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睾丸酮丛毛单胞菌激素降解关键酶3,17β-HSD蛋白质相互作用研究
1
作者
于璇
史翔予
+2 位作者
赵艳阳
高乐
张昊
《长春理工大学学报(自然科学版)》
2024年第2期84-91,共8页
为研究睾丸酮丛毛单胞菌(Comamonas Testosteroni,C.T.)ATCC11996降解甾体类激素过程中关键蛋白质的相互作用关系,本文利用基因同源重组及移码突变原理构建睾丸酮降解关键酶3,17β-HSD基因敲除突变株,在回收率95%条件下高效液相检测野...
为研究睾丸酮丛毛单胞菌(Comamonas Testosteroni,C.T.)ATCC11996降解甾体类激素过程中关键蛋白质的相互作用关系,本文利用基因同源重组及移码突变原理构建睾丸酮降解关键酶3,17β-HSD基因敲除突变株,在回收率95%条件下高效液相检测野生株与突变株睾丸酮降解率,突变株对睾丸酮降解能力明显低于野生株;原核表达3,17β-HSD获得浓度2.4 mg/mL纯化蛋白,制备特异性鼠源多克隆抗体,ELISA检测抗体效价1∶320000;将多克隆抗体与经睾丸酮诱导的野生型C.T.细胞裂解液蛋白质复合物进行免疫共沉淀,质谱测定蛋白质相互作用组,结果表明短链脱氢酶SDRy(WP_003078287.1)为睾丸酮降解过程中关键酶3,17β-HSD的主要相互作用蛋白。
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关键词
睾丸酮丛毛单胞菌
甾体类激素降解
3
17β-HSD
免疫共沉淀
蛋白质相互作用
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职称材料
铜绿假单胞菌厌氧胁迫丙酮酸发酵维持生存相关基因研究
2
作者
于璇
安起弘
+2 位作者
史翔予
金秀妍
张昊
《长春理工大学学报(自然科学版)》
2024年第3期108-115,共8页
为深入研究铜绿假单胞菌响应厌氧丙酮酸发酵维持长期存活相关基因,采用同源重组蔗糖反向筛选构建P. aeruginosa PAO1广谱胁迫蛋白uspK敲除株ΔPA3309,在厌氧丙酮酸发酵条件下检测野生株与敲除株表型与基因型差异。细菌存活曲线、NADH/NA...
为深入研究铜绿假单胞菌响应厌氧丙酮酸发酵维持长期存活相关基因,采用同源重组蔗糖反向筛选构建P. aeruginosa PAO1广谱胁迫蛋白uspK敲除株ΔPA3309,在厌氧丙酮酸发酵条件下检测野生株与敲除株表型与基因型差异。细菌存活曲线、NADH/NADPH表型差异,表明敲除株在该条件下处于高能状态、代谢速率快、存活期短;转录组差异进一步印证野生株能量代谢、信号传导基因转录低于突变株,其TetR、LysR转录调节因子下调接近220,SDR氧化还原酶下调超过215,表明野生株可能通过UspK蛋白作用转录因子,进而下调氧化还原酶等能量代谢基因的转录与表达,控制细菌适应外部厌氧胁迫环境。
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关键词
铜绿假单胞菌
厌氧丙酮酸发酵
UspK
基因敲除
转录组
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职称材料
基于改进双向峰-谷搜索算法的煤矸模型电磁波正演模拟
3
作者
史翔予
司垒
+2 位作者
王忠宾
魏东
顾进恒
《工矿自动化》
CSCD
北大核心
2023年第10期87-95,共9页
实现放顶煤过程煤矸含量自动识别是综采自动化的重要目标,现有煤矸含量自动识别方法存在准确性、实时性较低等问题。放顶煤过程产生的煤矸混合物是由煤、矸石和空气形成的三相介质,各相介质的电性参数不同,在不同组分的混合三相介质中,...
