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基于转录组分析技术筛选骆驼产奶性状相关基因
1
作者
刘莉
李永青
+9 位作者
操礼军
马勤勤
李春芳
努尔扎提·瓦哈提
贾娜
梁春明
闫建勇
胡永青
胡波
祖农江·阿布拉
《草食家畜》
2025年第5期22-30,共9页
【目的】产奶性状是骆驼重要的经济性状,但目前骆驼产奶性状的研究尚不充分,产奶相关遗传机制的研究也鲜有报道。基于此,本研究计划通过转录组分析技术,深入挖掘骆驼产奶性状相关基因,以期为高产骆驼品种的选育工作提供数据支持。【方...
【目的】产奶性状是骆驼重要的经济性状,但目前骆驼产奶性状的研究尚不充分,产奶相关遗传机制的研究也鲜有报道。基于此,本研究计划通过转录组分析技术,深入挖掘骆驼产奶性状相关基因,以期为高产骆驼品种的选育工作提供数据支持。【方法】统一采集泌乳阶段骆驼的产奶量数据,将骆驼分为高产和低产组,并采集骆驼的血液进行转录组测序。【结果】通过对转录组数据进行统计分析,共筛选1893个差异表达基因(FDR<0.05),1094个(57.80%)基因显著上调,799个(42.20%)基因显著下调。基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析表明,分别有398条富集到生物过程(Biological process,BP),98条富集到细胞组分(Cellular Component,CC),260条富集到分子功能(Molecular function,MF)。京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析显示,主要富集到NOD样受体信号通路(NOD-like receptor signaling pathway)、TNF信号通路(Tumor Necrosis Factor signaling pathway)、T细胞通路(T lymphocyte signaling pathway)、溶酶体(Lysosome Cellular)、细胞衰老(Cellular senescence)、金黄色葡萄球菌感染(Staphylococcus aureus infection),以及细胞分化(Osteoclast differentiation)等相关信号通路。【结论】通过转录组数据对比分析及基因功能注释,共筛选MAPK13、CCL5、AKT3、CFD、MAN2A1、CAMK2D,6个与乳腺发育和泌乳调控相关的候选基因。这些发现为未来研究高产骆驼的分子机制提供理论基础,有助于深入理解乳腺发育和泌乳机制的复杂调控网络。后续研究将重点验证这些基因的调控机制,并基于此优化骆驼繁殖策略,以实现高产骆驼的选育目标。
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关键词
骆驼
产奶
转录组
候选基因
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题名
基于转录组分析技术筛选骆驼产奶性状相关基因
1
作者
刘莉
李永青
操礼军
马勤勤
李春芳
努尔扎提·瓦哈提
贾娜
梁春明
闫建勇
胡永青
胡波
祖农江·阿布拉
机构
新疆维吾尔自治区畜牧科学院畜牧研究所
新疆维吾尔自治区畜牧科学院畜牧业质量标准研究所
河北省畜牧业协会
新疆维吾尔自治区畜牧科学院
新疆维吾尔自治区畜牧科学院兽医研究所
新疆维吾尔自治区畜牧科学院草业研究所
出处
《草食家畜》
2025年第5期22-30,共9页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2022D01B15)。
文摘
【目的】产奶性状是骆驼重要的经济性状,但目前骆驼产奶性状的研究尚不充分,产奶相关遗传机制的研究也鲜有报道。基于此,本研究计划通过转录组分析技术,深入挖掘骆驼产奶性状相关基因,以期为高产骆驼品种的选育工作提供数据支持。【方法】统一采集泌乳阶段骆驼的产奶量数据,将骆驼分为高产和低产组,并采集骆驼的血液进行转录组测序。【结果】通过对转录组数据进行统计分析,共筛选1893个差异表达基因(FDR<0.05),1094个(57.80%)基因显著上调,799个(42.20%)基因显著下调。基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析表明,分别有398条富集到生物过程(Biological process,BP),98条富集到细胞组分(Cellular Component,CC),260条富集到分子功能(Molecular function,MF)。京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析显示,主要富集到NOD样受体信号通路(NOD-like receptor signaling pathway)、TNF信号通路(Tumor Necrosis Factor signaling pathway)、T细胞通路(T lymphocyte signaling pathway)、溶酶体(Lysosome Cellular)、细胞衰老(Cellular senescence)、金黄色葡萄球菌感染(Staphylococcus aureus infection),以及细胞分化(Osteoclast differentiation)等相关信号通路。【结论】通过转录组数据对比分析及基因功能注释,共筛选MAPK13、CCL5、AKT3、CFD、MAN2A1、CAMK2D,6个与乳腺发育和泌乳调控相关的候选基因。这些发现为未来研究高产骆驼的分子机制提供理论基础,有助于深入理解乳腺发育和泌乳机制的复杂调控网络。后续研究将重点验证这些基因的调控机制,并基于此优化骆驼繁殖策略,以实现高产骆驼的选育目标。
关键词
骆驼
产奶
转录组
候选基因
Keywords
camel
lactation
transcriptome
candidate gene
分类号
S824 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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1
基于转录组分析技术筛选骆驼产奶性状相关基因
刘莉
李永青
操礼军
马勤勤
李春芳
努尔扎提·瓦哈提
贾娜
梁春明
闫建勇
胡永青
胡波
祖农江·阿布拉
《草食家畜》
2025
0
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