词
副猪嗜血杆菌
荚膜多糖
iscR基因
基因表达
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职称材料
题名
2011—2016年浙江省猪流行性腹泻病毒S基因与ORF3基因遗传进化分析
被引量:
13
1
作者
吴旺霞
王一成
吴润
袁秀芳
徐丽华
李军星
苏菲
机构
甘肃农业大学动物医学院
浙江省农业科学院畜牧兽医研究所
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第3期380-388,共9页
基金
公益技术研究农业项目(2015C32028
2016C32072)
文摘
为调查近年来浙江省猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗株的S基因和ORF3基因遗传变异情况,2011—2016年,从浙江省各地区采集疑似猪流行性腹泻病料并提取其RNA,用3对特异性引物对S基因和ORF3基因进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化、遗传进化情况和抗原位点进行分析。结果表明:与国内疫苗株CV777相比,12个样品株的S基因存在15个核苷酸插入和6个核苷酸缺失,导致氨基酸序列存在5个氨基酸插入(^(58)QGVN^(61)和^(140)N)和2个氨基酸缺失(^(163)DI^(164)),且在主要突变区S1区的2个中和表位(499-638和764-771 aa)有8处氨基酸突变;样品株的ORF3基因有7处氨基酸变异。遗传进化分析结果显示,12株分离株的S基因与亚洲主要疫苗株(国内疫苗株CV777和韩国弱毒疫苗株DR13)的同源性仅为93.3%~94.9%,而与2011—2016年中国流行株(BJ-2011和Hu N)的同源性高达97.8%~99.9%,表明近年来猪流行性腹泻病毒呈现较大程度的变异,可为研制更加有效的疫苗奠定基础。
关键词
猪流行性腹泻病毒
S基因
ORF3基因
序列特点
基因进化分析
Keywords
Porcine epidemic diarrhea virus
S gene
ORF3 gene
sequence characteristics
genetic evolution analysis
分类号
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
iscR基因缺失对副猪嗜血杆菌荚膜多糖合成基因簇中部分相关基因表达的影响
被引量:
1
2
作者
江军
王一成
姜平
李军星
袁秀芳
徐丽华
吴旺霞
机构
南京农业大学动物医学学院
浙江省农业科学院畜牧兽医研究所
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期771-775,共5页
基金
国家自然科学基金(31201934)
浙江省农业科学院科技创新能力提升工程项目(2015CX13)
文摘
为研究iscR基因对副猪嗜血杆菌(HPs)荚膜多糖(CPS)合成相关基因表达的影响,本研究利用荧光定量PCR方法检测野毒株(290A1-WT)和iscR基因缺失株(290A1-△iscR)内构成CPS基因簇相关基因funA、wbgY、capD、wza和funK的表达量变化;并利用透射电镜观察两菌株体外培养和与猪血清作用后菌体表面荚膜的差异。结果显示:体外培养时,iscR基因缺失株wza的表达量一直高于野毒株的表达量,在OD_(600nm)值为0.2时差异显著(p<0.05),而capD在OD_(600nm)值为0.2时表达量显著降低(p<0.05);其他基因表达量无明显差异。当菌株与猪血清作用后,iscR基因缺失株中的capD、wza和funK的表达量均显著高于野毒株(p<0.05);在血清作用10 min时,funA的表达量显著低于野毒株(p<0.05);在血清作用20 min后,wbgY的表达量显著高于野毒株(p<0.05)。透射电镜结果显示,与血清作用前两菌株均无明显荚膜生成,与猪血清作用10 min后野毒株荚膜厚度达到100 nm,而iscR基因缺失株仍无明显荚膜生成,该结果说明iscR基因可能在一定程度上会促进HPs表面荚膜的生成。本研究结果为HPs CPS合成相关基因功能及其表达调控研究提供一些新的依据。
关键词
副猪嗜血杆菌
荚膜多糖
iscR基因
基因表达
Keywords
Haemophilus parasuis
capsular polysaccharide
iscR gene
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2011—2016年浙江省猪流行性腹泻病毒S基因与ORF3基因遗传进化分析
吴旺霞
王一成
吴润
袁秀芳
徐丽华
李军星
苏菲
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2017
13
在线阅读
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职称材料
2
iscR基因缺失对副猪嗜血杆菌荚膜多糖合成基因簇中部分相关基因表达的影响
江军
王一成
姜平
李军星
袁秀芳
徐丽华
吴旺霞
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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