实现放顶煤过程煤矸含量自动识别是综采自动化的重要目标,现有煤矸含量自动识别方法存在准确性、实时性较低等问题。放顶煤过程产生的煤矸混合物是由煤、矸石和空气形成的三相介质,各相介质的电性参数不同,在不同组分的混合三相介质中,电磁波的传播特性也不同。煤和矸石相对介电常数差异明显,通过研究不同含矸率煤矸混合物的电性参数,可为放顶煤工作面含矸率自动识别提供新的思路和方法。为了探究不同含矸率煤矸混合物的电性差异,提出了一种基于分治策略的双向峰-谷搜索算法,基于该算法建立了煤矸多相离散随机介质模型,基于麦克斯韦方程组及其本构关系方程,利用时域有限差分法对所建立的模型进行电磁波正演模拟。分析表明,基于分治策略改进双向峰-谷搜索算法后,煤矸多相离散随机介质模型中的煤、矸石、空气三相之间不仅存在明显的相界面,且各相离散程度更大,不存在聚集现象,因此局部介质也能体现整体的电性参数,能够满足电磁波正演的介质模型需求。正演模拟结果表明:(1)激励信号的频率会影响透射波的幅值,在12 GHz范围内,激励信号频率越高,透射波幅值越大;频率过低会降低信号的鲁棒性,激励频率应高于2 GHz。(2)煤矸混合物的含矸率与介质整体的等效介电常数呈正相关。含矸率越高,电磁波信号的传播损耗越多,接收平面接收到的信号幅值越小,电磁波信号穿透介质所用的时间越长。不同含矸率之间呈现明显的差异性,可以用作综采放顶煤含矸率识别的依据。
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关键词
放顶煤工作面
煤矸识别
含矸率
电磁波正演
分治策略
双向峰-谷搜索算法
多相离散随机介质模型
时域有限差分法
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职称材料
题名
睾丸酮丛毛单胞菌激素降解关键酶3,17β-HSD蛋白质相互作用研究
1
作者
于璇
史翔予
赵艳阳
高乐
张昊
机构
长春理工大学生命科学技术学院
出处
《长春理工大学学报(自然科学版)》
2024年第2期84-91,共8页
基金
吉林省科技发展计划项目(20220402038GH,20210101025JC)。
文摘
为研究睾丸酮丛毛单胞菌(Comamonas Testosteroni,C.T.)ATCC11996降解甾体类激素过程中关键蛋白质的相互作用关系,本文利用基因同源重组及移码突变原理构建睾丸酮降解关键酶3,17β-HSD基因敲除突变株,在回收率95%条件下高效液相检测野生株与突变株睾丸酮降解率,突变株对睾丸酮降解能力明显低于野生株;原核表达3,17β-HSD获得浓度2.4 mg/mL纯化蛋白,制备特异性鼠源多克隆抗体,ELISA检测抗体效价1∶320000;将多克隆抗体与经睾丸酮诱导的野生型C.T.细胞裂解液蛋白质复合物进行免疫共沉淀,质谱测定蛋白质相互作用组,结果表明短链脱氢酶SDRy(WP_003078287.1)为睾丸酮降解过程中关键酶3,17β-HSD的主要相互作用蛋白。
关键词
睾丸酮丛毛单胞菌
甾体类激素降解
3
17β-HSD
免疫共沉淀
蛋白质相互作用
Keywords
comamonas testosteroni
steroid degradation
3,17β-HSD
co-immunoprecipitation
protein-protein interaction
分类号
Q819 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
铜绿假单胞菌厌氧胁迫丙酮酸发酵维持生存相关基因研究
2
作者
于璇
安起弘
史翔予
金秀妍
张昊
机构
长春理工大学生命科学技术学院
出处
《长春理工大学学报(自然科学版)》
2024年第3期108-115,共8页
基金
吉林省科技发展计划项目(20220402038GH,20210101025JC)。
文摘
为深入研究铜绿假单胞菌响应厌氧丙酮酸发酵维持长期存活相关基因,采用同源重组蔗糖反向筛选构建P. aeruginosa PAO1广谱胁迫蛋白uspK敲除株ΔPA3309,在厌氧丙酮酸发酵条件下检测野生株与敲除株表型与基因型差异。细菌存活曲线、NADH/NADPH表型差异,表明敲除株在该条件下处于高能状态、代谢速率快、存活期短;转录组差异进一步印证野生株能量代谢、信号传导基因转录低于突变株,其TetR、LysR转录调节因子下调接近220,SDR氧化还原酶下调超过215,表明野生株可能通过UspK蛋白作用转录因子,进而下调氧化还原酶等能量代谢基因的转录与表达,控制细菌适应外部厌氧胁迫环境。
