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早期鼻咽癌基因甲基化谱的初步构建
被引量：
1
1
作者
叶宇东
王贤斌
邱前辉
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期925-931,共7页
【目的】分析早期鼻咽癌的基因甲基化状态,初步构建早期鼻咽癌的基因甲基化谱。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及炎性增生性鼻咽组织各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片(Nimble Gen)对两组标本进...
【目的】分析早期鼻咽癌的基因甲基化状态,初步构建早期鼻咽癌的基因甲基化谱。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及炎性增生性鼻咽组织各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片(Nimble Gen)对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因。【结果】4例鼻咽癌石蜡标本中均出现甲基化的基因数目为1 134个,而4例炎性增生性鼻咽组织中均出现甲基化的基因有2 091个,4例鼻咽癌标本全部发生甲基化但4例炎性增生性鼻咽组织全未发生甲基化的基因有218个,提示此218个基因可能为早期鼻咽癌患者的甲基化基因谱。另外,4例鼻咽癌标本全未发生甲基化而4例炎性增生性鼻咽组织全部发生甲基化的基因数目为1 558个。【结论】本研究初步构建了早期鼻咽癌的基因甲基化谱,为进一步建立更为精确的甲基化谱奠定了基础,同时也为寻找鼻咽癌新的分子标志物提供了可能。
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关键词
早期鼻咽癌
基因芯片
甲基化谱
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职称材料
多重MSP检测早期鼻咽癌甲基化基因的初步探索
2
作者
叶宇东
王贤斌
邱前辉
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2014年第24期3919-3921,共3页
目的:探讨多重MSP(multiplex-MSP)检测基因甲基化在鼻咽癌早期诊断中的作用。方法:通过MSP方法对35例Ⅰ期鼻咽癌标本18个基因的甲基化状态进行验证;同时通过条件摸索建立多重MSP方法,尝试实现多个基因甲基化状态的快速检测。结果:甲基...
目的:探讨多重MSP(multiplex-MSP)检测基因甲基化在鼻咽癌早期诊断中的作用。方法:通过MSP方法对35例Ⅰ期鼻咽癌标本18个基因的甲基化状态进行验证;同时通过条件摸索建立多重MSP方法,尝试实现多个基因甲基化状态的快速检测。结果:甲基化率超过50%的基因有12个;多重MSP检测中仅1组合的非甲基化特异性产物(U片段)扩增效果没有达到预期结果 ,余3个组合电泳结果与甲基化特异性PCR相符。结论:采取合适的组合进行多重MSP扩增可获得理想结果 ,其结果与MSP以及甲基化芯片扫描结果相似,是一种效率高,成本较低的实验方法。
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关键词
早期鼻咽癌
甲基化特异性PCR
多重MSP
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职称材料
鼻咽癌颈淋巴结转移相关甲基化基因的筛选
被引量：
1
3
作者
邹桂年
邱前辉
+1 位作者
叶宇东
严雪原
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期530-534,共5页
【目的】分析鼻咽癌全基因组基因甲基化状态,筛选鼻咽癌颈淋巴结转移相关的甲基化基因。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及有颈部淋巴结转移的鼻咽癌组织标本(T1-4N1-3M0)各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用...
