本研究首次对地处青藏高原地区的西宁的犬细小病毒分离株(命名为CPV-XN1)进行了VP2基因的克隆、测序,并与我国以及我国周边国家地区的流行株,以及参考株进行了核苷酸同源性比对和进化分析。VP2基因分子鉴定结果显示,该分离株为CPV-2b亚...本研究首次对地处青藏高原地区的西宁的犬细小病毒分离株(命名为CPV-XN1)进行了VP2基因的克隆、测序,并与我国以及我国周边国家地区的流行株,以及参考株进行了核苷酸同源性比对和进化分析。VP2基因分子鉴定结果显示,该分离株为CPV-2b亚型株,VP2基因核苷酸序列全长1755bp,蛋白长度为584个氨基酸,分子量大小约为64.58 k Da,VP2蛋白为稳定蛋白,总体亲水性较高,可溶于水,VP2蛋白的二级结构以无规则卷曲为主;VP2基因的T-B细胞共同表位为序列的97-105位点,其序列为ALDDTHAQI,位点286-294,序列为GLPPFLNSL。西宁分离株与我国各地区流行株的核苷酸序列同源性和氨基酸同源性均在99%以上;CPV-XN1分离株VP2基因氨基酸序列中的非同义突变位点有1处,在78位氨基酸处;VP2基因进化树分析发现:CPV-XN1分离株与CPV-2b北京分离株(KT162024)和CPV-2b兰州分离株(JQ268284)组成一个微小分支,并与其它CPV-2b分离株处于同一个大支上,从进化角度上鉴定此研究分离株应属CPV-2b株。因此,本实验对青海西宁CPV-XN1分离株的VP2基因抗原表位分析和系统进化的探讨结果,有望为我国CPV分子流行病学调查提供一定的数据参考依据。展开更多
文摘本研究首次对地处青藏高原地区的西宁的犬细小病毒分离株(命名为CPV-XN1)进行了VP2基因的克隆、测序,并与我国以及我国周边国家地区的流行株,以及参考株进行了核苷酸同源性比对和进化分析。VP2基因分子鉴定结果显示,该分离株为CPV-2b亚型株,VP2基因核苷酸序列全长1755bp,蛋白长度为584个氨基酸,分子量大小约为64.58 k Da,VP2蛋白为稳定蛋白,总体亲水性较高,可溶于水,VP2蛋白的二级结构以无规则卷曲为主;VP2基因的T-B细胞共同表位为序列的97-105位点,其序列为ALDDTHAQI,位点286-294,序列为GLPPFLNSL。西宁分离株与我国各地区流行株的核苷酸序列同源性和氨基酸同源性均在99%以上;CPV-XN1分离株VP2基因氨基酸序列中的非同义突变位点有1处,在78位氨基酸处;VP2基因进化树分析发现:CPV-XN1分离株与CPV-2b北京分离株(KT162024)和CPV-2b兰州分离株(JQ268284)组成一个微小分支,并与其它CPV-2b分离株处于同一个大支上,从进化角度上鉴定此研究分离株应属CPV-2b株。因此,本实验对青海西宁CPV-XN1分离株的VP2基因抗原表位分析和系统进化的探讨结果,有望为我国CPV分子流行病学调查提供一定的数据参考依据。
