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松毛虫属部分地理种群COⅠ基因序列分析
被引量:
4
1
作者
冷海楠
迟德富
肖放
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第11期105-107,共3页
为了寻求松毛虫属昆虫分类的新方法,利用COⅠ基因为分子标记针对松毛虫属(Dendromilus)10个地理种群的昆虫进行了分子系统学的研究。结果表明,COⅠ序列中,共有248个变异位点、219个简约信息位点,A+T平均含量为71.5%,大部分碱基改变为颠...
为了寻求松毛虫属昆虫分类的新方法,利用COⅠ基因为分子标记针对松毛虫属(Dendromilus)10个地理种群的昆虫进行了分子系统学的研究。结果表明,COⅠ序列中,共有248个变异位点、219个简约信息位点,A+T平均含量为71.5%,大部分碱基改变为颠换。不同地理种群松毛虫的遗传距离为0.007~0.319,平均遗传距离为0.175。利用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最小进化法(ME)构建了系统发育树,系统树显示10个地理种群聚为2支:梓潼、长沙、古田、玉溪、石林、禄丰6个种群聚为1支;墨江、思茅、安宁、曲靖种群聚为1支。
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关键词
松毛虫属
COI基因
线粒体DNA
分子系统学
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职称材料
兴安落叶松SSR反应体系的建立与优化
被引量:
1
2
作者
冷海楠
张玉
+5 位作者
徐明仪
王丽媛
付晓玲
崔福星
杨立宾
朱道光
《林业科技》
2020年第1期12-14,共3页
采用L16(4^5)正交试验设计,对影响兴安落叶松SSR-PCR反应体系的主要因素(模板DNA、d NTPs、Mg^2+、Taq聚合酶浓度及引物浓度)进行了试验分析,其结果表明:兴安落叶松SSR-PCR体积为20μL的最佳反应体系是模板DNA用量50 ng、正反向引物浓...
采用L16(4^5)正交试验设计,对影响兴安落叶松SSR-PCR反应体系的主要因素(模板DNA、d NTPs、Mg^2+、Taq聚合酶浓度及引物浓度)进行了试验分析,其结果表明:兴安落叶松SSR-PCR体积为20μL的最佳反应体系是模板DNA用量50 ng、正反向引物浓度均为5μmol·L^-1、d NTPs浓度为2.5 mmol·L^-1、Mg^2+的浓度为2.5 mmol·L^-1、Taq聚合酶用量为1.0 U、最佳退火温度为60℃。试验所建立的反应体系可进一步用于兴安落叶松SSR遗传图谱构建、多样性分析、良种选育等方面的研究中。
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关键词
兴安落叶松
SSR-PCR
正交优化试验
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职称材料
小叶章组培快繁体系的研究
被引量:
2
3
作者
张玉
倪红伟
+2 位作者
隋心
徐明怡
冷海楠
《实验室研究与探索》
CAS
北大核心
2016年第8期47-51,共5页
以野生小叶章幼嫩茎段为外植体,研究MS对外植体生长的影响。通过正交试验设计,研究不同种类及浓度配比激素对丛生芽增殖和生根的影响。表明小叶章茎段用75%酒精消毒30 s,再经0.01 L汞溶液浸泡4 min的灭菌效果较好;茎段直接诱导不定芽的...
以野生小叶章幼嫩茎段为外植体,研究MS对外植体生长的影响。通过正交试验设计,研究不同种类及浓度配比激素对丛生芽增殖和生根的影响。表明小叶章茎段用75%酒精消毒30 s,再经0.01 L汞溶液浸泡4 min的灭菌效果较好;茎段直接诱导不定芽的最适宜培养基为MS+0.05 mg/L KT+1.0 mg/L 6-BA+0.1mg/L+TDZ 0.1 mg/L NAA,诱导率可达87.44%;最佳继代增殖培养基为MS+0.1mg/L KT+0.5 mg/L 6-BA+0.05 mg/L TDZ+0.1 mg/L NAA,增殖系数可达5.76;生根最适宜培养基为0.5MS+2.0 mg/L NAA,生根率为93.33%。
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关键词
小叶章
茎段
组织培养
快速繁殖
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职称材料
小叶章DNA甲基转移酶基因家族鉴定与分析
4
作者
张玉
徐明怡
+3 位作者
冷海楠
梁佳文
曹宏杰
王继丰
《种子》
北大核心
2023年第10期16-22,共7页
DNA甲基化是一种高度保守的表观遗传修饰,涉及许多生物过程,在植物界,胞嘧啶DNA甲基转移酶基因在一些植物物种中已被鉴定。本研究在全基因组水平上对小叶章中的DNA甲基转移酶基因进行鉴定和分析,结果在小叶章中鉴定了29种DNA甲基转移酶...