【目的】分析鼻咽癌全基因组基因甲基化状态,筛选鼻咽癌颈淋巴结转移相关的甲基化基因。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及有颈部淋巴结转移的鼻咽癌组织标本(T1-4N1-3M0)各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因。【结果】Nimble Scan v2.5软件比较分析两组标本数据显示33个基因甲基化具有差异性,提示此33个基因可能为有颈部淋巴结转移鼻咽癌患者的甲基化基因谱。【结论】初步筛选鼻咽癌颈部淋巴结转移相关的33个甲基化基因,而DNA甲基化芯片是筛选异常甲基化基因的有效方法。
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关键词
鼻咽癌
淋巴结转移
基因
甲基化
基因芯片
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职称材料
题名
早期鼻咽癌基因甲基化谱的初步构建
被引量：
1
1
作者
叶宇东
王贤斌
邱前辉
机构
南方医科大学研究生学院
广东省人民医院∥广东省医学科学院耳鼻咽喉头颈外科
出处
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期925-931,共7页
基金
广州市科技计划项目(2011J4300067)
文摘
【目的】分析早期鼻咽癌的基因甲基化状态,初步构建早期鼻咽癌的基因甲基化谱。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及炎性增生性鼻咽组织各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片(Nimble Gen)对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因。【结果】4例鼻咽癌石蜡标本中均出现甲基化的基因数目为1 134个,而4例炎性增生性鼻咽组织中均出现甲基化的基因有2 091个,4例鼻咽癌标本全部发生甲基化但4例炎性增生性鼻咽组织全未发生甲基化的基因有218个,提示此218个基因可能为早期鼻咽癌患者的甲基化基因谱。另外,4例鼻咽癌标本全未发生甲基化而4例炎性增生性鼻咽组织全部发生甲基化的基因数目为1 558个。【结论】本研究初步构建了早期鼻咽癌的基因甲基化谱,为进一步建立更为精确的甲基化谱奠定了基础,同时也为寻找鼻咽癌新的分子标志物提供了可能。
关键词
早期鼻咽癌
基因芯片
甲基化谱
Keywords
early nasopharyngeal carcinoma
microarrays
methylation profile
分类号
R78 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
多重MSP检测早期鼻咽癌甲基化基因的初步探索
2
作者
叶宇东
王贤斌
邱前辉
机构
广东省人民医院(广东省医学科学院)耳鼻咽喉头颈外科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2014年第24期3919-3921,共3页
基金
广州市科技计划项目(编号:2011J4300067)
文摘
目的:探讨多重MSP(multiplex-MSP)检测基因甲基化在鼻咽癌早期诊断中的作用。方法:通过MSP方法对35例Ⅰ期鼻咽癌标本18个基因的甲基化状态进行验证;同时通过条件摸索建立多重MSP方法,尝试实现多个基因甲基化状态的快速检测。结果:甲基化率超过50%的基因有12个;多重MSP检测中仅1组合的非甲基化特异性产物(U片段)扩增效果没有达到预期结果 ,余3个组合电泳结果与甲基化特异性PCR相符。结论:采取合适的组合进行多重MSP扩增可获得理想结果 ,其结果与MSP以及甲基化芯片扫描结果相似,是一种效率高,成本较低的实验方法。
关键词
早期鼻咽癌
甲基化特异性PCR
多重MSP
Keywords
Early nasopharyngeal carcinoma
MSP
Multiplex-MSP
分类号
R739.63 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
鼻咽癌颈淋巴结转移相关甲基化基因的筛选
被引量：
1
3
作者
邹桂年
邱前辉
叶宇东
严雪原
机构
广东省龙川县人民医院耳鼻咽喉科
广东省人民医院//广东省医学科学院耳鼻咽喉头颈外科
广东省东莞大朗医院耳鼻咽喉科
出处
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期530-534,共5页
基金
中国癌症基金会项目(S2013014)
广东省医学科学技术研究基金项目(WSTJJ20131225440982197202101414)
文摘
【目的】分析鼻咽癌全基因组基因甲基化状态,筛选鼻咽癌颈淋巴结转移相关的甲基化基因。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及有颈部淋巴结转移的鼻咽癌组织标本(T1-4N1-3M0)各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因。【结果】Nimble Scan v2.5软件比较分析两组标本数据显示33个基因甲基化具有差异性,提示此33个基因可能为有颈部淋巴结转移鼻咽癌患者的甲基化基因谱。【结论】初步筛选鼻咽癌颈部淋巴结转移相关的33个甲基化基因,而DNA甲基化芯片是筛选异常甲基化基因的有效方法。
关键词
鼻咽癌
淋巴结转移
基因
甲基化
基因芯片
Keywords
nasopharyngeal carcinoma
lymph node metastasis
gene
methylation
DNA microarrays
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
早期鼻咽癌基因甲基化谱的初步构建
叶宇东
王贤斌
邱前辉
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
多重MSP检测早期鼻咽癌甲基化基因的初步探索
叶宇东
王贤斌
邱前辉
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2014
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
鼻咽癌颈淋巴结转移相关甲基化基因的筛选
邹桂年
邱前辉
叶宇东
严雪原
《中山大学学报（医学科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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职称材料
已选择
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引证文献
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