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银耳二型态编码MAPK关键差异基因的克隆及生物信息学分析
1
作者
徐涛
孔旭强
+4 位作者
占观平
陈雅芳
曹继璇
李亚星
孙淑静
《食药用菌》
2024年第1期31-39,共9页
银耳是我国特色的食用菌品种,其二型态转换与实际生产密切相关并制约着育种工作的进展,而丝裂原活化蛋白激酶(Mitogenactivatedproteinkinase,MAPK)途径在真菌二型态转换中具有重要调控作用。根据转录组测序数据克隆了银耳二型态编码MAP...
银耳是我国特色的食用菌品种,其二型态转换与实际生产密切相关并制约着育种工作的进展,而丝裂原活化蛋白激酶(Mitogenactivatedproteinkinase,MAPK)途径在真菌二型态转换中具有重要调控作用。根据转录组测序数据克隆了银耳二型态编码MAPK的关键差异基因,包括TfFus3基因、TfSlt2基因和Kss1基因。分析表明,TfFus3、TfSlt2、Kss1基因的基因组DNA序列全长分别为1721 bp、1865 bp、1903 bp,ORF序列全长分别为1191 bp、1281 bp、1149 bp,分别含有10、12、16个内含子,编码396、426、382个氨基酸,相对分子质量在43.61 kDa~48.15 kDa间,理论等电点在5.82~6.89。序列同源性分析表明,TfFus3、TfSlt2、Kss1基因所编码的氨基酸序列分别与Kwoniella dejecticola、K.imperatae、Tremalla mesenterica中同源蛋白的相似性最高。结构域分析表明,TfFus3、TfSlt2、Kss1蛋白都具有典型的蛋白激酶保守结构域且同属于PKc_likesuper family。本研究结果为进一步探究MAPK信号通路在银耳二型态转换中的作用奠定了基础。
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关键词
银耳
丝裂原活化蛋白激酶
二型态
生物信息学
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职称材料
题名
银耳二型态编码MAPK关键差异基因的克隆及生物信息学分析
1
作者
徐涛
孔旭强
占观平
陈雅芳
曹继璇
李亚星
孙淑静
机构
福建农林大学生命科学学院
出处
《食药用菌》
2024年第1期31-39,共9页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31801556)
福建省种业工程特色食用菌育种与产业化开发(zycxny2021011)
福建省食用菌现代农业产业体系。
文摘
银耳是我国特色的食用菌品种,其二型态转换与实际生产密切相关并制约着育种工作的进展,而丝裂原活化蛋白激酶(Mitogenactivatedproteinkinase,MAPK)途径在真菌二型态转换中具有重要调控作用。根据转录组测序数据克隆了银耳二型态编码MAPK的关键差异基因,包括TfFus3基因、TfSlt2基因和Kss1基因。分析表明,TfFus3、TfSlt2、Kss1基因的基因组DNA序列全长分别为1721 bp、1865 bp、1903 bp,ORF序列全长分别为1191 bp、1281 bp、1149 bp,分别含有10、12、16个内含子,编码396、426、382个氨基酸,相对分子质量在43.61 kDa~48.15 kDa间,理论等电点在5.82~6.89。序列同源性分析表明,TfFus3、TfSlt2、Kss1基因所编码的氨基酸序列分别与Kwoniella dejecticola、K.imperatae、Tremalla mesenterica中同源蛋白的相似性最高。结构域分析表明,TfFus3、TfSlt2、Kss1蛋白都具有典型的蛋白激酶保守结构域且同属于PKc_likesuper family。本研究结果为进一步探究MAPK信号通路在银耳二型态转换中的作用奠定了基础。
关键词
银耳
丝裂原活化蛋白激酶
二型态
生物信息学
Keywords
Tremella tremella
Mitogen activated protein kinase
dimorphic
bioinformatics
分类号
S646 [农业科学—蔬菜学]
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作者
出处
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被引量
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1
银耳二型态编码MAPK关键差异基因的克隆及生物信息学分析
徐涛
孔旭强
占观平
陈雅芳
曹继璇
李亚星
孙淑静
《食药用菌》
2024
0
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