关键词
铜绿假单胞菌
厌氧丙酮酸发酵
UspK
基因敲除
转录组
Keywords
pseudomonas aeruginosa
anaerobic pyruvate fermentation
UspK
gene knockout
transcriptome
分类号
Q819 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
基于改进双向峰-谷搜索算法的煤矸模型电磁波正演模拟
3
作者
史翔予
司垒
王忠宾
魏东
顾进恒
机构
中国矿业大学机电工程学院
出处
《工矿自动化》
CSCD
北大核心
2023年第10期87-95,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(52074271)
江苏省自然科学基金面上项目(BK20211245)
江苏高校优势学科建设工程项目(苏政办发(2018)87号)。
文摘
实现放顶煤过程煤矸含量自动识别是综采自动化的重要目标,现有煤矸含量自动识别方法存在准确性、实时性较低等问题。放顶煤过程产生的煤矸混合物是由煤、矸石和空气形成的三相介质,各相介质的电性参数不同,在不同组分的混合三相介质中,电磁波的传播特性也不同。煤和矸石相对介电常数差异明显,通过研究不同含矸率煤矸混合物的电性参数,可为放顶煤工作面含矸率自动识别提供新的思路和方法。为了探究不同含矸率煤矸混合物的电性差异,提出了一种基于分治策略的双向峰-谷搜索算法,基于该算法建立了煤矸多相离散随机介质模型,基于麦克斯韦方程组及其本构关系方程,利用时域有限差分法对所建立的模型进行电磁波正演模拟。分析表明,基于分治策略改进双向峰-谷搜索算法后,煤矸多相离散随机介质模型中的煤、矸石、空气三相之间不仅存在明显的相界面,且各相离散程度更大,不存在聚集现象,因此局部介质也能体现整体的电性参数,能够满足电磁波正演的介质模型需求。正演模拟结果表明:(1)激励信号的频率会影响透射波的幅值,在12 GHz范围内,激励信号频率越高,透射波幅值越大;频率过低会降低信号的鲁棒性,激励频率应高于2 GHz。(2)煤矸混合物的含矸率与介质整体的等效介电常数呈正相关。含矸率越高,电磁波信号的传播损耗越多,接收平面接收到的信号幅值越小,电磁波信号穿透介质所用的时间越长。不同含矸率之间呈现明显的差异性,可以用作综采放顶煤含矸率识别的依据。
关键词
放顶煤工作面
煤矸识别
含矸率
电磁波正演
分治策略
双向峰-谷搜索算法
多相离散随机介质模型
时域有限差分法
Keywords
top coal caving working face
coal gangue recognition
gangue content
electromagnetic wave forward modeling
divide and conquer strategy
bidirectional peak-valley search algorithm
multiphase discrete random medium model
finite difference time domain method
分类号
TD679 [矿业工程—矿山机电]
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被引量
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1
睾丸酮丛毛单胞菌激素降解关键酶3,17β-HSD蛋白质相互作用研究
于璇
史翔予
赵艳阳
高乐
张昊
《长春理工大学学报(自然科学版)》
2024
0
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职称材料
2
铜绿假单胞菌厌氧胁迫丙酮酸发酵维持生存相关基因研究
于璇
安起弘
史翔予
金秀妍
张昊
《长春理工大学学报(自然科学版)》
2024
0
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职称材料
3
基于改进双向峰-谷搜索算法的煤矸模型电磁波正演模拟
史翔予
司垒
王忠宾
魏东
顾进恒
《工矿自动化》
CSCD
北大核心
2023
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