DNA甲基化是一种高度保守的表观遗传修饰,涉及许多生物过程,在植物界,胞嘧啶DNA甲基转移酶基因在一些植物物种中已被鉴定。本研究在全基因组水平上对小叶章中的DNA甲基转移酶基因进行鉴定和分析,结果在小叶章中鉴定了29种DNA甲基转移酶,分为四个亚家族,分别是DaMET、DaCMT、DaDRM和DaDNMT2。基于这些基因的保守结构域分析,DNA甲基转移酶在进化过程中发生了基因丢失和复制事件。在DNA甲基转移酶中发现了多个顺式作用元件,包括光响应、植物激素响应、胁迫响应和植物生长发育相关的元件。此外,还研究了不同生境(典型草甸、沼泽、沼泽化草甸)下DNA甲基转移酶的转录丰度,大多数DaMET基因在不同生境下的表达水平均显著下调,而2个DaDRM基因的转录丰度均显著诱导。
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关键词
小叶章
DMT基因家族
转录组分析
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职称材料
题名
松毛虫属部分地理种群COⅠ基因序列分析
被引量:
4
1
作者
冷海楠
迟德富
肖放
机构
东北林业大学
出处
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第11期105-107,共3页
基金
国家自然科学资金(31040016)
文摘
为了寻求松毛虫属昆虫分类的新方法,利用COⅠ基因为分子标记针对松毛虫属(Dendromilus)10个地理种群的昆虫进行了分子系统学的研究。结果表明,COⅠ序列中,共有248个变异位点、219个简约信息位点,A+T平均含量为71.5%,大部分碱基改变为颠换。不同地理种群松毛虫的遗传距离为0.007~0.319,平均遗传距离为0.175。利用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最小进化法(ME)构建了系统发育树,系统树显示10个地理种群聚为2支:梓潼、长沙、古田、玉溪、石林、禄丰6个种群聚为1支;墨江、思茅、安宁、曲靖种群聚为1支。
关键词
松毛虫属
COI基因
线粒体DNA
分子系统学
Keywords
Dendrolimus
COⅠ gene
Mitochondrial DNA
Molecular systematics
分类号
Q969.435.9 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
兴安落叶松SSR反应体系的建立与优化
被引量:
1
2
作者
冷海楠
张玉
徐明仪
王丽媛
付晓玲
崔福星
杨立宾
朱道光
机构
黑龙江省科学院自然与生态研究所湿地与生态保育国家地方联合工程实验室
出处
《林业科技》
2020年第1期12-14,共3页
基金
黑龙江省科学院青年创新基金面上项目(CXMS2018ZR03)
国家自然科学基金青年基金项目(31700424)
文摘
采用L16(4^5)正交试验设计,对影响兴安落叶松SSR-PCR反应体系的主要因素(模板DNA、d NTPs、Mg^2+、Taq聚合酶浓度及引物浓度)进行了试验分析,其结果表明:兴安落叶松SSR-PCR体积为20μL的最佳反应体系是模板DNA用量50 ng、正反向引物浓度均为5μmol·L^-1、d NTPs浓度为2.5 mmol·L^-1、Mg^2+的浓度为2.5 mmol·L^-1、Taq聚合酶用量为1.0 U、最佳退火温度为60℃。试验所建立的反应体系可进一步用于兴安落叶松SSR遗传图谱构建、多样性分析、良种选育等方面的研究中。
关键词
兴安落叶松
SSR-PCR
正交优化试验
Keywords
Larix gmelinii
SSR-PCR
Orthogonal optimization test
分类号
S791.222 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
小叶章组培快繁体系的研究
被引量:
2
3
作者
张玉
倪红伟
隋心
徐明怡
冷海楠
机构
黑龙江省科学院自然与生态研究所
东北林业大学
出处
《实验室研究与探索》
