目的前列腺癌是老年男性的常见恶性肿瘤之一,其最早和最常转移的部位之一是盆腔淋巴结。本文探究基质刚度对于前列腺癌淋巴管形成能力和侵袭转移能力的影响及分子机制。方法(1)回顾性研究本院收治的经根治性手术治疗的患者,探讨盆腔淋...目的前列腺癌是老年男性的常见恶性肿瘤之一,其最早和最常转移的部位之一是盆腔淋巴结。本文探究基质刚度对于前列腺癌淋巴管形成能力和侵袭转移能力的影响及分子机制。方法(1)回顾性研究本院收治的经根治性手术治疗的患者,探讨盆腔淋巴转移对于前列腺癌患者疾病复发和预后生存的影响;(2)应用剪切波弹性超声和原子力显微镜,检测淋巴转移阴性和阳性患者肿瘤组织的外部组织力学参数;(3)利用GEO2R筛选出差异表达基因,并通过String获得PPI关系及其中的关键基因,同时进行GO、KEGG、生存分析等。(4)配置不同硬度的聚丙烯酰胺水凝胶以模拟体内前列腺癌的组织刚度变化。结果(1)Kaplan-Meier曲线显示淋巴转移阳性患者的无复发生存期降低;(2)伴有淋巴转移的前列腺癌患者的组织基质刚度显著增加,伴随胶原纤维沉积。(3)通过GEO数据库筛选出差异基因,GO富集分析表明差异基因主要集中于力学信息传导和细胞外基质分布等,KEGG通路富集于P53信号通路等。(4)将细胞培养在具有不同刚度(15、40、70 k Pa)的聚丙烯酰胺水凝胶的表面,前列腺癌细胞在硬基质上培养时淋巴管生成和转移能力显著增加。结论基质刚度通过影响前列腺癌淋巴管生成而促进转移,为前列腺癌恶性生物学进展和治疗靶点选择提供新的思路和方向。展开更多
邻域保持嵌入(Neighborhood Preserving Embedding,NPE),作为局部线性嵌入(Locally Linear Embedding,LLE)的线性化版本,由于在映射前后保持了数据的局部几何结构并得到了原始数据的子空间描述,在模式识别领域具有较强的应用价值。但作...邻域保持嵌入(Neighborhood Preserving Embedding,NPE),作为局部线性嵌入(Locally Linear Embedding,LLE)的线性化版本,由于在映射前后保持了数据的局部几何结构并得到了原始数据的子空间描述,在模式识别领域具有较强的应用价值。但作为非监督处理算法,在具体的模式分类中有一定局限性,提出一种NPE的改进算法——半监督判别邻域嵌入(SSDNE)算法,引入标记后样本点的类别信息,并在正则项中引入样本的流形结构,最大化标记样本点的类间信息和类内信息。既增加了算法的辨别能力又减少了监督算法中对样本点进行全标记的工作量。在ORL和YaleB人脸库上的实验结果表明,改进的算法较PCA、LDA、LPP以及原保持近邻判别嵌入算法的识别性能有了较明显的改善。展开更多
文摘目的前列腺癌是老年男性的常见恶性肿瘤之一,其最早和最常转移的部位之一是盆腔淋巴结。本文探究基质刚度对于前列腺癌淋巴管形成能力和侵袭转移能力的影响及分子机制。方法(1)回顾性研究本院收治的经根治性手术治疗的患者,探讨盆腔淋巴转移对于前列腺癌患者疾病复发和预后生存的影响;(2)应用剪切波弹性超声和原子力显微镜,检测淋巴转移阴性和阳性患者肿瘤组织的外部组织力学参数;(3)利用GEO2R筛选出差异表达基因,并通过String获得PPI关系及其中的关键基因,同时进行GO、KEGG、生存分析等。(4)配置不同硬度的聚丙烯酰胺水凝胶以模拟体内前列腺癌的组织刚度变化。结果(1)Kaplan-Meier曲线显示淋巴转移阳性患者的无复发生存期降低;(2)伴有淋巴转移的前列腺癌患者的组织基质刚度显著增加,伴随胶原纤维沉积。(3)通过GEO数据库筛选出差异基因,GO富集分析表明差异基因主要集中于力学信息传导和细胞外基质分布等,KEGG通路富集于P53信号通路等。(4)将细胞培养在具有不同刚度(15、40、70 k Pa)的聚丙烯酰胺水凝胶的表面,前列腺癌细胞在硬基质上培养时淋巴管生成和转移能力显著增加。结论基质刚度通过影响前列腺癌淋巴管生成而促进转移,为前列腺癌恶性生物学进展和治疗靶点选择提供新的思路和方向。
文摘邻域保持嵌入(Neighborhood Preserving Embedding,NPE),作为局部线性嵌入(Locally Linear Embedding,LLE)的线性化版本,由于在映射前后保持了数据的局部几何结构并得到了原始数据的子空间描述,在模式识别领域具有较强的应用价值。但作为非监督处理算法,在具体的模式分类中有一定局限性,提出一种NPE的改进算法——半监督判别邻域嵌入(SSDNE)算法,引入标记后样本点的类别信息,并在正则项中引入样本的流形结构,最大化标记样本点的类间信息和类内信息。既增加了算法的辨别能力又减少了监督算法中对样本点进行全标记的工作量。在ORL和YaleB人脸库上的实验结果表明,改进的算法较PCA、LDA、LPP以及原保持近邻判别嵌入算法的识别性能有了较明显的改善。
