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基于ITS2序列鉴定中药材金沸草、旋覆花及其近缘混伪品 被引量:14
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作者 郭力城 胡志刚 +6 位作者 凃媛 张卫东 金慧子 孙伟 贺海波 马孝熙 黄必胜 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2014年第2期307-312,共6页
目的:应用ITS2序列鉴定中药材金沸草、旋覆花及其近缘种混伪品,以确保药材质量,保障临床安全用药。方法:通过对金沸草、旋覆花等药材的3个基原物种条叶旋覆花、旋覆花和欧亚旋覆花及其同属近缘物种进行DNA提取、PCR扩增ITS2序列并双向测... 目的:应用ITS2序列鉴定中药材金沸草、旋覆花及其近缘种混伪品,以确保药材质量,保障临床安全用药。方法:通过对金沸草、旋覆花等药材的3个基原物种条叶旋覆花、旋覆花和欧亚旋覆花及其同属近缘物种进行DNA提取、PCR扩增ITS2序列并双向测序,用CodonCode Aligner对测序峰图进行拼接后,用MEGA5.0软件进行相关数据分析,并构建NJ系统聚类树以直观反映鉴定结果。结果:各基原物种ITS2序列变异位点稳定,其种内平均K2P距离均远小于各自药材以及同属近缘混伪品的种间平均K2P距离;基于ITS2序列的NJ树可以将金沸草和旋覆花药材与同属其它近缘混伪品明显区分开。结论:ITS2序列可准确鉴别中药材金沸草和旋覆花及其同属近缘混伪品。 展开更多
关键词 金沸草 旋覆花 ITS2序列 鉴定 近缘物种
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远志药材及其混伪品的DNA条形码鉴定 被引量:13
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作者 马孝熙 任伟超 +6 位作者 孙伟 凃媛 张雅琴 宋明 于俊林 黎斌 陈士林 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2014年第8期1719-1724,共6页
目的:对中药材远志及其混伪品进行分子鉴定,保障药材质量及用药安全。方法:对46份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其psbA-trnH序列并双向测序,应用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图校对拼接,去除低质量区和引物区,得到p... 目的:对中药材远志及其混伪品进行分子鉴定,保障药材质量及用药安全。方法:对46份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其psbA-trnH序列并双向测序,应用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图校对拼接,去除低质量区和引物区,得到psbA-trnH序列,用MEGA 6.0对序列进行比对分析,基于K2P遗传距离构建系统聚类树。结果:通过相似性搜索法能准确鉴别远志及其混伪品,远志两个基原的种内最大K2P距离分别为0.004和0,均小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离(0.010和0.005),基于psbA-trnH序列的系统发育树可将远志药材及其混伪品明显区分开。结论:psbA-trnH序列能有效鉴别远志药材及其混伪品,为中药材的质量控制提供新方法。 展开更多
关键词 远志 psbA-trnH序列 DNA条形码 鉴定
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基于ITS2序列鉴定南北葶苈子药材及其混伪品 被引量:13
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作者 凃媛 赵博 +6 位作者 温放 孙伟 宋明 贺海波 胡志刚 郭力城 张秀桥 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2014年第2期288-294,共7页
目的:利用ITS2序列对多基原药材葶苈子及其混伪品进行分子鉴定,以保证药材质量及临床疗效。方法:提取46份葶苈子药材及其混伪品的DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列并双向测序,应用CodonCode Aligner v 4.25对测序峰图进行校... 目的:利用ITS2序列对多基原药材葶苈子及其混伪品进行分子鉴定,以保证药材质量及临床疗效。方法:提取46份葶苈子药材及其混伪品的DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列并双向测序,应用CodonCode Aligner v 4.25对测序峰图进行校对拼接,并去除低质量序列及引物区,得到ITS2序列。用MEGA 6.0软件计算物种种内和种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,分析变异位点并构建邻接(NJ)系统聚类树,综合应用相似性搜索法、最近距离法以及NJ系统发育树等进行鉴定分析。结果:葶苈子的基原植物播娘蒿和独行菜的种内最大K2P遗传距离分别为0.021和0.010,均小于其与混伪品之间的种间最小K2P遗传距离;NJ树结果显示播娘蒿和独行菜各自聚为一支,表现出良好的单系性,均可与混伪品明显区分开。结论:以上几种鉴定方法分析结果表明,ITS2序列能准确鉴别南北葶苈子药材与混伪品,为保障临床安全用药提供了新的技术手段。 展开更多
关键词 葶苈子 ITS2序列 鉴定 混伪品
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基于ITS2条形码序列鉴定中药材佩兰及其混伪品 被引量:8
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作者 邬兰 陈科力 +5 位作者 孙伟 胡志刚 凃媛 马孝熙 林韵涵 周红 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2013年第3期410-414,共5页
目的:对中药材佩兰及其混伪品进行ITS2条形码鉴定,以确保该药材的质量以及临床疗效。方法:提取佩兰的DNA,利用PCR技术扩增其ITS2序列,双向测序,所得序列经过CodonCodeAligner拼接后,用软件MEGA5进行相关数据分析,计算其种内、种间遗传距... 目的:对中药材佩兰及其混伪品进行ITS2条形码鉴定,以确保该药材的质量以及临床疗效。方法:提取佩兰的DNA,利用PCR技术扩增其ITS2序列,双向测序,所得序列经过CodonCodeAligner拼接后,用软件MEGA5进行相关数据分析,计算其种内、种间遗传距离,并构建系统发育树。结果:佩兰药材的ITS2序列长度为218 bp;佩兰种内最大K2P距离为0.009,与混伪品种间最小K2P距离为0.024。ITS2序列的NJ系统聚类树可明显区分佩兰药材及其混伪品,表现出良好的单系性。结论:ITS2条形码序列能够成功鉴定中药材佩兰与其混伪品,为保障临床安全用药提供了新的技术方法。 展开更多
关键词 佩兰 ITS2序列 鉴定 混伪品
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细小种子类毒性药材天仙子的DNA条形码鉴定 被引量:7
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作者 凃媛 熊超 +3 位作者 师玉华 明孟碟 胡志刚 黄必胜 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2014年第11期2337-2342,共6页
目的:毒性中药的误用滥用对人类健康造成了严重危害。本研究应用DNA条形码技术对细小种子类毒性药材天仙子及其混淆品进行鉴定,为中药材的安全使用提供保障。方法:使用试剂盒提取61份样本的总DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序... 目的:毒性中药的误用滥用对人类健康造成了严重危害。本研究应用DNA条形码技术对细小种子类毒性药材天仙子及其混淆品进行鉴定,为中药材的安全使用提供保障。方法:使用试剂盒提取61份样本的总DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列并双向测序,应用Codon Code Aligner v 4.25对测序峰图进行校对拼接,去除低质量序列及引物区获得ITS2序列。用MEGA 6.0软件计算物种种内和种间Kimura2-Parameter(K2P)遗传距离,分析变异位点并构建邻接(NJ)系统聚类树。结果:天仙子的基原植物莨菪种内最大K2P遗传距离为0.005,远小于其与混淆品之间的种间最小K2P遗传距离(0.360);NJ树结果显示莨菪独自聚为一支,表现出良好的单系性,与混淆品明显区分开。结论:ITS2序列能准确鉴别毒性药材天仙子及其混淆品,为保障临床用药的安全提供了有效的技术手段。 展开更多
关键词 天仙子 毒性药材 ITS2序列 鉴定
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