CAS
北大核心
2016年第8期47-51,共5页
基金
国家自然科学基金项目(No.31470019)
黑龙江省财政应用技术专项(STJB16-01)
黑龙江省科学院创新基金资助项目
文摘
以野生小叶章幼嫩茎段为外植体,研究MS对外植体生长的影响。通过正交试验设计,研究不同种类及浓度配比激素对丛生芽增殖和生根的影响。表明小叶章茎段用75%酒精消毒30 s,再经0.01 L汞溶液浸泡4 min的灭菌效果较好;茎段直接诱导不定芽的最适宜培养基为MS+0.05 mg/L KT+1.0 mg/L 6-BA+0.1mg/L+TDZ 0.1 mg/L NAA,诱导率可达87.44%;最佳继代增殖培养基为MS+0.1mg/L KT+0.5 mg/L 6-BA+0.05 mg/L TDZ+0.1 mg/L NAA,增殖系数可达5.76;生根最适宜培养基为0.5MS+2.0 mg/L NAA,生根率为93.33%。
关键词
小叶章
茎段
组织培养
快速繁殖
Keywords
Calamagrostis angustifolia
stems
tissue culture
rapid propagation
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
小叶章DNA甲基转移酶基因家族鉴定与分析
4
作者
张玉
徐明怡
冷海楠
梁佳文
曹宏杰
王继丰
机构
黑龙江省科学院自然与生态研究所
出处
《种子》
北大核心
2023年第10期16-22,共7页
基金
黑龙江省省属科研院所科研业务费项目(ZNQN2023ZR02)
黑龙江省科学院创新基金杰青项目(CXJQ2021ZR02)
+2 种基金
黑龙江省科学院双提雁阵特别计划项目(STYZ2023ZR01)
黑龙江省科学院科学研究基金项目(KY2020ZR06)
黑龙江省自然科学基金项目(LH2019C077)。
文摘
DNA甲基化是一种高度保守的表观遗传修饰,涉及许多生物过程,在植物界,胞嘧啶DNA甲基转移酶基因在一些植物物种中已被鉴定。本研究在全基因组水平上对小叶章中的DNA甲基转移酶基因进行鉴定和分析,结果在小叶章中鉴定了29种DNA甲基转移酶,分为四个亚家族,分别是DaMET、DaCMT、DaDRM和DaDNMT2。基于这些基因的保守结构域分析,DNA甲基转移酶在进化过程中发生了基因丢失和复制事件。在DNA甲基转移酶中发现了多个顺式作用元件,包括光响应、植物激素响应、胁迫响应和植物生长发育相关的元件。此外,还研究了不同生境(典型草甸、沼泽、沼泽化草甸)下DNA甲基转移酶的转录丰度,大多数DaMET基因在不同生境下的表达水平均显著下调,而2个DaDRM基因的转录丰度均显著诱导。
关键词
小叶章
DMT基因家族
转录组分析
Keywords
Deyeuxia angustifolia Kom.
DMT gene family
transcriptional analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
松毛虫属部分地理种群COⅠ基因序列分析
冷海楠
迟德富
肖放
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
兴安落叶松SSR反应体系的建立与优化
冷海楠
张玉
徐明仪
王丽媛
付晓玲
崔福星
杨立宾
朱道光
《林业科技》
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
小叶章组培快繁体系的研究
张玉
倪红伟
隋心
徐明怡
冷海楠
《实验室研究与探索》
CAS
北大核心
2016
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
小叶章DNA甲基转移酶基因家族鉴定与分析
张玉
徐明怡
冷海楠
梁佳文
曹宏杰
王继丰
《种子》
北大核心
2023
0
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职称材料
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