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题名金针菇三个锌簇转录因子鉴定与表达分析
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作者
黄千慧
魏仲阳
刘泰娇
戴宇松
张维瑞
谢宝贵
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机构
宁德师范学院
福建农林大学菌物研究中心
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出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2023年第5期1-8,共8页
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基金
福建省青年基金(2022J05272)
校人才引进基金(2021Y02)。
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文摘
采用生物信息学方法对金针菇(Flammulina filiformis)3个锌簇转录因子的基本性质、锌簇域和分子进化进行分析,并利用荧光定量PCR研究其在菌丝、原基、菌柄和菌盖中的表达模式。结果表明,Fvzcp1、Fvzcp2和Fvzcp3分布在不同染色体片段重叠群,分别含有9、14、10个外显子,编码序列(codingsequence,CDS)长度分别为2553、2634、1743bp,对应蛋白质FVZCP1、FVZCP2和FVZCP3的相对分子质量分别为93763.19、98333.89、64251.26,理论等电点分别为7.10、6.54、6.64,均为不稳定的疏水性蛋白质,亚细胞定位于细胞核;FVZCP1、FVZCP2和FVZCP3均具有典型的锌簇域,且其锌簇域类型不同。就表达量而言,与菌丝相比,Fvzcp1在原基和菌盖中较高,Fvzcp2在原基和菌柄中较高,Fvzcp3仅在菌柄中较高;3个基因在菌柄伸长区的表达量均显著高于非伸长区。
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关键词
锌簇蛋白
锌指蛋白
半胱氨酸
C6型
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Keywords
Zinc cluster protein
zinc finger protein
cysteine
C6 type
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分类号
S646.15
[农业科学—蔬菜学]
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