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枣GDPD甘露糖焦磷酸化酶基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
陈莹莹
赵智慧
+2 位作者
卜娇迪
赵锦
刘孟军
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期140-143,共4页
GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-D-mannose pyrophosphorylase,GMP)是植物As A生物合成的第一个关键酶,至今未见该基因在枣中的相关报道。本研究根据Gen Bank中登录的苹果、桃和草莓等植物GMP保守序列设计引物,采用同源克隆法,从"骏枣...
GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-D-mannose pyrophosphorylase,GMP)是植物As A生物合成的第一个关键酶,至今未见该基因在枣中的相关报道。本研究根据Gen Bank中登录的苹果、桃和草莓等植物GMP保守序列设计引物,采用同源克隆法,从"骏枣"果实中克隆出该基因并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。该基因包含完整的开放阅读框为1086bp,编码361个氨基酸残基,预测蛋白分子量为39.588ku,理论p I值为7.12,命名为Zj GMP(登录号KJ934995);序列分析表明,枣GMP与桃、葡萄、草莓、苹果GMP的相似性分别为88%、87%、87%和87%。进化树分析表明,该基因与桃、苹果和草莓等植物的GMP亲缘关系较近。
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关键词
枣
GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶
基因克隆
生物信息学分析
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职称材料
题名
枣GDPD甘露糖焦磷酸化酶基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
陈莹莹
赵智慧
卜娇迪
赵锦
刘孟军
机构
河北农业大学中国枣研究中心
河北农业大学生命学院
出处
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期140-143,共4页
基金
国家科技支撑项目(2013BAD14B03)
河北省科技支撑计划(11230606D-6)
河北省青年拔尖人才计划
文摘
GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-D-mannose pyrophosphorylase,GMP)是植物As A生物合成的第一个关键酶,至今未见该基因在枣中的相关报道。本研究根据Gen Bank中登录的苹果、桃和草莓等植物GMP保守序列设计引物,采用同源克隆法,从"骏枣"果实中克隆出该基因并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。该基因包含完整的开放阅读框为1086bp,编码361个氨基酸残基,预测蛋白分子量为39.588ku,理论p I值为7.12,命名为Zj GMP(登录号KJ934995);序列分析表明,枣GMP与桃、葡萄、草莓、苹果GMP的相似性分别为88%、87%、87%和87%。进化树分析表明,该基因与桃、苹果和草莓等植物的GMP亲缘关系较近。
关键词
枣
GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶
基因克隆
生物信息学分析
Keywords
Ziziphus jujuba
GDP-D-mannose pyrophosphorylase
cloning
bioinformatic analysis
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
枣GDPD甘露糖焦磷酸化酶基因的克隆及生物信息学分析
陈莹莹
赵智慧
卜娇迪
赵锦
刘孟军
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
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