目的:采用网络药理学方法分析归芍生腺汤治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform...目的:采用网络药理学方法分析归芍生腺汤治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(abioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)数据库检索归芍生腺汤各味药的主要化学成分,并从TCMSP、传统中药集成数据库(traditional chinese medicine integrated database,TCMID)、SwissTargetPrediction等数据库获取主要化学成分的靶点信息。采用Cytoscape构建网络模型并进行网络分析,用STRING和RStudio软件进行靶点功能富集分析。通过AutoTools软件进行分子对接验证。结果:归芍生腺汤共12味中药,包含145个活性化合物、340个化合物预测靶点、105个化合物和疾病相关共同靶点,其中归芍生腺汤治疗CAG的关键基因有白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、信号转导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、缺氧可诱导因子1α((hypoxia-inducible factor 1-alpha,HIF-1α)和蛋白激酶B1(protein kinase B 1,AKT1)。富集分析提示归芍生腺汤是通过多通路、多靶点治疗CAG,其中包括PI3K-AKT、HIF-1、JAK-STAT等信号通路。分子对接结果表明归芍生腺汤活性化合物与IL-6、TNF、STAT3、EGFR、HIF-1α和AKT1关键靶点具有较高结合能力。结论:归芍生腺汤治疗CAG具有多成分、多靶点和多通路的药效特点,为其治疗提供新思路。展开更多
文摘目的:采用网络药理学方法分析归芍生腺汤治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(abioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)数据库检索归芍生腺汤各味药的主要化学成分,并从TCMSP、传统中药集成数据库(traditional chinese medicine integrated database,TCMID)、SwissTargetPrediction等数据库获取主要化学成分的靶点信息。采用Cytoscape构建网络模型并进行网络分析,用STRING和RStudio软件进行靶点功能富集分析。通过AutoTools软件进行分子对接验证。结果:归芍生腺汤共12味中药,包含145个活性化合物、340个化合物预测靶点、105个化合物和疾病相关共同靶点,其中归芍生腺汤治疗CAG的关键基因有白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、信号转导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、缺氧可诱导因子1α((hypoxia-inducible factor 1-alpha,HIF-1α)和蛋白激酶B1(protein kinase B 1,AKT1)。富集分析提示归芍生腺汤是通过多通路、多靶点治疗CAG,其中包括PI3K-AKT、HIF-1、JAK-STAT等信号通路。分子对接结果表明归芍生腺汤活性化合物与IL-6、TNF、STAT3、EGFR、HIF-1α和AKT1关键靶点具有较高结合能力。结论:归芍生腺汤治疗CAG具有多成分、多靶点和多通路的药效特点,为其治疗提供新思路。
